97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1833 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3357  hypothetical protein  63.04 
 
 		 535 aa  672    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407832  normal  0.113673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1833  hypothetical protein  100 
 
 		 528 aa  1080    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000463008  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1741  hypothetical protein  59.72 
 
 		 559 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  24.8 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  28.79 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  25.51 
 
 		 443 aa  61.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4100  TolB domain-containing protein  28.57 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.417738  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  22.39 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4487  tolB domain protein  27.89 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 		 642 aa  57.8  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2083  copper amine oxidase-like  26.29 
 
 		 763 aa  57.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  23.27 
 
 		 316 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.86 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  22.69 
 
 		 445 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.1 
 
 		 1078 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.86 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  22.86 
 
 		 446 aa  55.8  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2339  TolB-like protein  23.24 
 
 		 415 aa  53.5  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000041462  normal  0.0677463 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4474  tolB domain protein  27.13 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0574619  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  24.41 
 
 		 428 aa  52.4  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  22.09 
 
 		 449 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4436  TolB domain-containing protein  25 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0898  TolB-like  25.24 
 
 		 432 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0861  copper amine oxidase domain protein  24.23 
 
 		 574 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.205471 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3662  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  28.12 
 
 		 621 aa  52.4  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0540328  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  22.27 
 
 		 442 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  41.25 
 
 		 441 aa  52  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  22.5 
 
 		 298 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  23.85 
 
 		 462 aa  50.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  23.72 
 
 		 969 aa  50.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  21.32 
 
 		 449 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0317  translocation protein TolB  24.69 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0520547  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.27 
 
 		 442 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0769  translocation protein TolB  24.69 
 
 		 431 aa  50.4  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.103724  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4089  TolB domain-containing protein  26.02 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00893899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4435  tolB domain protein  26.02 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0762  tolB domain protein  26.6 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00173882  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4251  TolB domain-containing protein  26.02 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4583  TolB domain-containing protein  26.02 
 
 		 410 aa  50.1  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  21.57 
 
 		 444 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0677  translocation protein TolB  24.69 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814489  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0328  translocation protein TolB  22.68 
 
 		 454 aa  50.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  26.67 
 
 		 416 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1017  translocation protein TolB  25.26 
 
 		 461 aa  50.1  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.609487  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0694  translocation protein TolB  24.69 
 
 		 431 aa  50.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.125399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25 
 
 		 717 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  22.22 
 
 		 438 aa  48.9  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01610  translocation protein TolB  23.95 
 
 		 442 aa  48.9  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4751  translocation protein TolB  21.49 
 
 		 450 aa  49.3  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  21.97 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  25.47 
 
 		 435 aa  48.5  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1397  translocation protein TolB  28.66 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000000187657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2868  translocation protein TolB  28.66 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000034107  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2956  translocation protein TolB  28.66 
 
 		 430 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000231645  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  20.61 
 
 		 656 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  23.92 
 
 		 656 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2538  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  25.33 
 
 		 611 aa  47.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1394  translocation protein TolB  29.22 
 
 		 442 aa  47.8  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000203609  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  27.69 
 
 		 443 aa  47.8  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  21.37 
 
 		 444 aa  47.4  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  24.68 
 
 		 567 aa  47.4  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3512  translocation protein TolB  20.95 
 
 		 450 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2717  translocation protein TolB  20.55 
 
 		 450 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.599754  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4202  hypothetical protein  24.87 
 
 		 412 aa  47.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2564  translocation protein TolB  26.71 
 
 		 440 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000866572  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2086  translocation protein TolB  26.8 
 
 		 441 aa  46.6  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000540509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1039  WD40 domain-containing protein  26.23 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3889  translocation protein TolB  24.28 
 
 		 431 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.53422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003913  TolB protein precursor  26.72 
 
 		 442 aa  46.2  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.26371  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  30.66 
 
 		 435 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  21.85 
 
 		 440 aa  45.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  26.03 
 
 		 441 aa  45.8  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  22.54 
 
 		 430 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4812  hypothetical protein  28.32 
 
 		 362 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  23.72 
 
 		 642 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0242  translocation protein TolB  21.69 
 
 		 428 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3362  hypothetical protein  29.03 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00117978  normal  0.0179726 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  31.53 
 
 		 615 aa  46.2  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  23.91 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1279  WD40 domain-containing protein  29.01 
 
 		 428 aa  45.1  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02684  translocation protein TolB  27.89 
 
 		 451 aa  45.4  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0273488  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2194  translocation protein TolB  22.92 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.246481  normal  0.294233 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0590  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV subunit  23.36 
 
 		 590 aa  45.4  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1709  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  22.46 
 
 		 594 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  26.59 
 
 		 435 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2939  translocation protein TolB  21.32 
 
 		 451 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00432408  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0735  translocation protein TolB  23.44 
 
 		 432 aa  45.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.9087  normal  0.380909 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  20.08 
 
 		 667 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0218  hypothetical protein  27.36 
 
 		 414 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.412938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  32.77 
 
 		 453 aa  45.1  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0926  peptidase S41  24.82 
 
 		 1075 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  22.16 
 
 		 427 aa  43.9  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  20.65 
 
 		 292 aa  43.9  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1438  hypothetical protein  25.38 
 
 		 698 aa  43.9  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.466949  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  23.04 
 
 		 434 aa  43.5  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2274  Acylaminoacyl-peptidase  24.89 
 
 		 632 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0474921  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0727  TolB domain-containing protein  22.8 
 
 		 437 aa  43.5  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.162759  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>