More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1206 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1206  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 239 aa  473  1e-132  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2715  ABC transporter related  84.1 
 
 		 239 aa  393  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00707444  normal  0.389389 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4110  ABC transporter related  76.57 
 
 		 239 aa  363  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.389501 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0791  ABC transporter-related protein  41.46 
 
 		 248 aa  185  5e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.323414 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2457  ABC transporter related  40.16 
 
 		 250 aa  183  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0989  ABC transporter related  40.98 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000217247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1945  ABC transporter related protein  40.32 
 
 		 257 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  37.3 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0638  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 260 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0293111  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0735  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  40.4 
 
 		 256 aa  177  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2270  ABC transporter related  39.53 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.881925 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  38 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0536  ABC transporter related  36.65 
 
 		 281 aa  175  4e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.508685  unclonable  0.0000000200352 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4001  ABC transporter related  41.04 
 
 		 251 aa  176  4e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.172922  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  43.04 
 
 		 237 aa  175  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1128  ABC transporter related  38.34 
 
 		 256 aa  174  8e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.79034  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1894  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  37.6 
 
 		 286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0274473  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1607  ABC transporter related  35.69 
 
 		 284 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.714039  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3828  ABC transporter related  37.8 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4905  ABC transporter related  37.8 
 
 		 256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  36.11 
 
 		 255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  36.51 
 
 		 265 aa  172  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  35.2 
 
 		 256 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4208  ABC transporter related  43.88 
 
 		 246 aa  172  3.9999999999999995e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.154178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5130  ABC transporter related  37.5 
 
 		 250 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0104997 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1904  ABC transporter related  39.52 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.410553 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4478  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP binding protein  37.6 
 
 		 255 aa  171  7.999999999999999e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00423389  hitchhiker  0.00964914 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1723  ABC transporter related  38.58 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1571  ABC transporter related  39.24 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.98621  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4269  ABC transporter related  36.8 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4567  ABC transporter related  38.82 
 
 		 249 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.129201  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2932  ABC transporter related  35.2 
 
 		 263 aa  169  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1673  ABC transporter related  35.32 
 
 		 284 aa  170  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0051  ABC transporter related  37.7 
 
 		 258 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.454909  normal  0.935977 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0185  ABC transporter related  36.21 
 
 		 268 aa  170  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  34.8 
 
 		 259 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  37.6 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1172  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.69 
 
 		 255 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.333486  normal  0.875323 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3132  ABC transporter related  39.52 
 
 		 251 aa  169  3e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  35.18 
 
 		 252 aa  169  3e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3209  ABC transporter related  34.4 
 
 		 253 aa  169  3e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.271169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  36.51 
 
 		 264 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1577  ABC transporter related  38.82 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.412838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2931  ABC transporter-related protein  38.93 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.382842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4923  ABC transporter related  36.25 
 
 		 264 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000671765  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2425  ABC transporter-related protein  40.49 
 
 		 608 aa  168  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.630273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1155  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.69 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0154079 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4485  ABC transporter related  41.8 
 
 		 264 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1565  ABC transporter related  41.1 
 
 		 246 aa  167  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1981  ABC transporter related protein  40.16 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1138  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.29 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.523299  normal  0.117665 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4217  ABC transporter related  38.84 
 
 		 260 aa  167  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0739843 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  38.49 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4659  ABC transporter related  38.15 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.823141 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3086  ABC transporter related  38.46 
 
 		 258 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.983712  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6571  ABC transporter related  37.6 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0185453  normal  0.0225757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2792  ABC transporter related protein  42.55 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0178  ABC transporter related  41.7 
 
 		 249 aa  167  1e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4016  ABC transporter related  41.35 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0616  branched chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.11 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1753  amino-acid ATP-binding ABC transporter protein  39.34 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.50264  normal  0.705877 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2376  ABC transporter-like protein  39.15 
 
 		 251 aa  167  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4279  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.69 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.667482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1245  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.29 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592579 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1451  ABC transporter related  38.52 
 
 		 266 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0342777  hitchhiker  0.000812004 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1619  ABC transporter related  39.92 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5147  ABC transporter related  37.2 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.428742 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2477  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  36.61 
 
 		 255 aa  166  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0920701 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0656  ABC transporter related  36.11 
 
 		 250 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.561275  normal  0.139906 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2553  ABC transporter related  36.8 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  34.8 
 
 		 266 aa  166  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1754  ABC transporter related  38.31 
 
 		 621 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4747  ABC transporter related  37.3 
 
 		 253 aa  166  2.9999999999999998e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2388  ABC transporter related  37.25 
 
 		 259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0199374  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2927  ABC transporter related  37.75 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0722568  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4368  ABC transporter related  37.35 
 
 		 252 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.324003  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0662  ABC transporter related  36.11 
 
 		 251 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.289976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2892  ABC transporter related protein  35.18 
 
 		 266 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  41.77 
 
 		 262 aa  166  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2575  ABC transporter related  38.15 
 
 		 258 aa  166  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2563  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.2 
 
 		 255 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0268  ABC transporter related  36.61 
 
 		 265 aa  166  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00395976  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4779  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.87 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00385754  normal  0.485127 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0267  ABC transporter related  40.08 
 
 		 598 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.59454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1492  ABC transporter related  38.11 
 
 		 262 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.221725  normal  0.375358 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0330  ABC transporter related  38.4 
 
 		 292 aa  165  6.9999999999999995e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2809  ABC transporter related  35.77 
 
 		 625 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.194078  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3727  ABC transporter related  38.27 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.141093  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  34.14 
 
 		 254 aa  164  8e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5344  ABC transporter related  39 
 
 		 244 aa  164  8e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11155  normal  0.477551 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1563  ABC transporter related protein  36.48 
 
 		 259 aa  164  9e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1840  ABC transporter related  37.35 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.260615 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4413  ABC transporter related  38.4 
 
 		 270 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2442  ABC transporter related protein  40.96 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3848  leucine/isoleucine/valine transporter ATP-binding subunit  35.69 
 
 		 255 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0319236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4046  ABC transporter related  38.34 
 
 		 251 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3859  ABC transporter related protein  42.26 
 
 		 924 aa  163  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4258  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  38.4 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805071  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1584  ABC transporter related  36.8 
 
 		 255 aa  164  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.391737  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4701  ABC transporter related  38.78 
 
 		 840 aa  163  2.0000000000000002e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.676085  normal  0.601296 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>