51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1741 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_1741  hypothetical protein  100 
 
 		 559 aa  1148    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1833  hypothetical protein  59.72 
 
 		 528 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000463008  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3357  hypothetical protein  56.39 
 
 		 535 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407832  normal  0.113673 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4487  tolB domain protein  22.66 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4100  TolB domain-containing protein  22.66 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.417738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.35 
 
 		 407 aa  54.3  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  24.12 
 
 		 642 aa  53.5  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  23.33 
 
 		 656 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  25.4 
 
 		 656 aa  52.8  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4202  hypothetical protein  26.61 
 
 		 412 aa  50.4  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  23.33 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.04 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal  1 
 
 
 
NC_009720  Xaut_3056  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  26.12 
 
 		 450 aa  48.9  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0557578  normal  0.412166 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0762  tolB domain protein  23.24 
 
 		 410 aa  48.5  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00173882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  26.92 
 
 		 572 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4474  tolB domain protein  26.09 
 
 		 412 aa  47.8  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0574619  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  26.28 
 
 		 443 aa  47.4  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.55 
 
 		 407 aa  47.4  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  23.63 
 
 		 430 aa  47  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  22.12 
 
 		 969 aa  46.6  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  25.76 
 
 		 446 aa  47  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.89 
 
 		 446 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1644  amidohydrolase  24.48 
 
 		 1042 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0718903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5716  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  24.82 
 
 		 642 aa  47  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.76 
 
 		 446 aa  47  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4435  tolB domain protein  23.72 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1717  amidohydrolase  24.48 
 
 		 1040 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.654125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  20.88 
 
 		 667 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  27.46 
 
 		 567 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4436  TolB domain-containing protein  21.19 
 
 		 412 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4251  TolB domain-containing protein  23.72 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4089  TolB domain-containing protein  23.72 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00893899  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4583  TolB domain-containing protein  23.72 
 
 		 410 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2230  hypothetical protein  24.48 
 
 		 1042 aa  46.2  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.752909  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2150  hypothetical protein  27.97 
 
 		 344 aa  45.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.251795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  22.89 
 
 		 432 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0248  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.76 
 
 		 631 aa  45.4  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  21.2 
 
 		 444 aa  45.4  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4812  hypothetical protein  26.32 
 
 		 362 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  24.37 
 
 		 316 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0136  WD40 domain protein beta Propeller  23.68 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6881  translocation protein TolB  29.29 
 
 		 462 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0464057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.41 
 
 		 298 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  23.78 
 
 		 435 aa  44.3  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  25 
 
 		 434 aa  43.9  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  22.57 
 
 		 292 aa  43.9  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  28.26 
 
 		 441 aa  43.9  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.75 
 
 		 442 aa  43.5  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0009  amidohydrolase  24.72 
 
 		 1062 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  23.34 
 
 		 416 aa  43.5  0.01  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5294  peptidase S41  23.44 
 
 		 1167 aa  43.5  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>