More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0419 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  100 
 
 
284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  30.38 
 
 
319 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  26.98 
 
 
340 aa  99.4  6e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  26.51 
 
 
332 aa  98.2  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  25.45 
 
 
339 aa  98.6  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  25 
 
 
358 aa  96.7  4e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
322 aa  96.3  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  27.41 
 
 
307 aa  95.9  7e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 
341 aa  91.3  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  24.01 
 
 
340 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  25.09 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  27.24 
 
 
338 aa  88.2  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.31 
 
 
313 aa  87.8  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  30.4 
 
 
355 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  25.93 
 
 
347 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  26.72 
 
 
344 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  27.6 
 
 
338 aa  80.9  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  26.91 
 
 
329 aa  80.5  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  27.91 
 
 
337 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 
359 aa  76.6  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  30.66 
 
 
351 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  24.16 
 
 
317 aa  75.1  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  36.57 
 
 
474 aa  72.4  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  27.74 
 
 
351 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  29.32 
 
 
341 aa  70.9  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  29.82 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  22.87 
 
 
335 aa  69.7  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  37.24 
 
 
342 aa  68.9  0.00000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  28.97 
 
 
384 aa  67.8  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 
332 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  23.71 
 
 
873 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  26.04 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  25.93 
 
 
331 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0173  cofactor modifying protein (cmo)  28.85 
 
 
301 aa  66.6  0.0000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  28.15 
 
 
356 aa  65.9  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  21.76 
 
 
310 aa  65.9  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  28.47 
 
 
355 aa  65.5  0.0000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  35.87 
 
 
373 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  24.62 
 
 
344 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1794  cofactor modifying protein (cmo)  33.86 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.420776 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  23.28 
 
 
342 aa  63.5  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  28.25 
 
 
372 aa  63.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 
338 aa  62.8  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  26.8 
 
 
333 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0323  Radical SAM domain protein  30.77 
 
 
265 aa  59.7  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  25.26 
 
 
403 aa  59.3  0.00000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  24.29 
 
 
399 aa  59.3  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  20.11 
 
 
471 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  27.66 
 
 
374 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3312  hypothetical protein  22.94 
 
 
465 aa  59.3  0.00000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  23.76 
 
 
465 aa  59.3  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  23.29 
 
 
354 aa  58.9  0.00000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  26.2 
 
 
337 aa  58.5  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0480  Radical SAM domain protein  24.43 
 
 
281 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00535769  hitchhiker  0.00252735 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2197  radical SAM domain-containing protein  29.27 
 
 
368 aa  58.5  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  28.99 
 
 
428 aa  58.5  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  32.95 
 
 
479 aa  57.8  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  29.08 
 
 
397 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  26.95 
 
 
422 aa  58.2  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
330 aa  58.2  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  30.1 
 
 
399 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1392  Radical SAM domain protein  32.92 
 
 
377 aa  57.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.358724 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0390  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.89 
 
 
380 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.52753  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1343  radical SAM domain-containing protein  26.95 
 
 
334 aa  57  0.0000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  30.67 
 
 
458 aa  56.2  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  34.86 
 
 
378 aa  56.2  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0188  radical SAM family protein  25.21 
 
 
279 aa  55.8  0.0000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  24.69 
 
 
297 aa  55.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 
393 aa  55.5  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  24.32 
 
 
391 aa  55.5  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  24.5 
 
 
330 aa  55.1  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  35.14 
 
 
565 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  31.65 
 
 
325 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0433  radical SAM domain-containing protein  23.62 
 
 
433 aa  55.5  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  37.11 
 
 
308 aa  54.3  0.000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01021  hypothetical protein  26.32 
 
 
373 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.816192 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 
394 aa  54.3  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0225  Fe-S oxidoreductase  25.86 
 
 
459 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1557  Radical SAM domain protein  24.48 
 
 
467 aa  54.3  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  27.86 
 
 
335 aa  54.3  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3419  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.18 
 
 
414 aa  54.7  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.058581  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1978  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.66 
 
 
372 aa  54.3  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.633092  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  23.79 
 
 
330 aa  54.3  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
401 aa  54.3  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0900  Radical SAM domain protein  35.05 
 
 
292 aa  54.3  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0363  radical SAM domain-containing protein  21.79 
 
 
327 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal  0.816586 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2456  coenzyme PQQ biosynthesis protein E  26.75 
 
 
370 aa  53.9  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152479  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  27.4 
 
 
349 aa  53.9  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0883  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.11 
 
 
399 aa  53.9  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  22.27 
 
 
367 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  34.12 
 
 
287 aa  53.5  0.000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2161  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.03 
 
 
392 aa  53.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601943  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  20.83 
 
 
349 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  24.22 
 
 
340 aa  53.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2446  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.26 
 
 
380 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.121554  normal  0.0228236 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0790  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.26 
 
 
380 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  27.03 
 
 
369 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6304  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.18 
 
 
398 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  31.93 
 
 
367 aa  52.8  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1019  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  37.76 
 
 
328 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.33881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>