15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE04270 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE04270  conserved hypothetical protein  100 
 
 
870 aa  1768    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03628  N-terminal acetyltransferase catalytic subunit (NAT1), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G11910)  35.68 
 
 
833 aa  426  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108078  normal  0.314019 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_21420  predicted protein  29.46 
 
 
743 aa  317  5e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73563  predicted protein  29.66 
 
 
782 aa  295  3e-78  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.560069  normal  0.314839 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48350  predicted protein  28.87 
 
 
882 aa  293  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.156647  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  26.95 
 
 
927 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0942  cytochrome c class I  28.77 
 
 
329 aa  53.5  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.240089 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  25.76 
 
 
878 aa  52  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  23.9 
 
 
465 aa  49.3  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 
4079 aa  46.6  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  23.88 
 
 
1094 aa  47  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.25 
 
 
810 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  22.5 
 
 
436 aa  46.2  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  27.14 
 
 
374 aa  45.8  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 
1069 aa  45.4  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>