More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_2680 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_2680  fimbrial protein pilin  100 
 
 		 169 aa  340  5e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0726827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1828  fimbrial protein pilin  42.69 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.10224  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0477  putative type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.1 
 
 		 173 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0748911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0065  pilin  44.83 
 
 		 170 aa  110  7.000000000000001e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.154072 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0864  pilin  44.32 
 
 		 163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.484071 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58730  type IV pilin structural subunit  41.15 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.279942  normal  0.457351 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4040  fimbrial protein pilin  45.61 
 
 		 178 aa  108  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.736529  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0557  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  39.66 
 
 		 173 aa  105  4e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1889  hypothetical protein  45.91 
 
 		 137 aa  104  6e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0480  pilin subfamily protein  39.78 
 
 		 174 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2540  general secretion pathway protein H  44.91 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.13206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0558  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40.88 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12104  fimbrial protein  42.94 
 
 		 165 aa  99.4  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.246946  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0478  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  43.33 
 
 		 169 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.322644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3387  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  39.9 
 
 		 196 aa  98.2  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.437334  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0656  general secretion pathway protein H  39.36 
 
 		 199 aa  97.8  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2675  general secretion pathway protein H  39.13 
 
 		 198 aa  97.4  8e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4782  Tfp pilus assembly protein  38.67 
 
 		 179 aa  96.7  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1265  methylation  38.75 
 
 		 160 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00964428  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2035  hypothetical protein  39.13 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2646  hypothetical protein  39.13 
 
 		 198 aa  97.1  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0797  pilin  43.9 
 
 		 148 aa  96.3  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1878  hypothetical protein  42.14 
 
 		 137 aa  94.7  5e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5973  general secretion pathway protein H  38.59 
 
 		 198 aa  93.6  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0600966 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1890  hypothetical protein  48.12 
 
 		 136 aa  92.4  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1879  hypothetical protein  51.88 
 
 		 137 aa  92.8  2e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0864  peptidase S49, protease IV  42.07 
 
 		 139 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2567  general secretion pathway protein H  39.67 
 
 		 198 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4674  methylation  41.46 
 
 		 169 aa  92.4  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.953976  normal  0.930835 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0677  putative type IV fimbrial pilin protein  43.95 
 
 		 207 aa  92.4  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2693  general secretion pathway protein H  39.67 
 
 		 198 aa  92.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.289926  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5185  protein involved in methylation  39.64 
 
 		 174 aa  92  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3782  methylation site containing protein  42.6 
 
 		 148 aa  90.9  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0485  fimbrial protein pilin  50.94 
 
 		 136 aa  87  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04886  pilin  45.06 
 
 		 141 aa  87  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.969324  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3289  putative type IV fimbrial pilin protein  39.46 
 
 		 207 aa  87  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.213615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5161  type IV pilin structural subunit  39.77 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  39.39 
 
 		 168 aa  85.5  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1510  fimbrial protein  36.97 
 
 		 138 aa  84.3  8e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.0000000690325  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0446  putative type IV fimbrial pilin protein  39.49 
 
 		 205 aa  84  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.590776 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0472  fimbrial protein pilin  36.31 
 
 		 182 aa  83.2  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.877435  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3385  fgenesh4_pg.C_scaffold_2883000002  33.16 
 
 		 199 aa  81.6  0.000000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0799  fimbrial protein pilin  47.11 
 
 		 139 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0744296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0463  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  40 
 
 		 167 aa  80.1  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.961425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0649  pilin family protein  42.68 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3896  Fimbrial protein pilin  71.43 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0820  putative type IV pilin protein PilA  37.63 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0278  type IV pilin, putative  37.63 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0816  putative type IV pilin protein PilA  37.63 
 
 		 172 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0979  PilA  37.84 
 
 		 207 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2398  putative type IV pilin  37.84 
 
 		 207 aa  77.4  0.00000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.558979  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2678  putative type IV pilin  37.84 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0011  putative type IV pilin  37.84 
 
