206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1254 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_1254  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  334  2.9999999999999997e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2599  protein of unknown function UPF0066  46.5 
 
 		 158 aa  169  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273401  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0535  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  167  8e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.498449 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3831  protein of unknown function UPF0066  41.4 
 
 		 158 aa  154  4e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2324  hypothetical protein  40.15 
 
 		 321 aa  114  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0188345  normal  0.69843 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0709  hypothetical protein  51.89 
 
 		 178 aa  99  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.045832  normal  0.207854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0722  protein of unknown function UPF0066  50.94 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0604494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2198  hypothetical protein  44.55 
 
 		 163 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0682  protein of unknown function UPF0066  46.23 
 
 		 167 aa  85.5  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.225791  normal  0.354835 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0248  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E region  37.12 
 
 		 311 aa  84.7  4e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5557  protein of unknown function UPF0066  46.02 
 
 		 162 aa  83.6  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.233079  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1885  hypothetical protein  36.29 
 
 		 167 aa  82  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5324  hypothetical protein  46.23 
 
 		 162 aa  80.9  0.000000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0617685 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0453  hypothetical protein  43.4 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.276022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0258  hypothetical protein  42.31 
 
 		 163 aa  79.3  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1333  hypothetical protein  29.63 
 
 		 181 aa  77.8  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.481113  normal  0.0143479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4759  hypothetical protein  43 
 
 		 162 aa  77  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.637583  normal  0.317582 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2088  hypothetical protein  36.84 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2475  protein of unknown function UPF0066  39.66 
 
 		 294 aa  76.3  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0760  hypothetical protein  39.62 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000599137  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0512  hypothetical protein  34.01 
 
 		 151 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.140743  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0340  hypothetical protein  43.69 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.634355  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0736  hypothetical protein  39.62 
 
 		 143 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000191321  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1584  protein of unknown function UPF0066  39.09 
 
 		 166 aa  75.5  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.467198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1936  hypothetical protein  37.69 
 
 		 151 aa  75.1  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0341  protein of unknown function UPF0066  32.17 
 
 		 150 aa  74.7  0.0000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1228  protein of unknown function UPF0066  34.88 
 
 		 161 aa  73.9  0.0000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4617  protein of unknown function UPF0066  44 
 
 		 163 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.521313 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6400  protein of unknown function UPF0066  45 
 
 		 174 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3087  hypothetical protein  33.86 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.245386  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3317  hypothetical protein  45 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.524788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0222  hypothetical protein  37.38 
 
 		 240 aa  72.8  0.000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00354115  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3287  hypothetical protein  43.75 
 
 		 238 aa  72.8  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.231288  normal  0.0827717 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0464  hypothetical protein  41.12 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1328  hypothetical protein  33.9 
 
 		 180 aa  72.4  0.000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00949818  decreased coverage  0.00397758 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2065  hypothetical protein  36.36 
 
 		 241 aa  72.4  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.587882  normal  0.151601 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1466  hypothetical protein  35.85 
 
 		 182 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00269022  normal  0.108849 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00194  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.043388  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0189  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0457219  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0302  hypothetical protein  41.28 
 
 		 155 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00193  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0320479  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1562  protein of unknown function UPF0066  36.43 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1275  hypothetical protein  36.62 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.147453 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1519  hypothetical protein  35.85 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00122931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3407  protein of unknown function UPF0066  40 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000511594  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0207  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.9755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0470  hypothetical protein  33.82 
 
 		 166 aa  71.2  0.000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0817214  normal  0.048877 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0199  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0201514  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0270  hypothetical protein  29.93 
 
 		 160 aa  71.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.460305  normal  0.715932 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0202  hypothetical protein  40 
 
 		 235 aa  71.2  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000993842  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0281  hypothetical protein  41.75 
 
 		 246 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.236696 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0265  hypothetical protein  41.75 
 
