253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4812 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4812  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  723    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2150  hypothetical protein  35.48 
 
 
344 aa  115  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.251795  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0025  tolB protein  28.72 
 
 
432 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0382531  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5302  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  30.66 
 
 
446 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.842711 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5227  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  29.72 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.175544  normal  0.115662 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4760  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  29.72 
 
 
446 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.577654  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0203  WD40 domain-containing protein  25.78 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000381605  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2975  TolB protein  25.33 
 
 
443 aa  67.4  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.508751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3933  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  25.41 
 
 
298 aa  67  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.560245 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3323  WD40 domain-containing protein  30.7 
 
 
435 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000401957  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3513  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.13 
 
 
407 aa  63.9  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000266488  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3540  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  23.64 
 
 
429 aa  63.2  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000000050948  normal 
 
 
 
NC_012918  GM21_3582  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.97 
 
 
407 aa  63.2  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2206  translocation protein TolB  26.76 
 
 
427 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00281817 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  23.34 
 
 
646 aa  62  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4436  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  34.29 
 
 
442 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.314306  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3387  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  33.57 
 
 
442 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.413738  normal  0.777637 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2178  WD-40-like beta propeller repeat-containing protein  24.16 
 
 
292 aa  60.5  0.00000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.1 
 
 
567 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0744  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  32.37 
 
 
445 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.950557  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2899  TolB domain-containing protein  28.89 
 
 
469 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000201302  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3470  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  26.21 
 
 
430 aa  59.3  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0247936  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1577  serine/threonine protein kinase  38.53 
 
 
969 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.713812 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1154  WD40-like beta propeller protein  22.85 
 
 
416 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0133  WD40 domain protein beta Propeller  24.49 
 
 
445 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  23.84 
 
 
615 aa  58.2  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0948  serine/threonine protein kinase  35.71 
 
 
734 aa  58.2  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.21638 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3949  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.59 
 
 
716 aa  58.2  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.782575  normal  0.167111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0745  amidohydrolase  33.59 
 
 
1005 aa  57.8  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  37.5 
 
 
642 aa  57.8  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2952  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  25.18 
 
 
695 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.232589 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1853  translocation protein TolB  27.1 
 
 
428 aa  56.6  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03155  Acylaminoacyl-peptidase  25.17 
 
 
685 aa  56.2  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3993  translocation protein TolB  23.85 
 
 
423 aa  56.2  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.213865  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0145  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.41 
 
 
704 aa  56.2  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0880846 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4427  translocation protein TolB  31.03 
 
 
441 aa  56.2  0.0000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.500534 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0392  WD40-like beta propeller protein  27.56 
 
 
354 aa  55.5  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1222  translocation protein TolB  24.37 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1910  TolB protein, putative  24.48 
 
 
440 aa  55.1  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0592  TolB-like protein  25.98 
 
 
438 aa  54.7  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1711  WD40 domain protein beta Propeller  22.26 
 
 
444 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000750977  decreased coverage  0.0000915698 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0755  TolB domain-containing protein  25.81 
 
 
457 aa  55.1  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.242927  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2210  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  24.91 
 
 
438 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000769838  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4196  translocation protein TolB  23.85 
 
 
423 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1251  translocation protein TolB  24.37 
 
 
423 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0936092  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0747  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.18 
 
 
444 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000257607  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0068  Tol-Pal system beta propeller repeat protein TolB  25.36 
 
 
422 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1218  translocation protein TolB  31.03 
 
 
443 aa  54.3  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27228  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0067  tol-pal system beta propeller repeat protein TolB  25.36 
 
 
422 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.518188  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2122  beta-propeller repeat-containing to-pal system protein TolB  34.78 
 
 
446 aa  54.3  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.256883  normal  0.227077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  28.67 
 
 
572 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6131  peptidase S9 prolyl oligopeptidase active site domain protein  32.98 
 
 
667 aa  53.9  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0015  amidohydrolase  38.75 
 
 
1069 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000661642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1111  translocation protein TolB  35.63 
 
