253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0942 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  100 
 
 
329 aa  650    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0843  TPR repeat-containing protein  63.87 
 
 
330 aa  374  1e-103  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1250  tetratricopeptide TPR_2  32.85 
 
 
345 aa  99.8  6e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.738804  normal  0.817659 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  47.83 
 
 
285 aa  61.2  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0287  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
217 aa  55.5  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0159  cytochrome c class I  31.52 
 
 
120 aa  55.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  37.31 
 
 
111 aa  55.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  41.25 
 
 
465 aa  55.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02410  general transcriptional repressor, putative  27.72 
 
 
1101 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0490  cytochrome c class I  31.07 
 
 
254 aa  53.9  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2412  cytochrome c class I  31.52 
 
 
120 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000673714  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE04270  conserved hypothetical protein  28.77 
 
 
870 aa  53.5  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3887  cytochrome c class I  38.89 
 
 
143 aa  53.1  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.389814 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0842  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 
201 aa  53.1  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  34.48 
 
 
698 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3765  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  31 
 
 
255 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1434  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  31 
 
 
255 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0832764  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1449  cytochrome c class I  31 
 
 
255 aa  52.4  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150697  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  31 
 
 
255 aa  52.4  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1618  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  31 
 
 
255 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.117912 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1546  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  31 
 
 
255 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  32.93 
 
 
436 aa  52  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1651  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  31 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1687  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  31 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.615326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1406  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome c subunit  31 
 
 
255 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.118842  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3005  cytochrome c class I  34.33 
 
 
110 aa  51.2  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000505825  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1580  menaquinol-cytochrome c reductase, cytochrome b/c subunit  31 
 
 
255 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1158  TPR repeat-containing protein  35.38 
 
 
315 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.804036  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  27.17 
 
 
560 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2714  cytochrome c, class I  36.71 
 
 
101 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.30061  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4604  protein kinase  35.23 
 
 
545 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  31.52 
 
 
4079 aa  50.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5303  cytochrome c-551  32.05 
 
 
107 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5653  cytochrome c-551  32.05 
 
 
107 aa  50.1  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.432356 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1206  TPR domain-containing protein  31.52 
 
 
240 aa  50.1  0.00006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.417505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3043  cytochrome c class I  27.87 
 
 
163 aa  50.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  31.48 
 
 
561 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  31.48 
 
 
561 aa  49.7  0.00007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0959  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
199 aa  49.7  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0378  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  34.12 
 
 
545 aa  49.7  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.579733  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 
927 aa  49.3  0.00008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1248  cytochrome c class I  25.86 
 
 
255 aa  49.3  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.254815  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2129  cytochrome c class I  38.46 
 
 
255 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000120589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5291  cytochrome c-551  33.33 
 
 
107 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5348  cytochrome c-551  33.33 
 
 
107 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3382  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  36.96 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.545776 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1919  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 
449 aa  48.9  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0296562  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1406  hypothetical protein  35.06 
 
 
291 aa  48.9  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3062  hypothetical protein  27.59 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0741  TPR repeat-containing protein  34.07 
 
 
191 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0251  cytochrome c class I  39.29 
 
 
274 aa  48.9  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 
395 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2377  gluconate 2-dehydrogenase acceptor subunit  36.96 
 
 
417 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105053  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  40.58 
 
 
532 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  40.58 
 
 
532 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  31.76 
 
 
1252 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  40.58 
 
 
532 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.21 
 
 
543 aa  47.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  28.93 
 
 
730 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3662  cytochrome c class I  40.85 
 
 
124 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1587  hypothetical protein  35.06 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2566  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  35.48 
 
 
415 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.79853  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  40.58 
 
 
531 aa  47.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  34.21 
 
 
810 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 
878 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  31.91 
 
 
576 aa  47.8  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1321  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  34.15 
 
 
425 aa  47.8  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 
562 aa  48.5  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1622  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 
254 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1526  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.84 
 
 
311 aa  48.5  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02270  peroxisome targeting sequence binding protein, putative  33.77 
 
 
799 aa  47.4  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.655025  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  31.45 
 
 
1138 aa  47.4  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  35.35 
 
 
192 aa  47.8  0.0003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3854  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.69 
 
 
292 aa  47.4  0.0003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3449  cytochrome c, class I  34.65 
 
 
428 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4042  polysaccharide deacetylase  30.53 
 
 
890 aa  47.4  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3724  cytochrome c-551  31.08 
 
 
112 aa  47.8  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0308  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
636 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  32.5 
 
 
1013 aa  47  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  40 
 
 
251 aa  47  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0856  sugar transporter superfamily protein  25.6 
 
 
198 aa  47  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  38.36 
 
 
97 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4277  TPR repeat-containing protein  33.72 
 
 
468 aa  47  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0190966  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  39.13 
 
 
532 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  34.41 
 
 
340 aa  47  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0384  TPR repeat-containing protein  30.95 
 
 
279 aa  47  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03488  polysaccharide deacetylase  36.67 
 
 
898 aa  46.6  0.0006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1875  TPR repeat-containing protein  30 
 
 
201 aa  46.6  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 
1276 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  32.95 
 
 
701 aa  46.6  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  32.23 
 
 
456 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  39.13 
 
 
535 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  39.13 
 
 
535 aa  46.6  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2403  tetratricopeptide TPR_4  32.93 
 
 
267 aa  46.2  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000143988  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66638  glucose repression mediator protein  30.61 
 
 
815 aa  46.2  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5370  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  32.1 
 
 
531 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.173213  normal  0.778162 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1983  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.19 
 
 
142 aa  46.2  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.325796 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  36.99 
 
 
97 aa  46.6  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 
366 aa  46.2  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  35.06 
 
 
762 aa  46.2  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>