More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0545 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0545  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.756199 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1284  ABC transporter related  87.61 
 
 		 234 aa  407  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.275207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1446  ABC transporter related  87.61 
 
 		 234 aa  407  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0771597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3554  ABC transporter related  86.32 
 
 		 234 aa  402  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.256863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2027  ABC transporter related  87.18 
 
 		 234 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.813889  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3737  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  75.64 
 
 		 234 aa  347  1e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.548098  normal  0.605749 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5861  ABC transporter related  65.55 
 
 		 250 aa  298  5e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0731407 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3002  ABC transporter related  47.44 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2028  ABC transporter related  48.93 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5724  ABC transporter related  48.94 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6088  ABC transporter related  48.94 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.89804  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0175  ABC transporter related  48.95 
 
 		 259 aa  214  9e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154822  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6571  ABC transporter related  48.51 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.177691  normal  0.0408481 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4754  ABC transporter-related protein  50.64 
 
 		 234 aa  213  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3827  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4904  ABC transporter related  49.79 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1177  ABC transporter related  51.07 
 
 		 236 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.496575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0157  ABC transporter related  48.12 
 
 		 259 aa  212  3.9999999999999995e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  47.01 
 
 		 237 aa  212  4.9999999999999996e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3676  putative branched-chain amino acid transport system ATP-binding protein  47.44 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.399578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2929  ABC transporter related  48.72 
 
 		 230 aa  209  3e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1858  ABC transporter-related protein  44.02 
 
 		 237 aa  209  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0050  ABC transporter related  46.93 
 
 		 232 aa  209  4e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.906419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1896  ABC transporter related  47.01 
 
 		 237 aa  208  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.02479 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  46.78 
 
 		 256 aa  207  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  45.8 
 
 		 238 aa  207  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1403  ABC transporter related  44.02 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.668018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2562  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  46.38 
 
 		 233 aa  206  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0225  ABC transporter related  42.13 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.633175  normal  0.041415 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  44.16 
 
 		 234 aa  206  3e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  44.16 
 
 		 236 aa  206  3e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4448  ABC transporter related  45.73 
 
 		 244 aa  206  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.186426  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8051  ABC transporter related  45.73 
 
 		 244 aa  205  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3456  ABC transporter related  46.81 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  46.75 
 
 		 238 aa  204  6e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  48.29 
 
 		 235 aa  205  6e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2845  ABC transporter-related protein  45.76 
 
 		 253 aa  204  7e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0734764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1585  ABC transporter related  47.66 
 
 		 237 aa  204  8e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.230089  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  44.21 
 
 		 237 aa  203  1e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1048  ABC transporter related  46.38 
 
 		 236 aa  204  1e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  46.58 
 
 		 234 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0615  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  44.87 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0661  ABC transporter related  44.87 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.579097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6570  ABC transporter related  45.53 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0192562  normal  0.0138442 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2979  ABC transporter related  46.58 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 259 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0655  ABC transporter related  44.87 
 
 		 231 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.139364 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0056  ABC transporter related  47.01 
 
 		 246 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.679259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3245  ABC transporter related  45.3 
 
 		 246 aa  202  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0694781  normal  0.303257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  46.75 
 
 		 245 aa  202  3e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6027  ABC transporter related  48.94 
 
 		 236 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5837  ABC transporter related  48.05 
 
 		 234 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984285 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3423  ABC transporter related  45.73 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1400  ABC transporter related  47.88 
 
 		 251 aa  201  6e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4185  ABC transporter related protein  48.51 
 
 		 238 aa  201  7e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0263202  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2891  ABC transporter related protein  46.15 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3016  ABC transporter related  46.19 
 
 		 247 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.498705  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3062  ABC transporter related  46.19 
 
 		 247 aa  201  8e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.534019 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2574  ABC transporter related  43.22 
 
 		 231 aa  201  9e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.261355  normal  0.546641 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  43.16 
 
 		 234 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1570  ABC transporter related  41.45 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.687597 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3053  ABC transporter related protein  44.83 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3031  ABC transporter related  46.19 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0358479  normal  0.333299 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3462  ABC transporter related  46.81 
 
 		 235 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4922  ABC transporter related  43.78 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000104533  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3570  ABC transporter related  44.92 
 
 		 247 aa  201  9.999999999999999e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0703152 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  44.02 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1436  ABC transporter related  46.67 
 
 		 237 aa  199  1.9999999999999998e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.450427 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4027  ABC transporter related  44.44 
 
 		 232 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.578971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0641  ABC transporter related  46.32 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3146  ABC transporter related  45.3 
 
 		 236 aa  199  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.823087 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4479  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  45.11 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00225011  hitchhiker  0.00953157 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1515  ABC transporter related  47.03 
 
 		 251 aa  199  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.274382  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  45.45 
 
 		 235 aa  199  5e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3295  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  47.42 
 
 		 232 aa  198  6e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123926  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3728  ABC transporter related  47.83 
 
 		 236 aa  198  6e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0255597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1209  ABC transporter related  46.98 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.093328  normal  0.473951 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0358  ABC transporter related  43.88 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3373  ABC transporter related  44.87 
 
 		 236 aa  198  7e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.710585  normal  0.0235657 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1835  ABC transporter related  45.76 
 
 		 238 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4061  ABC transporter related  43.93 
 
 		 252 aa  197  7.999999999999999e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.245646 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  43.78 
 
 		 234 aa  198  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0537  ABC transporter related  42.86 
 
 		 249 aa  197  7.999999999999999e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.135709  unclonable  0.0000000163343 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1473  ABC transporter related  42.31 
 
 		 236 aa  197  7.999999999999999e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3521  ABC transporter related  49.77 
 
 		 236 aa  197  7.999999999999999e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.295541  normal  0.330218 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1946  ABC transporter related protein  43.97 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.987949  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0395  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 		 234 aa  197  1.0000000000000001e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2269  ABC transporter related  43.72 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2518  ABC transporter related  43.16 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.778502  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5991  branched chain amino acid ABC tranpsorter ATP-binding protein  45.89 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.110822 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2387  ABC transporter related  42.31 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0332278  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1793  ABC transporter related  42.8 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3056  ABC transporter related  43.22 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0387789  hitchhiker  0.000278383 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2330  ABC transporter related  43.16 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.109731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3208  ABC transporter related  43.16 
 
 		 231 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.365386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1606  ABC transporter related  43.59 
 
 		 239 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3290  ABC transporter related  46.95 
 
 		 232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.116153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1388  ABC transporter related  42.42 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0186  ABC transporter related  42.26 
 
 		 244 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5955  ABC transporter related  44.98 
 
 		 247 aa  196  3e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0145925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>