More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1981 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1981  ABC transporter related protein  100 
 
 		 249 aa  481  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4736  ABC transporter related  61.04 
 
 		 268 aa  242  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1864  ABC transporter related  45.16 
 
 		 251 aa  221  9e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3868  ABC transporter related  52.17 
 
 		 237 aa  218  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.25715 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1820  ABC transporter-related protein  45.2 
 
 		 250 aa  211  1e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2127  ABC transporter related  43.55 
 
 		 250 aa  208  5e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2041  ABC transporter related  44.8 
 
 		 250 aa  207  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000871582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1674  ABC transporter related  45.16 
 
 		 251 aa  206  3e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2186  ABC transporter related protein  43.6 
 
 		 250 aa  204  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0935  ABC transporter related  40.96 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000526687  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4016  ABC transporter related  48.79 
 
 		 272 aa  204  1e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4175  ABC transporter related  43.48 
 
 		 276 aa  201  8e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1385  ABC transporter related  38.96 
 
 		 256 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0857  ABC transporter related  43.87 
 
 		 257 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2502  ABC transporter related protein  43.15 
 
 		 254 aa  199  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2431  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 252 aa  198  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103052  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4072  ABC transporter related  45.06 
 
 		 261 aa  198  7e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0355  ABC transporter related  43.55 
 
 		 258 aa  197  1.0000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.435146 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0591  ABC transporter related  43.55 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.682257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0799  ABC transporter related  43.95 
 
 		 258 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000404  putative high-affinity branched-chain amino acid transport ATP-binding protein  41.67 
 
 		 266 aa  196  2.0000000000000003e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.428911  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5714  putative high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.69 
 
 		 273 aa  196  3e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.645386  normal  0.906173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1561  ABC transporter related  43.08 
 
 		 282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1570  ABC transporter related  43.08 
 
 		 275 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.269529 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5146  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (branched chain amino acid)  44.05 
 
 		 296 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.156661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2959  leucine/isoleucine/valine transport system ATP- binding protein  41.94 
 
 		 271 aa  195  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3395  ABC transporter related  46.27 
 
 		 956 aa  195  7e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0032  ABC transporter related  46.18 
 
 		 294 aa  194  8.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8310  ABC transporter related  47.18 
 
 		 277 aa  194  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.575602 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4571  ABC transporter related  42.69 
 
 		 296 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1783  ABC-type branched-chain amino acid transport systems ATPase component  46 
 
 		 264 aa  194  1e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0473168  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5827  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  43.15 
 
 		 258 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.467339  normal  0.146478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5693  ABC transporter related  48.03 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0261  ATPase  44.35 
 
 		 255 aa  193  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2520  ABC transporter related  43.15 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3102  ABC transporter related protein  45.06 
 
 		 256 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2237  ABC transporter related  39.69 
 
 		 255 aa  193  3e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.945618  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1884  ABC transporter related  43.15 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2495  ABC transporter related  43.15 
 
 		 258 aa  192  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0402  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.37 
 
 		 254 aa  192  4e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.869027  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2753  ABC transporter related  43.55 
 
 		 255 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0111  ABC transporter related  46.8 
 
 		 257 aa  192  5e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.683249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2423  ABC transporter related  40.16 
 
 		 269 aa  192  6e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0622  ABC transporter related  41.77 
 
 		 269 aa  191  7e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.105631  normal  0.0623344 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0614  ABC transporter related  41.5 
 
 		 259 aa  191  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2954  ABC transporter related  45.16 
 
 		 280 aa  191  7e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.824965  normal  0.161436 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1731  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  43.6 
 
 		 250 aa  191  8e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.385774  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3417  putative branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.65888  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1579  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 254 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0478  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000496209  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0642  ABC transporter related  45.82 
 
 		 278 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4421  ABC transporter related  43.65 
 
 		 259 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4755  ABC transporter related  43.15 
 
 		 258 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1860  ABC transporter related  40.48 
 
 		 280 aa  191  1e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.400828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1831  ABC transporter related  39.44 
 
 		 269 aa  191  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3205  ABC transporter related  43.15 
 
 		 255 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1472  ABC transporter-like protein  42.74 
 
 		 261 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.723691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4097  ABC transporter related  44.88 
 
 		 292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.362688  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0407  ABC transporter-like protein  44.98 
 
 		 273 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.382796 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3137  ABC transporter-related protein  40.16 
 
 		 265 aa  189  4e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.489025 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2251  ABC transporter related  43.15 
 
 		 255 aa  189  4e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5836  ABC transporter related  46.46 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0011865 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3054  ABC transporter related protein  39.36 
 
 		 259 aa  189  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0546  ABC transporter related  40.96 
 
 		 270 aa  188  5.999999999999999e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1727  ABC transporter related  44.49 
 
 		 257 aa  188  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0613  ABC transporter related  42.57 
 
 		 259 aa  188  7e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4062  ABC transporter related  41.77 
 
 		 289 aa  188  8e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3555  ABC transporter related  42.58 
 
 		 265 aa  188  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.520716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0261  ABC transporter related  40.96 
 
 		 306 aa  188  9e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1968  ABC transporter related  45.6 
 
 		 827 aa  188  9e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.140835  normal  0.0336357 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1653  ABC transporter related protein  44.62 
 
 		 610 aa  187  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0487091  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0463  ABC transporter related protein  36.55 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3290  hypothetical protein  42.29 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0159101 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1895  ABC transporter related  42.23 
 
 		 264 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.045423 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1472  ABC transporter related  40.07 
 
 		 288 aa  186  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2856  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00458274  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2611  ABC transporter-related protein  39.76 
 
 		 265 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0401  ABC transporter related  41.67 
 
 		 277 aa  187  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1389  ABC transporter related  41.83 
 
 		 256 aa  186  3e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0215  ABC transporter-related protein  40.96 
 
 		 313 aa  186  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4594  ABC transporter related protein  46.77 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3510  ABC transporter component  43.53 
 
 		 274 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.850532  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3533  ABC transporter related  38.25 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.594682  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0890  ABC transporter related  43.15 
 
 		 262 aa  186  4e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1034  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.76 
 
 		 256 aa  185  5e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.634603  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2029  ABC transporter related  48.19 
 
 		 261 aa  185  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0296  ABC transporter related  41.9 
 
 		 269 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0141833  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3250  ABC transporter related  40.93 
 
 		 261 aa  185  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.297027  normal  0.286645 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3032  ABC transporter related  43.15 
 
 		 275 aa  185  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.178784  normal  0.334419 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3488  ABC transporter related protein  44.35 
 
 		 244 aa  184  9e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3834  ABC transporter related  44.4 
 
 		 258 aa  184  9e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.185359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3017  ABC transporter related  43.15 
 
 		 275 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.289222  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5338  ABC transporter related  44.76 
 
 		 823 aa  184  9e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.591038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3063  ABC transporter related  43.15 
 
 		 275 aa  184  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.542546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5999  ABC transporter related protein  43.95 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.357239  normal  0.0205889 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2724  ABC transporter related  39.36 
 
 		 277 aa  184  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.407856 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  40.87 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  40.87 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0773  high affinity branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.36 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.69143  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2978  ABC transporter related  41.04 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>