 		 189 aa  77.4  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2629  type IV pilus subunit PilA  41.03 
 
 		 138 aa  77  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2449  Fimbrial protein pilin  51.39 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.000426279  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3356  fimbrial protein pilin: general secretion pathway protein H  64.29 
 
 		 137 aa  73.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.669833  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1999  fimbrial protein  39.67 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3344  prepilin-type cleavage/methylation  45.61 
 
 		 148 aa  73.9  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.62769  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3946  fimbrial protein pilin  67.27 
 
 		 169 aa  73.2  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129399 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03468  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  42.5 
 
 		 141 aa  72.4  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0478  prepilin peptidase dependent protein D  51.95 
 
 		 134 aa  72.4  0.000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183909  normal  0.878303 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3945  fimbrial protein pilin  72.92 
 
 		 166 aa  72  0.000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.373423  hitchhiker  0.00130999 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0230  Fimbrial protein pilin  56.67 
 
 		 161 aa  70.9  0.000000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4781  Tfp pilus assembly protein  34.59 
 
 		 159 aa  70.1  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.431872  normal  0.26372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1078  pilin  62.5 
 
 		 162 aa  70.5  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.18456 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0475  fimbrial protein pilin  71.11 
 
 		 139 aa  70.5  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.665132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0467  type 4 fimbrial pilin signal peptide protein  35.56 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.568157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4444  type IV pilin  38.22 
 
 		 160 aa  70.1  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4819  general secretion pathway protein H  67.35 
 
 		 138 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80083  normal  0.111143 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2126  methylation  84.62 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.196428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0927  type IV pilus biogenesis protein  50 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0421  methylation site containing protein  79.49 
 
 		 142 aa  68.9  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000175547  normal  0.0256712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0417  pilin, putative  79.49 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0476  methylation site containing protein  64.81 
 
 		 141 aa  68.9  0.00000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0473  fimbrial protein pilin  63.27 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3944  fimbrial protein pilin  65.31 
 
 		 166 aa  67.8  0.00000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.736158  hitchhiker  0.00123211 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2523  methylation  48.53 
 
 		 141 aa  67.4  0.00000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2663  type IV pilus biogenesis protein PilE  57.41 
 
 		 142 aa  67  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.839094  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0461  fimbrial protein precursor PilE (MS11 antigen)  53.57 
 
 		 167 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.653734  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2200  pilus assembly protein PilA  46.23 
 
 		 111 aa  67  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.360457  hitchhiker  0.000654211 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0634  fimbrial protein pilin  34.55 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4536  fimbrial protein pilin  65.38 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0269  fimbrial protein pilin  40.23 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.372108  normal  0.389594 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002546  type IV pilin PilA  77.5 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.790868  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0675  fimbrial protein pilin  63.46 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357739 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0680  fimbrial protein pilin  63.46 
 
 		 136 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0314  general secretion pathway protein  43.4 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5196  type 4 fimbrial biogenesis protein PilE  50.79 
 
 		 141 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3918  methylation site containing protein  74.36 
 
 		 143 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000265425  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0477  prepilin-type cleavage/methylation  59.26 
 
 		 148 aa  65.1  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695821  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3386  hypothetical protein  49.15 
 
 		 438 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00409988 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1866  hypothetical protein  49.15 
 
 		 446 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.287595  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0414  methylation site containing protein  48.81 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3388  methylation  75 
 
 		 138 aa  63.9  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3604  methylation site containing protein  40.4 
 
 		 150 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0981563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2904  putative type 4 fimbrial biogenesis transmembrane protein  47.37 
 
 		 168 aa  63.2  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.3004 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4155  fimbiral protein PilA  69.77 
 
 		 188 aa  61.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.614605  normal  0.158719 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0250  fimbrial subunit  54 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0333044  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0627  putative major pilin subunit  58 
 
 		 147 aa  60.5  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03231  type IV pilin  47.69 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0578635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>