More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0336 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_0336  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 		 293 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1044  HTH-type transcriptional regulator, LysR-family  43.84 
 
 		 294 aa  251  8.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05418  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001477  transcriptional regulator  31.49 
 
 		 292 aa  181  1e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.223325  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0402  LysR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 292 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0779916  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65970  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5724  putative transcriptional regulator  33.33 
 
 		 294 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1214  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0760  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1241  LysR family transcriptional regulator  29.92 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0161  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 297 aa  98.6  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0599648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4052  LysR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3798  LysR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0716  LysR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 294 aa  95.9  7e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4929  LysR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4978  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 297 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.403345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3337  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4801  LysR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0716178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0489  LysR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 300 aa  94  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.013623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1422  LysR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.295916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2324  LysR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 306 aa  94  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3204  transcriptional regulator, LysR family  32.82 
 
 		 307 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.340375 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1149  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 291 aa  94.7  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.229306  normal  0.0812943 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0504  LysR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 302 aa  94  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1130  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  28.14 
 
 		 302 aa  93.2  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0141  LysR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 305 aa  92.8  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0537  LysR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 296 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.84391  normal  0.0745135 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1428  transcriptional regulator, LysR family  29.64 
 
 		 322 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.498428 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5229  LysR family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 307 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01279  putative transcriptional regulator with periplasmic binding protein domain (LysR family)  28.52 
 
 		 307 aa  89.7  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0224916  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1043  LysR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 309 aa  89.4  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3576  LysR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 293 aa  89  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.322821  normal  0.0297722 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0612  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 295 aa  88.2  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.341398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2021  LysR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 299 aa  88.2  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0424738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0510  LysR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 311 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.143381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5292  LysR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 306 aa  88.6  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  0.585021 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2728  LysR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.159737  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2058  LysR family transcriptional regulator  28.08 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.154037  normal  0.839188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3742  putative transcriptional regulator  26.62 
 
 		 292 aa  87  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1639  LysR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 309 aa  85.9  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.286177  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3300  LysR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 288 aa  85.9  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2976  LysR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 313 aa  85.1  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0567  LysR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 326 aa  84.3  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5540  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 313 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.108539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0223  transcriptional regulator, LysR family  26.82 
 
 		 314 aa  83.6  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3930  LysR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 320 aa  84  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0309903  normal  0.96448 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4524  LysR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2306  transcriptional regulator, LysR family  30.54 
 
 		 283 aa  83.6  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.16135  normal  0.168565 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4121  LysR family transcriptional regulator  26.62 
 
 		 337 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000919638  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4296  LysR family transcriptional regulator  30.96 
 
 		 304 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0279336 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1604  transcriptional regulator, LysR family  28.63 
 
 		 322 aa  82.8  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.709865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0355  transcriptional regulator, LysR family  25.83 
 
 		 298 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3742  LysR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 301 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.927612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4453  LysR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 307 aa  82.4  0.000000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.822863  hitchhiker  0.0000436239 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3141  LysR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 296 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4563  LysR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 303 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500086 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0349  LysR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2710  LysR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 299 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0557153  normal  0.0592619 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4242  LysR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 333 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000271565  hitchhiker  0.00200651 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0216  LysR family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000393101  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1088  transcriptional regulator, LysR family  30.6 
 
 		 307 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0130625 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1151  transcriptional regulator, LysR family  27.31 
 
 		 307 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.88835 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1757  transcriptional regulator, LysR family  29.17 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.187879 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2683  transcriptional regulator, LysR family  26.46 
 
 		 310 aa  79.3  0.00000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4422  LysR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 302 aa  79.3  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.481788 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1242  LysR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 292 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.310475 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0218  transcriptional regulator, LysR family  25.97 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000934146  normal  0.114496 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4762  transcriptional regulator, LysR family  27.36 
 
 		 301 aa  79  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1726  LysR substrate-binding  31.07 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.127689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0341  transcriptional regulator CysB  28.91 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.136754  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1207  transcriptional regulator, LysR family  27.18 
 
 		 314 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1835  LysR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3502  LysR family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 342 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000000578298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26860  LysR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26681  putative Rubisco transcriptional regulator  28.16 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003833  putative transcriptional regulator  25.51 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3307  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1136  LysR family transcriptional regulator  25.1 
 
 		 292 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1689  transcriptional regulator CysB  27.18 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.372652  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6997  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 321 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2782  LysR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 320 aa  76.6  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0196765  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1033  transcriptional regulator CysB  27.67 
 
 		 323 aa  76.6  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.113266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3099  LysR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.71594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1566  LysR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.939992  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6422  LysR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 307 aa  76.3  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2672  LysR family transcriptional regulator  26.69 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1164  transcriptional regulator, LysR family  25.26 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.221601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4338  LysR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 290 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1907  LysR family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 308 aa  75.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.279335  unclonable  0.0000102783 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2157  LysR family transcriptional regulator  22.27 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2045  transcriptional regulator, LysR family  30.6 
 
 		 307 aa  75.5  0.0000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.815295 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3125  LysR family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 301 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5866  transcriptional regulator, LysR family  25.56 
 
 		 315 aa  75.1  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2089  transcriptional regulator, LysR family  28.74 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3163  LysR family transcriptional regulator  26.15 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5842  LysR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328842  hitchhiker  0.000251126 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1757  LysR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 292 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3164  LysR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 314 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1624  transcriptional regulator CysB  26.21 
 
 		 324 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.483368  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2275  regulatory protein LysR  28.05 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.288787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>