More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2780 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2780  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  607  1e-173  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.188886  normal  0.0383383 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0330  hypothetical protein  47.24 
 
 		 287 aa  238  8e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0987  MscS Mechanosensitive ion channel  43.78 
 
 		 238 aa  189  4e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5463  MscS Mechanosensitive ion channel  36.23 
 
 		 343 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.269359 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0141  MscS Mechanosensitive ion channel  34.83 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.195967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2049  mechanosensitive ion channel  31.33 
 
 		 291 aa  134  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.492316  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1914  MscS mechanosensitive ion channel  32.33 
 
 		 275 aa  132  6e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2895  helix-turn-helix, AraC type  30.43 
 
 		 264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0170548 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1524  mechanosensitive ion channel  30.36 
 
 		 291 aa  131  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.288114  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02267  hypothetical protein  31.34 
 
 		 292 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2715  small-conductance mechanosensitive channel  33.19 
 
 		 270 aa  127  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0108  MscS mechanosensitive ion channel  31.58 
 
 		 291 aa  119  6e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1137  MscS Mechanosensitive ion channel  28.52 
 
 		 276 aa  109  5e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.463886 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1093  MscS mechanosensitive ion channel  27.65 
 
 		 271 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.746887  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2830  MscS mechanosensitive ion channel  25.21 
 
 		 269 aa  90.9  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1447  MscS mechanosensitive ion channel  31.4 
 
 		 1166 aa  85.9  8e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2988  putative small-conductance mechanosensitive channel  40.18 
 
 		 806 aa  85.1  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000510417  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1339  MscS Mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 636 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000323872 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1311  MscS Mechanosensitive ion channel  27.43 
 
 		 636 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2983  Small-conductance mechanosensitive channel-like protein  26.14 
 
 		 1144 aa  83.2  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2627  MscS mechanosensitive ion channel  27.75 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.159228  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2712  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.29 
 
 		 507 aa  82.4  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0470198  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0522  potassium efflux protein KefA  27.54 
 
 		 1118 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.97346  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0528  potassium efflux protein KefA  27.54 
 
 		 1120 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0538  potassium efflux protein KefA  27.54 
 
 		 1118 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0581  potassium efflux protein KefA  27.54 
 
 		 1118 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.467495  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0519  potassium efflux protein KefA  27.54 
 
 		 1120 aa  82.4  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3550  MscS Mechanosensitive ion channel  34.18 
 
 		 294 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3427  MscS mechanosensitive ion channel  26.53 
 
 		 428 aa  82  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.259375  normal  0.309045 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2555  MscS mechanosensitive ion channel  25.81 
 
 		 321 aa  81.6  0.00000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3058  MscS mechanosensitive ion channel  26.19 
 
 		 435 aa  82  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.914338 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0209  MscS mechanosensitive ion channel  26.98 
 
 		 685 aa  82  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0673077 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0849  MscS mechanosensitive ion channel  26.96 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.925309  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2581  MscS mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.391196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1599  MscS Mechanosensitive ion channel  27.22 
 
 		 862 aa  79.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0435  MscS mechanosensitive ion channel  28.18 
 
 		 288 aa  79.3  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3421  MscS Mechanosensitive ion channel  34 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0306302  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00416  fused conserved protein  27.98 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3145  MscS Mechanosensitive ion channel  27.98 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.178032  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00421  hypothetical protein  27.98 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0500  potassium efflux protein KefA  27.98 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.527944  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3151  potassium efflux protein KefA  27.98 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.800258  normal  0.703774 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2162  periplasmic binding protein; mechanosensitive ion channel component  26.47 
 
 		 794 aa  78.6  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.387859 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0541  potassium efflux protein KefA  27.98 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0508  potassium efflux protein KefA  27.98 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000540502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0945  potassium efflux protein KefA  26.2 
 
 		 1115 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.612496  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3204  potassium efflux protein KefA  31.21 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2883  potassium efflux protein KefA  31.21 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0991479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0555  potassium efflux protein KefA  27.98 
 
 		 1118 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.364262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0397  potassium efflux protein KefA  27.98 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3064  potassium efflux protein KefA  31.21 
 
 		 1120 aa  78.2  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  29.2 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04029  predicted mechanosensitive channel  25.95 
 
 		 1107 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.475668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3831  MscS Mechanosensitive ion channel  25.95 
 
 		 1107 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.915765  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3851  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1107 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00332968 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2316  mechanosensitive ion channel family protein  31.21 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.176359  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4691  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1107 aa  77  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00421616  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5174  mechanosensitive ion channel family protein  31.01 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4630  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1107 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.250026  normal  0.0442574 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5331  mechanosensitive ion channel family protein  31.14 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0115523  hitchhiker  0.00000270411 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03991  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1107 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.391275  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4017  MscS mechanosensitive ion channel  31.65 
 
 		 285 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5675  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1107 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00234961  normal  0.548719 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1247  MscS Mechanosensitive ion channel  28.91 
 
 		 370 aa  76.6  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4401  hypothetical protein  25.54 
 
 		 1107 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.199255  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4716  hypothetical protein  25.95 
 
 		 1107 aa  77  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00612141  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5604  mechanosensitive ion channel family protein  31.14 
 
 		 293 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5587  mechanosensitive ion channel family protein  31.01 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000187397 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5664  mechanosensitive ion channel family protein  31.01 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.11477  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5330  mechanosensitive ion channel family protein  31.01 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.368223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5158  mechanosensitive ion channel family protein  31.01 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5726  mechanosensitive ion channel family protein  31.01 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0727395  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0227  MscS mechanosensitive ion channel  29.56 
 
 		 268 aa  76.6  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3045  potassium efflux protein KefA  33.12 
 
 		 1133 aa  76.6  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3036  transporter, putative  25.27 
 
 		 1080 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0415629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2985  hypothetical protein  26.67 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0299284  normal  0.0305677 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5628  mechanosensitive ion channel family protein  30.77 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177271  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2101  MscS Mechanosensitive ion channel  25.39 
 
 		 299 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000172333  normal  0.177745 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1013  potassium efflux protein KefA  31.82 
 
 		 1128 aa  75.5  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0345  hypothetical protein  24.91 
 
 		 1103 aa  75.5  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.742298  unclonable  0.00000473028 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  29.75 
 
 		 267 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1130  potassium efflux protein KefA  32.47 
 
 		 1130 aa  75.1  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000811569 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3778  MscS mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 1072 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2052  MscS Mechanosensitive ion channel  27.33 
 
 		 810 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3721  MscS Mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 1072 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4616  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1108 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.115019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4625  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1108 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.288253  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1867  cyclic nucleotide-regulated small mechanosensitive ion channel  23.68 
 
 		 480 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0456814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0547  MscS mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 1067 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4708  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1108 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.749013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4765  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1108 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.514219  normal  0.17769 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1250  MscS mechanosensitive ion channel  26.67 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000000414305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  22.04 
 
 		 270 aa  74.7  0.000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1486  MscS Mechanosensitive ion channel  33.1 
 
 		 272 aa  74.7  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4744  hypothetical protein  25.26 
 
 		 1108 aa  74.7  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3904  MscS mechanosensitive ion channel  25.48 
 
 		 1072 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3310  MscS mechanosensitive ion channel  27.18 
 
 		 289 aa  74.3  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.026322  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  29.03 
 
 		 267 aa  73.2  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0410  MscS Mechanosensitive ion channel  33.83 
 
 		 372 aa  73.2  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2942  MscS mechanosensitive ion channel  26.24 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.176096  normal  0.766616 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>