More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0319 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  50 
 
 		 713 aa  688    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  51.69 
 
 		 722 aa  717    Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  50.78 
 
 		 716 aa  708    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.54 
 
 		 722 aa  655    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.83 
 
 		 722 aa  714    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  49.66 
 
 		 722 aa  662    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  63.88 
 
 		 720 aa  892    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  51.69 
 
 		 722 aa  713    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  51.83 
 
 		 724 aa  711    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  51.83 
 
 		 724 aa  711    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  51.83 
 
 		 724 aa  711    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.35 
 
 		 724 aa  689    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.52 
 
 		 726 aa  728    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  50.92 
 
 		 718 aa  667    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  49.58 
 
 		 721 aa  669    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.05 
 
 		 713 aa  702    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  51.69 
 
 		 722 aa  709    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  51.54 
 
 		 724 aa  713    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.32 
 
 		 716 aa  725    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  50.49 
 
 		 713 aa  691    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.26 
 
 		 722 aa  708    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  51.83 
 
 		 722 aa  711    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  48.9 
 
 		 720 aa  666    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  48.9 
 
 		 720 aa  664    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  52.62 
 
 		 721 aa  704    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  52.25 
 
 		 722 aa  725    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  100 
 
 		 713 aa  1429    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  50.63 
 
 		 730 aa  704    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  65.12 
 
 		 710 aa  918    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  48.1 
 
 		 712 aa  650    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  48.8 
 
 		 718 aa  662    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  50.42 
 
 		 718 aa  678    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  51.32 
 
 		 716 aa  725    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  49.93 
 
 		 722 aa  659    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  52.92 
 
 		 728 aa  696    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  46.86 
 
 		 717 aa  622  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  46.94 
 
 		 761 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.92 
 
 		 706 aa  614  9.999999999999999e-175  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  45.99 
 
 		 727 aa  609  1e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  47.16 
 
 		 762 aa  611  1e-173  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0182  RNA binding S1  47.41 
 
 		 757 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.000000000267713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  47.8 
 
 		 721 aa  600  1e-170  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  46.99 
 
 		 777 aa  598  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.72 
 
 		 720 aa  599  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  46.99 
 
 		 788 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.2 
 
 		 780 aa  595  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  46.52 
 
 		 762 aa  590  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  46.65 
 
 		 787 aa  591  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  46.25 
 
 		 779 aa  587  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  46.09 
 
 		 802 aa  587  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.06 
 
 		 723 aa  588  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  45.09 
 
 		 773 aa  585  1.0000000000000001e-165  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  45.67 
 
 		 774 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  45.67 
 
 		 774 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  45.67 
 
 		 821 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  45.67 
 
 		 774 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  45.53 
 
 		 781 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  45.67 
 
 		 774 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  45.67 
 
 		 774 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  45.8 
 
 		 782 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  45.67 
 
 		 774 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0358  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.83 
 
 		 774 aa  580  1e-164  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  46.4 
 
 		 772 aa  579  1e-164  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00618  transcriptional accessory protein  45.42 
 
 		 766 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.79 
 
 		 812 aa  579  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05040  transcriptional accessory protein  46.18 
 
 		 770 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.948642  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.79 
 
 		 815 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  45.79 
 
 		 774 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  45.24 
 
 		 775 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.78 
 
 		 813 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  44.38 
 
 		 773 aa  578  1.0000000000000001e-163  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  45.66 
 
 		 815 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1736  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.78 
 
 		 774 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.605663  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  45.66 
 
 		 774 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  46.01 
 
 		 705 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2628  Tex-like protein protein-like protein  44.84 
 
 		 801 aa  572  1.0000000000000001e-162  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.168465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  46.74 
 
 		 757 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1493  transcription accessory protein  45.06 
 
 		 767 aa  570  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0173  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.23 
 
 		 804 aa  572  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03989  Transcriptional accessory protein  44.86 
 
 		 788 aa  567  1e-160  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  43.76 
 
 		 784 aa  566  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3541  general secretion pathway protein J  44.61 
 
 		 772 aa  565  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.489396  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0259  RNA binding S1  43.62 
 
 		 782 aa  567  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4226  RNA binding S1  43.71 
 
 		 775 aa  565  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08480  transcriptional accessory protein  44.97 
 
 		 775 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.205113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0735  RNA binding S1 domain protein  43.33 
 
 		 773 aa  562  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.122852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3634  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.11 
 
 		 787 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.557462  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2746  hypothetical protein  45.9 
 
 		 789 aa  563  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  44.34 
 
 		 777 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3413  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.04 
 
 		 777 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.268774 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0908  transcriptional accessory protein  45.97 
 
 		 759 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000019173  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1222  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.98 
 
 		 784 aa  563  1.0000000000000001e-159  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.923017  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3402  RNA binding S1  44.04 
 
 		 777 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.702418  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  45.47 
 
 		 719 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0197  putative RNA binding protein  44.15 
 
 		 778 aa  563  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0364185  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  45.47 
 
 		 719 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3465  RNA-binding S1 domain-containing protein  44.04 
 
 		 777 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0520742 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1037  RNA binding S1  44.64 
 
 		 778 aa  561  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.255171  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5945  hypothetical protein  45.09 
 
 		 779 aa  560  1e-158  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.961122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0153  RNA-binding S1 domain-containing protein  43.41 
 
 		 802 aa  559  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>