More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3257 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3257  chloride channel core  100 
 
 		 446 aa  863    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3820  Cl- channel, voltage-gated family protein  58.67 
 
 		 454 aa  459  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0706898  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4712  Cl- channel, voltage-gated family protein  58.45 
 
 		 470 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6335  Chloride channel core  59.27 
 
 		 456 aa  444  1e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333909  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0110  voltage gated chloride channel family protein  60.81 
 
 		 485 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0419274  hitchhiker  0.00996162 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5838  chloride channel core  56.75 
 
 		 485 aa  433  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697782 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1155  Cl- channel, voltage gated  53.55 
 
 		 440 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.599671  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0848  Cl- channel, voltage-gated family protein  44.21 
 
 		 521 aa  293  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.17126  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0860  chloride channel core  44.52 
 
 		 565 aa  290  4e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2411  chloride channel core  45 
 
 		 517 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1059  Chloride channel core  43.79 
 
 		 474 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0948  chloride channel core  43.75 
 
 		 520 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0509  Cl- channel, voltage gated  43.75 
 
 		 518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0988  Cl- channel, voltage-gated family protein  43.75 
 
 		 518 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.170879  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4091  Cl- channel, voltage gated  43.57 
 
 		 513 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0815105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1573  voltage gated chloride channel family protein  44 
 
 		 563 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.556285  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2667  putative chloride-channel protein  43.43 
 
 		 447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5024  chloride channel core  44.24 
 
 		 435 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.283632  normal  0.200334 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1380  Chloride channel core  48.15 
 
 		 523 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.332238  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3866  Chloride channel core  43.39 
 
 		 435 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.556121 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3980  Chloride channel core  43.39 
 
 		 435 aa  269  8.999999999999999e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2109  voltage gated chloride channel family protein  43.76 
 
 		 551 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.732554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2964  voltage gated chloride channel family protein  43.76 
 
 		 562 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3029  chloride channel (ClC) family protein  43.76 
 
 		 578 aa  266  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0803  chloride channel (ClC) family protein  43.76 
 
 		 576 aa  267  4e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.781584  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2635  chloride channel (ClC) family protein  43.76 
 
 		 560 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3062  voltage gated chloride channel family protein  43.76 
 
 		 576 aa  266  5e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1977  chloride channel (ClC) family protein  43.76 
 
 		 560 aa  266  5e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6367  Chloride channel core  44.44 
 
 		 441 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0660  chloride channel core  41.67 
 
 		 485 aa  258  1e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.695523 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6573  Cl- channel, voltage gated  42.92 
 
 		 439 aa  258  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.939375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0608  Chloride channel core  41.19 
 
 		 468 aa  253  4.0000000000000004e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.277563  hitchhiker  0.00926023 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0697  Cl- channel, voltage gated  42.55 
 
 		 439 aa  248  1e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3051  chloride channel core  40.71 
 
 		 449 aa  243  7e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.156315  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3353  Chloride channel core  43.34 
 
 		 441 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.641112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0773  Chloride channel core  41.8 
 
 		 444 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.80393  normal  0.191961 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5041  putative H(+)/Cl(-) exchange transporter  45.07 
 
 		 445 aa  236  7e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0350  voltage gated chloride channel family protein  39.34 
 
 		 451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.973552  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0318  voltage gated chloride channel family protein  39.34 
 
 		 490 aa  233  4.0000000000000004e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4474  Chloride channel core  42.67 
 
 		 424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.125667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1139  chloride channel protein  41.3 
 
 		 440 aa  228  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1046  Cl- channel, voltage gated  39.5 
 
 		 449 aa  227  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.0017165  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6686  Chloride channel core  47.43 
 
 		 438 aa  226  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.709238  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3760  chloride channel core  40.47 
 
 		 459 aa  225  1e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.503672  normal  0.147153 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3157  chloride channel core  41.14 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.236304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3481  Chloride channel core  41.36 
 
 		 441 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.429207  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7107  Chloride channel core  38.26 
 
 		 447 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134894 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0957  chloride channel core  40.64 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0796788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5405  Chloride channel core  42.89 
 
