31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3357 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3357  hypothetical protein  100 
 
 
535 aa  1093    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0407832  normal  0.113673 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1833  hypothetical protein  63.04 
 
 
528 aa  672    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000463008  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1741  hypothetical protein  56.39 
 
 
559 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4487  tolB domain protein  31.75 
 
 
410 aa  61.6  0.00000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4100  TolB domain-containing protein  27.42 
 
 
410 aa  60.1  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.417738  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4436  TolB domain-containing protein  26.49 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4474  tolB domain protein  27.83 
 
 
412 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0574619  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4251  TolB domain-containing protein  26.32 
 
 
410 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4089  TolB domain-containing protein  26.32 
 
 
410 aa  57  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00893899  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4435  tolB domain protein  26.32 
 
 
410 aa  57  0.0000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4583  TolB domain-containing protein  26.32 
 
 
410 aa  57  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2405  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  24.7 
 
 
1078 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.666802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0762  tolB domain protein  27.57 
 
 
410 aa  54.7  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00173882  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25 
 
 
298 aa  52.8  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4202  hypothetical protein  28.57 
 
 
412 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0629  peptidase S9B dipeptidylpeptidase IV domain protein  22.88 
 
 
1028 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1611  hypothetical protein  22.6 
 
 
656 aa  48.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0977  WD40 domain-containing protein  23.84 
 
 
316 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0467  TolB domain-containing protein  27.84 
 
 
450 aa  47.8  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.84052  normal  0.495381 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  22.17 
 
 
656 aa  47  0.0009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2397  WD40 domain-containing protein  22.55 
 
 
352 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000884296 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1914  WD40 domain protein beta Propeller  22.51 
 
 
1060 aa  45.8  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.657093  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0140  WD40 domain protein beta Propeller  21.96 
 
 
970 aa  45.4  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  32 
 
 
441 aa  45.1  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4155  transcriptional regulatory protein-like  25.24 
 
 
717 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.297616 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0393  translocation protein TolB  27.08 
 
 
451 aa  44.7  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  21.8 
 
 
442 aa  44.7  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2229  translocation protein TolB  25.34 
 
 
435 aa  44.3  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  23.13 
 
 
969 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  21.8 
 
 
442 aa  43.9  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  24.28 
 
 
430 aa  43.9  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>