79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_5212 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_5212  DedA family protein  100 
 
 		 193 aa  377  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685047  normal  0.0291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5957  DedA family protein  92.23 
 
 		 193 aa  325  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.597905  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0048  DedA family protein  75.79 
 
 		 193 aa  295  4e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.331366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0699  DedA family  73.96 
 
 		 193 aa  291  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0725  DedA family protein  73.44 
 
 		 193 aa  290  9e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0738  DedA family protein  73.44 
 
 		 193 aa  290  9e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0479  DedA family protein  61.78 
 
 		 193 aa  241  6e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5187  DedA  60.43 
 
 		 193 aa  228  4e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.936462  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0978  DedA family protein  59.89 
 
 		 193 aa  227  9e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00254572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0868  DedA family  59.36 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2679  hypothetical protein  60.43 
 
 		 198 aa  225  3e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3739  hypothetical protein  59.89 
 
 		 198 aa  225  4e-58  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0861772  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0958  hypothetical protein  61.5 
 
 		 193 aa  224  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.361291  normal  0.790222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0715  DedA family  56.15 
 
 		 205 aa  214  8e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.628845  normal  0.325797 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2964  DedA family  52.69 
 
 		 193 aa  194  7e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0757  DedA family protein  57.06 
 
 		 210 aa  192  2e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1168  DedA family protein  44.79 
 
 		 192 aa  170  1e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0232351 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2492  DedA family protein  43.75 
 
 		 192 aa  164  5.9999999999999996e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0302048  normal  0.107524 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1280  SNARE associated Golgi protein  45.83 
 
 		 192 aa  156  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0203  SNARE associated Golgi protein  43.98 
 
 		 214 aa  155  4e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72790  hypothetical protein  46.77 
 
 		 194 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3196  DedA family protein  46.35 
 
 		 200 aa  154  6e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.556536  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0984  membrane-like protein  44.62 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.559705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1822  SNARE associated Golgi protein  47.09 
 
 		 193 aa  145  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  unclonable  0.00000000131488  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1641  hypothetical protein  40.72 
 
 		 196 aa  144  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.87156  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1589  hypothetical protein  40.72 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.356457  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3998  hypothetical protein  40.72 
 
 		 196 aa  142  3e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1827  hypothetical protein  45.21 
 
 		 193 aa  141  8e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1274  hypothetical protein  40.21 
 
 		 196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1429  hypothetical protein  42.41 
 
 		 191 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0371  hypothetical protein  42.69 
 
 		 192 aa  137  1e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2545  hypothetical protein  42.46 
 
 		 195 aa  137  1e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3844  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  40.72 
 
 		 196 aa  136  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.662096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1428  hypothetical protein  37.04 
 
 		 197 aa  135  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000050345  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2076  hypothetical protein  36.98 
 
 		 195 aa  135  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00198239  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3116  hypothetical protein  44 
 
 		 215 aa  134  6.0000000000000005e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03725  membrane protein; member of the DedA of proteins  39.64 
 
 		 183 aa  134  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.241313  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3551  putative transmembrane-associated alkaline phosphatase protein  40 
 
 		 198 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.846117  normal  0.490696 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1255  hypothetical protein  44.71 
 
 		 192 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0889015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1077  DedA family membrane protein  35.79 
 
 		 192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0548  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.89 
 
 		 195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0791  hypothetical protein  42.94 
 
 		 193 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.864721  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1434  SNARE associated Golgi protein  41.07 
 
 		 194 aa  117  9e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.141401  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0183  hypothetical protein  36.56 
 
 		 206 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0411  SNARE associated Golgi protein  39.06 
 
 		 195 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100204 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1501  lipoprotein B  32.78 
 
 		 191 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0681914  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1314  hypothetical protein  34.94 
 
 		 197 aa  104  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00346276  decreased coverage  0.000188073 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2300  hypothetical protein  35 
 
 		 187 aa  99.4  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000215162  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1606  membrane protein-like protein  37.35 
 
 		 416 aa  99  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04042  DedA family protein BAL199  31.21 
 
 		 195 aa  94.4  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1460  hypothetical protein  33.17 
 
 		 204 aa  91.7  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00163  lipoprotein  35.63 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.193393  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1286  SNARE associated Golgi protein-related protein  42.41 
 
 		 194 aa  84.3  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.453161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4083  hypothetical protein  28.28 
 
 		 190 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0653  hypothetical protein  31.41 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1994  lipoprotein  30.81 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1746  SNARE associated Golgi protein  32.56 
 
 		 160 aa  61.6  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.535585  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0012  SNARE associated Golgi protein  29.5 
 
 		 159 aa  60.8  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.566831  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1920  hypothetical protein  30.27 
 
 		 204 aa  60.1  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.817234  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0716  hypothetical protein  31.01 
 
 		 160 aa  56.6  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3883  hypothetical protein  31.25 
 
 		 192 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.230327 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0156  SNARE associated Golgi protein  31.78 
 
 		 160 aa  53.9  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461417  normal  0.0291058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1852  hypothetical protein  26.12 
 
 		 145 aa  48.5  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707673 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  26.09 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0229  hypothetical protein  27.82 
 
 		 143 aa  47.4  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2915  hypothetical protein  29.6 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2552  hypothetical protein  31.58 
 
 		 144 aa  47  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1084  DedA-like protein  24.61 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.672419  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0606  SNARE associated Golgi protein-related protein  25.75 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2202  hypothetical protein  27.21 
 
 		 145 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18740  uncharacterized membrane-associated protein  31.54 
 
 		 248 aa  42.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.829246  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1070  ribosomal protein L22  27.94 
 
 		 199 aa  42.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1825  hypothetical protein  26.12 
 
 		 145 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.272987  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4281  hypothetical protein  25.36 
 
 		 146 aa  42  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4049  alkaline phosphatase  31.69 
 
 		 213 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.257312  hitchhiker  0.00220744 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.15 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2975  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 216 aa  41.2  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0123855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3535  hypothetical protein  26.47 
 
 		 145 aa  41.2  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3343  membrane protein  24.84 
 
 		 214 aa  41.2  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>