155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01895 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0918  aculeacin A acylase  49.23 
 
 
855 aa  809    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0760  peptidase S45, penicillin amidase  48.72 
 
 
855 aa  793    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.526206  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3263  peptidase S45, penicillin amidase  48.6 
 
 
855 aa  790    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0771  peptidase S45, penicillin amidase  49.24 
 
 
860 aa  803    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3366  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.84 
 
 
855 aa  790    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.635154  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2773  aculeacin A acylase  48.6 
 
 
852 aa  792    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00542255  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0764  peptidase S45, penicillin amidase  48.41 
 
 
854 aa  795    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0860  peptidase S45, penicillin amidase  48.03 
 
 
854 aa  796    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3553  peptidase S45 penicillin amidase  48.41 
 
 
854 aa  793    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01895  penicillin acylase-like protein  100 
 
 
841 aa  1739    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21085  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0136  peptidase S45 penicillin amidase  33.49 
 
 
793 aa  431  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.122956  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2547  aculeacin A acylase transmembrane protein  32.17 
 
 
795 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33820  penicillin acylase-related protein  32.58 
 
 
762 aa  389  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00307751  normal  0.0883584 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25350  acyl-homoserine lactone acylase, PvdQ-like protein  32.53 
 
 
737 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2876  acylase  31.62 
 
 
760 aa  380  1e-104  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.181315  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2825  peptidase S45 penicillin amidase  31.47 
 
 
795 aa  382  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.572731 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2419  peptidase S45 penicillin amidase  31.3 
 
 
795 aa  378  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3778  peptidase S45, penicillin amidase  32.95 
 
 
779 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3685  peptidase S45 penicillin amidase  32.03 
 
 
824 aa  375  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2161  penicillin amidase family protein  29.6 
 
 
773 aa  369  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.498223  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2563  peptidase S45, penicillin amidase  29.55 
 
 
778 aa  367  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.387542  normal  0.91746 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2063  peptidase S45 penicillin amidase  33.29 
 
 
779 aa  369  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.530766  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2901  penicillin amidase family protein  30.03 
 
 
772 aa  364  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.736989 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1971  peptidase S45, penicillin amidase  29.74 
 
 
779 aa  363  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2790  peptidase S45, penicillin amidase  29.95 
 
 
763 aa  363  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.311234 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4860  acyl-homoserine lactone acylase  31.53 
 
 
804 aa  359  9.999999999999999e-98  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357957  normal  0.272976 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2403  peptidase S45 penicillin amidase  29.69 
 
 
770 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.52163  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2448  peptidase S45, penicillin amidase  30.92 
 
 
819 aa  345  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.868997 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2882  peptidase S45 penicillin amidase  29.59 
 
 
769 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3480  peptidase S45 penicillin amidase  30.41 
 
 
816 aa  331  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.996259  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3883  peptidase S45 penicillin amidase  30.43 
 
 
842 aa  304  5.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.513553  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1140  peptidase S45, penicillin amidase  30.78 
 
 
805 aa  300  7e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0192266  normal  0.229861 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2441  peptidase S45 penicillin amidase  29.04 
 
 
814 aa  299  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.708556  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1333  peptidase S45, penicillin amidase  30.26 
 
 
799 aa  289  1e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.222758  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4390  peptidase S45, penicillin amidase  29.56 
 
 
773 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0446871  normal  0.0863607 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3338  peptidase S45, penicillin amidase  28.5 
 
 
789 aa  257  6e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.378065  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0589  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  22.82 
 
 
694 aa  153  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2434  peptidase S45 penicillin amidase  22.91 
 
 
674 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3676  peptidase S45 penicillin amidase  22.62 
 
 
708 aa  147  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3571  Glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  23.22 
 
 
712 aa  134  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.111745  normal  0.0870635 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2388  penicillin amidase  25.6 
 
 
718 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.159151 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5764  peptidase S45 penicillin amidase  21.88 
 
 
725 aa  120  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3392  hypothetical protein  26.13 
 
 
809 aa  109  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40040  hypothetical protein  27.03 
 
 
809 aa  107  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0786  peptidase S45 penicillin amidase  25.44 
 
 
804 aa  105  4e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3308  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.99 
 
 
796 aa  101  5e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3292  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.78 
 
 
796 aa  100  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2980  penicillin acylase II  21.86 
 
 
796 aa  100  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0937  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  21.79 
 
 
724 aa  100  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.844114  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3087  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.86 
 
 
796 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3330  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.86 
 
 
796 aa  99.4  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.52862  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3031  penicillin acylase II  22.01 
 
