285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_4344 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_4344  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  100 
 
 		 303 aa  601  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3634  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  68.9 
 
 		 325 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3761  ornithine cyclodeaminase  67.45 
 
 		 310 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1829  ornithine cyclodeaminase  49.5 
 
 		 320 aa  258  1e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.215124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1386  ornithine cyclodeaminase  44.48 
 
 		 320 aa  238  1e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  0.779012 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3715  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.62 
 
 		 305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.245475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4227  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.46 
 
 		 304 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4650  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.46 
 
 		 304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  39.56 
 
 		 302 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  30.94 
 
 		 342 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  31 
 
 		 316 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 		 318 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  30.84 
 
 		 332 aa  123  4e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  31.68 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  31.51 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.17 
 
 		 319 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  27.84 
 
 		 318 aa  117  1.9999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  33.59 
 
 		 314 aa  116  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  31.06 
 
 		 325 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  31.06 
 
 		 325 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  29.87 
 
 		 332 aa  115  6e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  30.34 
 
 		 325 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  27.95 
 
 		 317 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  30.15 
 
 		 325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  31.44 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 		 325 aa  113  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  29.77 
 
 		 325 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  32.8 
 
 		 329 aa  112  9e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  29.6 
 
 		 316 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  36.64 
 
 		 328 aa  110  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  31.2 
 
 		 325 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1566  ornithine cyclodeaminase  31.39 
 
 		 331 aa  109  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  32.99 
 
 		 327 aa  109  6e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03150  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  37.17 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2787  Ornithine cyclodeaminase  32.94 
 
 		 336 aa  105  6e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0191  ornithine cyclodeaminase  30.87 
 
 		 312 aa  105  9e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0529745 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  27.45 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  27.53 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 333 aa  105  1e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3771  ornithine cyclodeaminase  36.74 
 
 		 365 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.857304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  26.69 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7814  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  35.16 
 
 		 348 aa  103  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  27.56 
 
 		 324 aa  103  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  27.44 
 
 		 319 aa  102  6e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  33.85 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3170  ornithine cyclodeaminase  30.19 
 
 		 315 aa  101  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2955  ornithine cyclodeaminase  31.23 
 
 		 314 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0527705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  30.97 
 
 		 319 aa  100  4e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1455  ornithine cyclodeaminase  29.62 
 
 		 316 aa  99.4  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  32.02 
 
 		 326 aa  99  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  33.46 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.3 
 
 		 328 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  29.59 
 
 		 338 aa  97.8  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1052  ornithine cyclodeaminase  36.53 
 
 		 346 aa  98.2  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.789796  normal  0.061777 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  28.17 
 
 		 319 aa  97.1  3e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5043  Ornithine cyclodeaminase  28.98 
 
 		 319 aa  96.7  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0731505  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3726  ornithine cyclodeaminase  30.34 
 
 		 318 aa  96.7  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  29.35 
 
 		 326 aa  96.3  6e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  30 
 
 		 333 aa  95.5  9e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2946  ornithine cyclodeaminase  35.85 
 
 		 358 aa  95.5  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.914602 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  35.9 
 
 		 319 aa  95.1  1e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2200  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  37.18 
 
 		 313 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2392  ornithine cyclodeaminase  34.27 
 
 		 350 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.820594 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0682  ornithine cyclodeaminase  37.28 
 
 		 357 aa  94  3e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06630  ornithine cyclodeaminase  34.58 
 
 		 340 aa  93.2  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.859061  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  31.08 
 
 		 336 aa  93.6  4e-18  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  35.85 
 
 		 329 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3992  ornithine cyclodeaminase  33.89 
 
 		 323 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.100495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1976  Ornithine cyclodeaminase  34.8 
 
 		 350 aa  92.8  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.100827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3083  ornithine cyclodeaminase  29.47 
 
 		 344 aa  92.8  7e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6207  ornithine cyclodeaminase  32.59 
 
 		 321 aa  92.4  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0455278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  33.2 
 
 		 354 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00361  ornithine cyclodeaminase  35.51 
 
 		 349 aa  92.4  9e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  27.43 
 
 		 340 aa  92.4  9e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5979  ornithine cyclodeaminase  32.55 
 
 		 351 aa  91.7  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04330  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  31.21 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.861698 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4262  ornithine cyclodeaminase  28.43 
 
 		 335 aa  90.5  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2605  ornithine cyclodeaminase  32.89 
 
 		 321 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00162792  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5760  ornithine cyclodeaminase  35.8 
 
 		 314 aa  90.5  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.342244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3533  ornithine cyclodeaminase  34.29 
 
 		 350 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2240  ornithine cyclodeaminase  34.29 
 
 		 350 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.894904 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0890  ornithine cyclodeaminase  26.51 
 
 		 330 aa  89.7  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.506898 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4368  ornithine cyclodeaminase  30.53 
 
 		 321 aa  89.7  5e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  33.33 
 
 		 330 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2503  ornithine cyclodeaminase  33.02 
 
 		 315 aa  89.4  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.533208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3506  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.63 
 
 		 310 aa  89.4  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.639111  normal  0.353812 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  29.96 
 
 		 321 aa  89.4  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  27.71 
 
 		 329 aa  88.6  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  29.02 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2415  ornithine cyclodeaminase  36.2 
 
 		 322 aa  88.6  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.151404  normal  0.117495 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  27.93 
 
 		 319 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4333  ornithine cyclodeaminase  32.72 
 
 		 352 aa  88.2  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5996  ornithine cyclodeaminase  34.33 
 
 		 308 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal  0.0952777 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  31.25 
 
 		 345 aa  88.6  1e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64850  ornithine cyclodeaminase  34.77 
 
 		 297 aa  87.4  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000404548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  30.53 
 
 		 323 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4602  ornithine cyclodeaminase  33.19 
 
 		 365 aa  87  3e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  32.89 
 
 		 315 aa  87  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>