45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_3312 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_3312  hypothetical protein  100 
 
 
465 aa  949    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  22.32 
 
 
332 aa  70.1  0.00000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 
340 aa  62.4  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  22.84 
 
 
359 aa  61.6  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  23.61 
 
 
340 aa  60.8  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  22.5 
 
 
339 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  22.51 
 
 
337 aa  55.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  25.21 
 
 
292 aa  53.9  0.000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  22.94 
 
 
284 aa  53.1  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  22.43 
 
 
347 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1570  radical SAM domain-containing protein  21.8 
 
 
474 aa  52  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  23.08 
 
 
341 aa  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.2 
 
 
323 aa  51.2  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  24.89 
 
 
340 aa  50.8  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  24.27 
 
 
292 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  24.27 
 
 
292 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  24.27 
 
 
292 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  24.27 
 
 
292 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  24.27 
 
 
292 aa  50.4  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  24.27 
 
 
292 aa  50.4  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  24.27 
 
 
292 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  24.27 
 
 
279 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  23.81 
 
 
323 aa  49.7  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
355 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  24.49 
 
 
292 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  23.85 
 
 
292 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  23.38 
 
 
297 aa  47.4  0.0005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  29.33 
 
 
325 aa  47  0.0007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  19.92 
 
 
344 aa  46.6  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  28.4 
 
 
458 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  26.52 
 
 
346 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  21.37 
 
 
316 aa  46.2  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  32.35 
 
 
358 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  32.35 
 
 
322 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  32.98 
 
 
349 aa  45.8  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3569  radical SAM domain-containing protein  35.11 
 
 
365 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  21.3 
 
 
313 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  30.77 
 
 
413 aa  45.1  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1601  heme biosynthesis protein, putative  28.57 
 
 
354 aa  44.7  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.196015  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  25.68 
 
 
404 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3061  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  36.36 
 
 
326 aa  44.3  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.497246 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4391  Radical SAM domain protein  36.59 
 
 
327 aa  44.3  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  34.11 
 
 
392 aa  43.9  0.007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  26.26 
 
 
379 aa  43.5  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  26.15 
 
 
355 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>