 
446 aa  53.9  0.000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00131159  normal  0.386204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3171  translocation protein TolB  31.25 
 
 
439 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0216692  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0018  amidohydrolase  40 
 
 
1081 aa  53.5  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000272228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0013  amidohydrolase  38.75 
 
 
1067 aa  53.5  0.000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.137513 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0659  TolB-like protein  34.56 
 
 
434 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.481566  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0009  amidohydrolase  33.63 
 
 
1060 aa  53.5  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0694  TolB domain protein  34.56 
 
 
434 aa  53.5  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0703  TolB domain-containing protein  30.13 
 
 
437 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.408363  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0562  translocation protein TolB  23.26 
 
 
444 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.271593  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2675  translocation protein TolB  25.71 
 
 
446 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.202485  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3621  translocation protein TolB  30.77 
 
 
435 aa  53.1  0.000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2627  translocation protein TolB  31.54 
 
 
436 aa  53.1  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0669  translocation protein TolB  23.26 
 
 
444 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.303969  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2322  translocation protein TolB  23.26 
 
 
444 aa  53.1  0.000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0205331  normal  0.53419 
 
 
-
 
NC_004310  BR1697  translocation protein TolB  31.03 
 
 
443 aa  52.8  0.000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0017  amidohydrolase  31.5 
 
 
1049 aa  52.8  0.000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1114  peptidase S9 prolyl oligopeptidase  43.75 
 
 
701 aa  52.8  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.131603 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1944  translocation protein TolB  28.11 
 
 
427 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.526613 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1639  translocation protein TolB  31.03 
 
 
443 aa  52.4  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0693  TolB domain protein  34.56 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180783  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0975  translocation protein TolB  25.86 
 
 
445 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0670772  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0262  translocation protein TolB  29.91 
 
 
434 aa  52.4  0.00001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000248265  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2416  TolB domain-containing protein  34.23 
 
 
453 aa  52  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0015  amidohydrolase  34.82 
 
 
1062 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0180602 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0175  TolB protein  30.28 
 
 
437 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.313268  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0925  WD40 domain protein beta Propeller  28.39 
 
 
629 aa  51.6  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.775889  normal  0.417234 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2019  TolB  30.28 
 
 
440 aa  51.6  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.636869  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0859  WD40 domain-containing protein  23.94 
 
 
442 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.318178  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1385  hypothetical protein  25.93 
 
 
656 aa  51.2  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4402  translocation protein TolB  23.11 
 
 
414 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.145947  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1812  translocation protein TolB  25.5 
 
 
449 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.431319  normal  0.360787 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4147  translocation protein TolB  25.5 
 
 
449 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5049  amidohydrolase  26.01 
 
 
1031 aa  50.8  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.424824  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1311  translocation protein TolB  25.3 
 
 
444 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1774  amidohydrolase  42.67 
 
 
1014 aa  50.8  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0234293  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1462  translocation protein TolB  30.15 
 
 
442 aa  50.8  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000134108  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2161  WD40 domain protein beta Propeller  22.95 
 
 
440 aa  50.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.000041437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2455  translocation protein TolB  25.19 
 
 
430 aa  50.8  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.328002  normal  0.860267 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4589  Periplasmic component of the Tol biopolymer transport system-like protein  36.84 
 
 
305 aa  50.8  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.519629  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2365  translocation protein TolB  33.67 
 
 
441 aa  50.4  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1805  Putative cell wall-binding domain-like protein  24.2 
 
 
688 aa  50.4  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.203584  normal  0.132766 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51720  translocation protein TolB  25.28 
 
 
432 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109745  hitchhiker  0.0000339249 
 
 
-
 
NC_002950  PG0724  prolyl oligopeptidase family protein  22.39 
 
 
648 aa  50.1  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.866947 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0011  amidohydrolase  32.74 
 
 
1065 aa  50.4  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000114616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1527  translocation protein TolB  30.15 
 
 
441 aa  50.1  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000832022  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0011  amidohydrolase  33.04 
 
 
1062 aa  50.4  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000193716 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5592  serine/threonine protein kinase  34.85 
 
 
721 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.294025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>