 
796 aa  99  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2997  peptidase S45 penicillin amidase  21.22 
 
 
796 aa  99  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1982  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.33 
 
 
796 aa  96.3  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3300  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.6 
 
 
796 aa  96.7  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3266  beta-lactam antibiotic acylase family protein  21.27 
 
 
796 aa  95.9  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3975  peptidase S45 penicillin amidase  23.34 
 
 
818 aa  94.7  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1653  peptidase S45 penicillin amidase  22.66 
 
 
827 aa  92.4  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.101024  hitchhiker  0.00643903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1469  peptidase S45 penicillin amidase  24.56 
 
 
803 aa  92  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1908  peptidase S45 penicillin amidase  23.87 
 
 
818 aa  91.7  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.284267 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0631  peptidase S45 penicillin amidase  25.23 
 
 
769 aa  91.7  6e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.514453  normal  0.288229 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1297  peptidase S45, penicillin amidase  23.53 
 
 
827 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.106261  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2001  penicillin amidase  22.86 
 
 
770 aa  89.7  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1089  penicillin amidase family protein  21.51 
 
 
761 aa  89.4  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1171  glutaryl-7-aminocephalosporanic-acid acylase  20.92 
 
 
701 aa  89.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.312808  normal  0.0841772 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1568  peptidase S45 penicillin amidase  23.39 
 
 
854 aa  88.2  6e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0377478  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4995  penicillin amidase  22.4 
 
 
821 aa  87.8  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2143  peptidase S45 penicillin amidase  25.48 
 
 
787 aa  83.2  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2155  peptidase S45 penicillin amidase  22.55 
 
 
779 aa  83.2  0.00000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0749  peptidase S45 penicillin amidase  23.12 
 
 
819 aa  82.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1841  penicillin amidase  22.68 
 
 
829 aa  82.4  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3360  peptidase S45 penicillin amidase  24.91 
 
 
833 aa  81.3  0.00000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545108  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3892  penicillin amidase  23.64 
 
 
947 aa  79  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1578  peptidase S45, penicillin amidase  23.58 
 
 
821 aa  78.2  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00409181  normal  0.731428 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3059  peptidase S45 penicillin amidase  23.71 
 
 
823 aa  78.2  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1840  penicillin amidase  23.73 
 
 
821 aa  78.2  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.643427  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3068  peptidase S45 penicillin amidase  22.77 
 
 
817 aa  78.2  0.0000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.554637  unclonable  0.0000000469192 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4037  peptidase S45 penicillin amidase  23.79 
 
 
947 aa  77.8  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2814  peptidase S45 penicillin amidase  22.45 
 
 
870 aa  76.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.893736  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5658  peptidase S45 penicillin amidase  22.65 
 
 
808 aa  76.6  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.674957  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4884  peptidase S45 penicillin amidase  26.09 
 
 
906 aa  75.5  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0502  peptidase S45, penicillin amidase  21.07 
 
 
795 aa  74.3  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.269122  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2505  penicillin amidase or acylase  21.68 
 
 
843 aa  73.9  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.468551  normal  0.2535 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1644  penicillin amidase  22.15 
 
 
854 aa  73.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0269  penicillin amidase  25.22 
 
 
789 aa  73.2  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.29223 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1822  penicillin amidase  23.25 
 
 
813 aa  72.8  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0788  peptidase S45 penicillin amidase  22.39 
 
 
783 aa  72.8  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2999  peptidase S45 penicillin amidase  24.79 
 
 
807 aa  72  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5164  penicillin amidase family protein  22.85 
 
 
788 aa  71.6  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115972 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1150  penicillin amidase  23.06 
 
 
819 aa  72  0.00000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.744365  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3996  peptidase S45 penicillin amidase  23.08 
 
 
947 aa  70.5  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4240  peptidase S45, penicillin amidase  23.24 
 
 
792 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.501182 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4404  peptidase S45, penicillin amidase  24.42 
 
 
903 aa  69.3  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.676732  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1397  penicillin amidase  21.16 
 
 
762 aa  68.9  0.0000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5071  peptidase S45, penicillin amidase  23.33 
 
 
788 aa  68.2  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8445  penicillin amidase  21.18 
 
 
855 aa  67.8  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0903  peptidase S45 penicillin amidase  22.47 
 
 
864 aa  66.2  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.108494  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19340  Peptidase S45, penicillin amidase family  23.87 
 
 
839 aa  64.3  0.000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0301  peptidase S45 penicillin amidase  22.82 
 
 
787 aa  64.3  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.916585  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3361  peptidase S45 penicillin amidase  23.84 
 
 
769 aa  64.3  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.272902 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>