More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0689 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0689  chorismate synthase  100 
 
 
373 aa  753    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0139341  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0644  chorismate synthase  68.98 
 
 
377 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.180564  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1340  chorismate synthase  70.05 
 
 
386 aa  520  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0578  chorismate synthase  69.25 
 
 
373 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.778585  normal  0.127119 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0260  chorismate synthase  70.32 
 
 
373 aa  508  1e-143  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  49.59 
 
 
373 aa  382  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  51.47 
 
 
366 aa  381  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  51.2 
 
 
365 aa  377  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  48.66 
 
 
365 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  46.7 
 
 
360 aa  336  2.9999999999999997e-91  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0439  chorismate synthase  46.88 
 
 
364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.178344  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  46.15 
 
 
364 aa  336  3.9999999999999995e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  46.99 
 
 
362 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  46.99 
 
 
362 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  43.96 
 
 
363 aa  332  9e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  45.05 
 
 
358 aa  331  1e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  46.15 
 
 
362 aa  329  6e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_405  chorismate synthase  46.34 
 
 
364 aa  329  6e-89  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.09813  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0462  chorismate synthase  46.07 
 
 
364 aa  326  4.0000000000000003e-88  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.282213  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  45.33 
 
 
363 aa  325  6e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  46.43 
 
 
354 aa  323  3e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  46.45 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  46.56 
 
 
352 aa  319  3.9999999999999996e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  44.78 
 
 
362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  44.78 
 
 
362 aa  320  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  43.96 
 
 
358 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  45.05 
 
 
362 aa  318  1e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  46.15 
 
 
366 aa  316  4e-85  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  43.41 
 
 
364 aa  315  7e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  44.78 
 
 
362 aa  315  8e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  44.78 
 
 
361 aa  315  9.999999999999999e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  44.51 
 
 
361 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  44.78 
 
 
365 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  41.92 
 
 
359 aa  312  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  44.74 
 
 
361 aa  311  7.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  44.26 
 
 
334 aa  311  7.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  44.23 
 
 
364 aa  311  9e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  45.82 
 
 
362 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  44.23 
 
 
384 aa  311  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1314  chorismate synthase  45.55 
 
 
361 aa  311  2e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1564  chorismate synthase  47.11 
 
 
328 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  44.78 
 
 
364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0846  chorismate synthase  45.14 
 
 
371 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.742224 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  44.23 
 
 
366 aa  309  5.9999999999999995e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  45.55 
 
 
361 aa  308  6.999999999999999e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  44.23 
 
 
361 aa  308  8e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  44.89 
 
 
366 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  43.51 
 
 
370 aa  307  1.0000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  42.86 
 
 
359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  43.41 
 
 
365 aa  307  2.0000000000000002e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  49.28 
 
 
367 aa  307  2.0000000000000002e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  44.11 
 
 
361 aa  307  2.0000000000000002e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  44.78 
 
 
352 aa  306  3e-82  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  45.19 
 
 
351 aa  306  5.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  43.41 
 
 
373 aa  305  6e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0629  chorismate synthase  44.39 
 
 
368 aa  306  6e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.548293  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  44.51 
 
 
352 aa  305  7e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  44.23 
 
 
371 aa  305  7e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  43.41 
 
 
364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  43.41 
 
 
364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  43.41 
 
 
364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  44.08 
 
 
366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  43.41 
 
 
364 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  43.41 
 
 
364 aa  304  2.0000000000000002e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  43.13 
 
 
362 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  43.92 
 
 
364 aa  303  4.0000000000000003e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  44.51 
 
 
370 aa  303  4.0000000000000003e-81  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  44.38 
 
 
368 aa  301  9e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  43.53 
 
 
355 aa  300  2e-80  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  44.47 
 
 
362 aa  300  2e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  44.62 
 
 
360 aa  300  2e-80  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  42.86 
 
 
356 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  43.41 
 
 
365 aa  299  6e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  42.9 
 
 
360 aa  299  7e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  42.86 
 
 
365 aa  298  7e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1282  chorismate synthase  44.8 
 
 
391 aa  298  8e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  43.29 
 
 
369 aa  298  8e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  41.6 
 
 
384 aa  298  8e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  42.58 
 
 
360 aa  298  1e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  44.51 
 
 
361 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  43.41 
 
 
363 aa  298  1e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2171  chorismate synthase  44.08 
 
 
359 aa  298  1e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2819  chorismate synthase  44.17 
 
 
370 aa  298  1e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0159117  normal  0.634482 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  44.23 
 
 
361 aa  297  2e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  43.13 
 
 
365 aa  296  3e-79  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0009  chorismate synthase  45.38 
 
 
356 aa  296  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  42.7 
 
 
354 aa  296  4e-79  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1257  chorismate synthase  44.81 
 
 
370 aa  296  6e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.234528  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1638  chorismate synthase  44.35 
 
 
364 aa  295  7e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1868  chorismate synthase  44.05 
 
 
373 aa  295  8e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.423516  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  43.68 
 
 
361 aa  295  9e-79  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  41.37 
 
 
363 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  41.37 
 
 
363 aa  295  1e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  43.29 
 
 
366 aa  295  1e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1138  chorismate synthase  44.26 
 
 
369 aa  295  1e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.26701  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0871  chorismate synthase  45.05 
 
 
371 aa  294  2e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.205918  normal  0.59922 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0785  chorismate synthase  46.47 
 
 
365 aa  294  2e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.229169 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  43.41 
 
 
366 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0392  chorismate synthase  44.74 
 
 
390 aa  294  2e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4332  chorismate synthase  44.11 
 
 
366 aa  294  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.259213  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>