 		 437 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0213924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5971  Chloride channel core  38.04 
 
 		 447 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.306058  normal  0.236498 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3825  Chloride channel core  37.88 
 
 		 447 aa  212  1e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6166  chloride channel core  46.26 
 
 		 438 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0747104  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04784  chloride channel  36.77 
 
 		 464 aa  207  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.147054  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4258  Chloride channel core  41.83 
 
 		 445 aa  206  7e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3213  Cl- channel, voltage gated  37.42 
 
 		 522 aa  205  1e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3055  Cl- channel, voltage gated  39.15 
 
 		 506 aa  203  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.938884  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3037  Cl- channel, voltage-gated family protein  39.04 
 
 		 441 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1638  Cl- channel, voltage-gated family protein  34.56 
 
 		 436 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3959  voltage-gated chloride channel family protein  38.56 
 
 		 453 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.536311 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1867  chloride channel, core  38.56 
 
 		 453 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.144395 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1500  Cl- channel, voltage gated  38.2 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3116  chloride channel protein  30.77 
 
 		 453 aa  154  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.958796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5803  Cl- channel voltage-gated family protein  30.5 
 
 		 466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0706283  normal  0.393732 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1863  Cl- channel, voltage gated  29.8 
 
 		 569 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2944  Cl- channel, voltage-gated family protein  29.28 
 
 		 526 aa  111  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0120087  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A25  chloride channel protein EriC  29.91 
 
 		 510 aa  111  3e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3102  chloride channel protein  28.92 
 
 		 471 aa  106  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3525  Chloride channel core  28.5 
 
 		 533 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0695  chloride channel protein  28.53 
 
 		 466 aa  105  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.750689  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1877  Cl- channel voltage-gated family protein  30.52 
 
 		 859 aa  104  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0240  chloride channel protein  27.39 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0226  chloride channel protein  27.2 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  32.41 
 
 		 897 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0241  chloride channel protein  27.39 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0165964  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0223  chloride channel protein  27.39 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.230311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0224  chloride channel protein  27.2 
 
 		 473 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.154288  normal  0.638237 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2810  chloride channel protein  30.61 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0782  chloride channel protein  28.57 
 
 		 479 aa  99  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.12239 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1576  chloride channel protein  29.62 
 
 		 463 aa  98.2  2e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.803836 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2409  Chloride channel core  33.07 
 
 		 435 aa  99  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2173  voltage-gated chloride channel family protein  27.4 
 
 		 519 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1102  Cl- channel voltage-gated family protein  29.71 
 
 		 584 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0866  chloride channel protein  28.8 
 
 		 470 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0280286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  31.7 
 
 		 862 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1884  voltage gated chloride channel family protein  27.5 
 
 		 519 aa  96.3  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2188  Chloride channel core  27.59 
 
 		 563 aa  95.1  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000751746  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14511  chloride channel  29.79 
 
 		 455 aa  94.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4266  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.39 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89307  normal  0.948351 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4427  Cl- channel, voltage-gated family protein  32.39 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.292219 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4200  Cl- channel, voltage gated  32.39 
 
 		 439 aa  94.4  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.419413  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0993  chloride channel protein  27.49 
 
 		 478 aa  93.6  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3458  chloride channel protein  27.49 
 
 		 478 aa  93.6  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.41349  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3591  Chloride channel core  32.24 
 
 		 875 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0274826 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3329  chloride channel protein  27.49 
 
 		 478 aa  93.2  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0681  Chloride channel core  25.4 
 
 		 538 aa  93.2  9e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  28.77 
 
 		 863 aa  91.3  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2501  Cl- channel, voltage gated  31.75 
 
 		 626 aa  90.9  4e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.169723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0762  chloride channel core  30.73 
 
 		 518 aa  90.9  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000775923  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2437  chloride channel core  31.02 
 
 		 629 aa  90.5  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.276438  normal  0.470563 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1588  CBS  34.48 
 
 		 859 aa  89.7  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.497223  normal  0.185787 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>