More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1264 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1264  sodium:proline symporter (proline permease)  100 
 
 		 639 aa  1290    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1952  Na+/solute symporter  63.32 
 
 		 638 aa  862    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0672  Na+/solute symporter  46.32 
 
 		 633 aa  550  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1796  Na+/solute symporter  28.14 
 
 		 483 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000417622  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0378  sodium:solute symporter  25.15 
 
 		 461 aa  127  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03760  putative sodium:solute symporter  24.55 
 
 		 461 aa  113  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.188515  normal  0.0159939 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.95 
 
 		 492 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  24.95 
 
 		 492 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  25.14 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  24.95 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  25.14 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  25.14 
 
 		 492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0964  Na+/solute symporter  24.25 
 
 		 508 aa  111  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1387  Na+/solute symporter  24.85 
 
 		 459 aa  111  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.557678 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  25.05 
 
 		 492 aa  110  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4524  Na+/solute symporter  24.85 
 
 		 459 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  25.85 
 
 		 492 aa  110  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  24.82 
 
 		 492 aa  109  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  24.81 
 
 		 493 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  25.79 
 
 		 482 aa  109  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  24.43 
 
 		 492 aa  109  2e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4030  Na+/solute symporter  24.85 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.110038  normal  0.104242 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  24.81 
 
 		 492 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3721  sodium:proline symporter (proline permease)  26.41 
 
 		 553 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  24.57 
 
 		 487 aa  108  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0846  Na+/solute symporter  25.05 
 
 		 507 aa  108  3e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  24.62 
 
 		 493 aa  108  4e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  24.62 
 
 		 493 aa  108  4e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3386  sodium/proline symporter  27.11 
 
 		 484 aa  108  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  24.62 
 
 		 492 aa  108  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3921  sodium:solute symport protein  24.52 
 
 		 463 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46110  putative sodium:solute symport protein  24.52 
 
 		 463 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0497302  normal  0.205453 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0949  sodium/proline symporter  26.99 
 
 		 488 aa  107  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000419009  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  24.57 
 
 		 492 aa  107  9e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  24.24 
 
 		 492 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00590  Sodium:solute symporter  26.43 
 
 		 460 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000130807  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  25.55 
 
 		 492 aa  104  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  22.65 
 
 		 492 aa  102  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3816  Na+/solute symporter  24.08 
 
 		 459 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.101715 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3516  sodium/proline symporter  26.37 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0974  putative sodium symporter protein  24.72 
 
 		 560 aa  101  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1464  Na+/solute symporter  25.77 
 
 		 489 aa  101  5e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.675757  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0575  Na+/solute symporter  24.76 
 
 		 479 aa  100  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000227559  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1454  Na+/solute symporter  24.55 
 
 		 459 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0563954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2710  Na+/solute symporter  25.59 
 
 		 462 aa  99.8  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.308556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.09 
 
 		 504 aa  99.4  2e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2906  Na+/solute symporter  23.03 
 
 		 463 aa  99.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0422  Na+/solute symporter  26.01 
 
 		 476 aa  99.4  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.273483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1756  sodium/proline symporter  24.08 
 
 		 513 aa  99  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.15784 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  24.05 
 
 		 492 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1268  putative sodium:solute symport protein  23.33 
 
 		 474 aa  98.6  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0735  Na+/solute symporter  25.84 
 
 		 489 aa  98.2  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2204  SSS sodium solute transporter superfamily  25.11 
 
 		 537 aa  97.8  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.814033  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1057  Na+/solute symporter  25.4 
 
 		 476 aa  97.8  6e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.216268  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3085  sodium/proline symporter  23.71 
 
 		 484 aa  97.4  6e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.198592 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0554  sodium/proline symporter  26.33 
 
 		 493 aa  97.8  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1324  Na+/solute symporter  27.09 
 
 		 603 aa  97.4  8e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5121  Na+/solute symporter  22.7 
 
 		 462 aa  97.1  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  23.61 
 
 		 533 aa  97.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1220  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.19 
 
 		 489 aa  97.1  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2388  SSS sodium solute transporter superfamily  24.91 
 
 		 551 aa  96.7  1e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4125  Na+/solute symporter  28.34 
 
 		 479 aa  95.1  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0765871  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0453  Sodium/proline symporter  23.92 
 
 		 494 aa  94.7  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2570  Na+/solute symporter  25.87 
 
 		 464 aa  94.7  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000435173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0425  Na+/solute symporter  25.75 
 
 		 530 aa  94.4  6e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1221  sodium/proline symporter  27.04 
 
 		 492 aa  94.4  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1465  sodium/proline symporter  26.35 
 
 		 492 aa  94  7e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4210  sodium/proline symporter  25.47 
 
 		 494 aa  94  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1223  Na+/solute symporter  23.94 
 
 		 562 aa  94  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.704891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1250  sodium/proline symporter  23.99 
 
 		 496 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.469552 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  23.64 
 
 		 518 aa  93.2  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.49 
 
 		 500 aa  93.2  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0255  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  25.17 
 
 		 542 aa  93.2  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5457  Na+/solute symporter  25.89 
 
 		 482 aa  93.2  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.692749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  23.86 
 
 		 497 aa  92.4  2e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3165  putative sodium symporter protein  26.22 
 
 		 553 aa  92.8  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3490  sodium/proline symporter  25 
 
 		 498 aa  91.7  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.753009  normal  0.0181041 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3463  proline/sodium symporter  26.14 
 
 		 495 aa  91.7  4e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06350  hypothetical protein  25.37 
 
 		 506 aa  91.7  4e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0734  sodium/proline symporter  26.37 
 
 		 492 aa  91.3  5e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  26.03 
 
 		 537 aa  90.9  6e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  23.08 
 
 		 508 aa  90.9  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4843  SSS sodium solute transporter superfamily  25 
 
 		 544 aa  90.9  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.17 
 
 		 493 aa  90.5  9e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4018  sodium/proline symporter  24.91 
 
 		 494 aa  90.1  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  24.89 
 
 		 488 aa  90.1  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  24.68 
 
 		 558 aa  90.1  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0864  hypothetical protein  24.59 
 
 		 524 aa  90.1  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.983965  normal  0.0488094 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0416  sodium/proline symporter  25.06 
 
 		 495 aa  89.7  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.292846  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2753  Na+/solute symporter  24.64 
 
 		 472 aa  89.4  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3347  putative osmoregulated proline transporter  24.16 
 
 		 486 aa  89  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0522  sodium/proline symporter  24.95 
 
 		 492 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.550728  normal  0.0854838 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1308  Na+/solute symporter  22.99 
 
 		 586 aa  88.2  4e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5253  SSS sodium solute transporter superfamily  23.32 
 
 		 523 aa  87.8  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.648508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3036  sodium/proline symporter  23.43 
 
 		 488 aa  87.4  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000692388  normal  0.0245093 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  23.88 
 
 		 491 aa  87.4  7e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1134  Na+/solute symporter  27.21 
 
 		 527 aa  87.4  7e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1619  sodium/proline symporter  23.64 
 
 		 483 aa  87  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000146301  decreased coverage  0.00000122936 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.35 
 
 		 533 aa  86.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0324  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  24.57 
 
 		 567 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>