More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0526 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 668 aa  1379    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  49.93 
 
 		 648 aa  687    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  47.19 
 
 		 659 aa  615  1e-175  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  46.21 
 
 		 656 aa  611  1e-173  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  45.04 
 
 		 647 aa  575  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  45.9 
 
 		 619 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  45.33 
 
 		 647 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  44.53 
 
 		 647 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  44.68 
 
 		 647 aa  572  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  43.83 
 
 		 644 aa  571  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  44.38 
 
 		 647 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  45.25 
 
 		 626 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  43.88 
 
 		 647 aa  570  1e-161  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  45.02 
 
 		 647 aa  571  1e-161  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  45.25 
 
 		 626 aa  569  1e-161  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  44.38 
 
 		 649 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  41.93 
 
 		 645 aa  554  1e-156  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  45.29 
 
 		 630 aa  551  1e-155  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  42.88 
 
 		 647 aa  551  1e-155  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  41.57 
 
 		 669 aa  546  1e-154  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0413  DNA mismatch repair protein  38.39 
 
 		 630 aa  437  1e-121  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  35.98 
 
 		 644 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  37.12 
 
 		 639 aa  404  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  34.8 
 
 		 680 aa  405  1e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  37.14 
 
 		 640 aa  396  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  36.48 
 
 		 665 aa  397  1e-109  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  35 
 
 		 622 aa  391  1e-107  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  34.09 
 
 		 631 aa  377  1e-103  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  35.81 
 
 		 628 aa  379  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  35.74 
 
 		 612 aa  373  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  33.04 
 
 		 674 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  34.09 
 
 		 612 aa  372  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  34.2 
 
 		 605 aa  369  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  32.1 
 
 		 674 aa  369  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  34.09 
 
 		 605 aa  365  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  34.43 
 
 		 647 aa  364  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  34.2 
 
 		 603 aa  362  2e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  34.15 
 
 		 605 aa  360  4e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  33.43 
 
 		 692 aa  355  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  32.1 
 
 		 586 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  32.57 
 
 		 599 aa  352  1e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  33.78 
 
 		 650 aa  351  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  33.23 
 
 		 584 aa  346  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  33.54 
 
 		 622 aa  343  5.999999999999999e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 606 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  32.62 
 
 		 603 aa  342  2e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  33.69 
 
 		 602 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  34.29 
 
 		 623 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  31.59 
 
 		 632 aa  335  2e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  33.49 
 
 		 608 aa  333  8e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  32.5 
 
 		 670 aa  332  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  31.42 
 
 		 647 aa  331  2e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  34.34 
 
 		 641 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 		 625 aa  327  6e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  31.67 
 
 		 628 aa  326  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 		 611 aa  320  6e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1041  DNA mismatch repair protein MutL  30.96 
 
 		 606 aa  320  7e-86  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  30.97 
 
 		 608 aa  320  7.999999999999999e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  32.22 
 
 		 632 aa  318  3e-85  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3464  DNA mismatch repair protein MutL  32.25 
 
 		 692 aa  318  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0023  DNA mismatch repair protein MutL  31.31 
 
 		 621 aa  317  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000493473  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  30.84 
 
 		 644 aa  317  6e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 		 606 aa  316  9.999999999999999e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 		 632 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  33.69 
 
 		 595 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  31.59 
 
 		 685 aa  313  5.999999999999999e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  33.69 
 
 		 595 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  31.98 
 
 		 602 aa  313  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  33.53 
 
 		 633 aa  313  6.999999999999999e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  32.46 
 
 		 582 aa  313  7.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  33.38 
 
 		 632 aa  311  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 		 620 aa  312  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.24 
 
 		 641 aa  311  2e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  32.63 
 
 		 633 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  32.88 
 
 		 633 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  32.83 
 
 		 601 aa  310  6.999999999999999e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  29.3 
 
 		 692 aa  308  2.0000000000000002e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  31.74 
 
 		 630 aa  308  2.0000000000000002e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  33.64 
 
 		 582 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  31.33 
 
 		 623 aa  308  3e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  31.33 
 
 		 623 aa  308  3e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  32.72 
 
 		 629 aa  307  3e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  31.83 
 
 		 595 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  32.58 
 
 		 633 aa  307  3e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  33.04 
 
 		 661 aa  305  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  48.91 
 
 		 620 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0821  DNA mismatch repair protein MutL  31.84 
 
 		 630 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000117941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  31.26 
 
 		 607 aa  305  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  30.95 
 
 		 617 aa  303  5.000000000000001e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  31.63 
 
 		 597 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  32.53 
 
 		 628 aa  303  5.000000000000001e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  29.74 
 
 		 623 aa  303  6.000000000000001e-81  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  30.15 
 
 		 626 aa  303  7.000000000000001e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  32.2 
 
 		 687 aa  302  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3811  DNA mismatch repair protein MutL  30.87 
 
 		 629 aa  301  3e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.248482 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  32.22 
 
 		 652 aa  300  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  32.62 
 
 		 643 aa  300  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 635 aa  300  6e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  45.28 
 
 		 755 aa  300  7e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  30.66 
 
 		 637 aa  299  1e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>