 		 246 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.485834  normal  0.889458 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0265  hypothetical protein  41.75 
 
 		 246 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.391481  normal  0.222677 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0270  hypothetical protein  41.75 
 
 		 246 aa  70.5  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0768014 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0284  hypothetical protein  41.75 
 
 		 235 aa  70.5  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0219827  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0402  hypothetical protein  34.68 
 
 		 182 aa  70.5  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0760  hypothetical protein  42.06 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4082  protein of unknown function UPF0066  38.98 
 
 		 166 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2452  hypothetical protein  41 
 
 		 163 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0563  hypothetical protein  44.12 
 
 		 145 aa  70.5  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0507088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3464  hypothetical protein  39.05 
 
 		 235 aa  70.1  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0230966  normal  0.865335 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6838  protein of unknown function UPF0066  35.38 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0989  protein of unknown function UPF0066  31.54 
 
 		 164 aa  69.3  0.00000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000019612  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1839  protein of unknown function UPF0066  35.66 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000981628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0206  hypothetical protein  39.05 
 
 		 235 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0519396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0110  protein of unknown function UPF0066  42.99 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1388  hypothetical protein  35.2 
 
 		 133 aa  69.7  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108578  hitchhiker  0.00000533919 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3550  protein of unknown function UPF0066  42.06 
 
 		 153 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.410233  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1613  hypothetical protein  37.14 
 
 		 147 aa  68.9  0.00000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2362  regulator protein  39.32 
 
 		 237 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2195  hypothetical protein  32.17 
 
 		 138 aa  68.9  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000150123  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0733  hypothetical protein  41.75 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0409036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3119  hypothetical protein  30.52 
 
 		 157 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.322422  hitchhiker  0.0000104071 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2238  protein of unknown function UPF0066  45 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2344  protein of unknown function UPF0066  39.18 
 
 		 231 aa  68.2  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.183412  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1424  hypothetical protein  38.89 
 
 		 173 aa  68.6  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.292458  normal  0.69662 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1186  hypothetical protein  32.03 
 
 		 235 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2853  hypothetical protein  39.42 
 
 		 239 aa  68.6  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00329387  hitchhiker  0.000000086947 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1495  hypothetical protein  36.59 
 
 		 147 aa  68.2  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.524483  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3464  hypothetical protein  39.81 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3241  hypothetical protein  37.07 
 
 		 240 aa  68.2  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.488613  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0276  protein of unknown function UPF0066  36.19 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2860  hypothetical protein  35.04 
 
 		 256 aa  67.8  0.00000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.486739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4335  putative transcriptional regulator  31.95 
 
 		 156 aa  67.4  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.598505 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2206  hypothetical protein  29.87 
 
 		 157 aa  67.4  0.00000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.953877  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1550  protein of unknown function UPF0066  34.19 
 
 		 153 aa  67.4  0.00000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0545  protein of unknown function UPF0066  34.19 
 
 		 154 aa  67.4  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0449  hypothetical protein  33.87 
 
 		 127 aa  67  0.00000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.160137  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3384  hypothetical protein  32.28 
 
 		 152 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.208867  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1330  protein of unknown function UPF0066  34.78 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.143351  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1135  hypothetical protein  32.12 
 
 		 138 aa  67  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00122763  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0843  protein of unknown function UPF0066  40.4 
 
 		 235 aa  67  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000863698  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1440  hypothetical protein  36.84 
 
 		 241 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1968  hypothetical protein  32.59 
 
 		 155 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00329257  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0426  hypothetical protein  38.6 
 
 		 162 aa  67  0.0000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.088537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1700  hypothetical protein  34.97 
 
 		 160 aa  67  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.03303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2254  hypothetical protein  27.88 
 
 		 159 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0608346  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3409  hypothetical protein  39.39 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0939148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1092  hypothetical protein  39.39 
 
 		 235 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0867  hypothetical protein  38.38 
 
 		 153 aa  65.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>