63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3823 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  53.42 
 
 		 864 aa  712    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3031  glycoside hydrolase family 9  57.76 
 
 		 1105 aa  684    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1515  glycoside hydrolase family 9  52.42 
 
 		 1100 aa  711    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  53.7 
 
 		 851 aa  671    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.77 
 
 		 998 aa  752    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3823  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  100 
 
 		 786 aa  1591    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0142877  decreased coverage  0.00048804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2951  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  53.15 
 
 		 762 aa  707    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1418  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  44.02 
 
 		 927 aa  518  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  46.77 
 
 		 875 aa  512  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3563  glycoside hydrolase family 9  48.82 
 
 		 775 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  48.17 
 
 		 812 aa  483  1e-135  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0413  glycoside hydrolase family protein  43.41 
 
 		 1224 aa  466  9.999999999999999e-131  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0412  glycoside hydrolase family protein  44.26 
 
 		 895 aa  464  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000331233  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0649  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  41.76 
 
 		 867 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.387734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2392  glycoside hydrolase family 9  34.49 
 
 		 874 aa  417  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00520307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0732  glycoside hydrolase family 9  34.24 
 
 		 885 aa  412  1e-114  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2725  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  36.38 
 
 		 611 aa  305  2.0000000000000002e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.451738  normal  0.174242 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5683  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  30.92 
 
 		 582 aa  236  9e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.330334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0636  cellulase  30.05 
 
 		 578 aa  236  1.0000000000000001e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1655  endoglucanase  29.67 
 
 		 854 aa  224  4.9999999999999996e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1280  endoglucanase  28.31 
 
 		 571 aa  220  7e-56  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.567147  normal  0.398213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5052  glycoside hydrolase family 9  31.28 
 
 		 587 aa  218  5e-55  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.886971 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2226  glycoside hydrolase family 9  29.98 
 
 		 591 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0755  glycoside hydrolase family 9  28.69 
 
 		 646 aa  201  5e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.549048  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0825  glycoside hydrolase family protein  26.76 
 
 		 649 aa  186  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2621  glycoside hydrolase family 9 domain protein Ig domain protein  27.94 
 
 		 833 aa  169  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0624  glycoside hydrolase family protein  27.58 
 
 		 1601 aa  161  5e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2475  glycoside hydrolase family 9  27.32 
 
 		 537 aa  139  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3003  Cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.74 
 
 		 900 aa  122  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3130  glycoside hydrolase family protein  27.71 
 
 		 632 aa  96.7  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.070475 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4258  glycoside hydrolase family 9  24.23 
 
 		 621 aa  95.5  3e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.105749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2779  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 		 606 aa  86.7  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0558  regulatory protein, LacI  29.79 
 
 		 665 aa  85.9  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1335  endoglucanase-like protein  25.39 
 
 		 2042 aa  85.1  0.000000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0110821 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0675  Cellulase  24.4 
 
 		 1076 aa  85.1  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2105  glycoside hydrolase family 9  25.92 
 
 		 803 aa  79.3  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.867838  normal  0.536914 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0778  glycosylhydrolase family 9 protein  24.73 
 
 		 739 aa  78.6  0.0000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.225256 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  27.83 
 
 		 794 aa  78.6  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  25.65 
 
 		 880 aa  75.9  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4520  glycoside hydrolase family 9  25.44 
 
 		 906 aa  74.7  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.815518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  25.19 
 
 		 978 aa  74.3  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6813  glycoside hydrolase family 9  24.23 
 
 		 815 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.921794  hitchhiker  0.00389969 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0737  glycoside hydrolase family 9  24.69 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000624089  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0433  glycoside hydrolase family protein  22.5 
 
 		 789 aa  64.3  0.000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.371525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0274  glycoside hydrolase family protein  22.5 
 
 		 563 aa  63.5  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00113767  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0043  glycoside hydrolase family protein  22.1 
 
 		 742 aa  60.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2761  glycoside hydrolase family protein  22.2 
 
 		 707 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000261631  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0543  glycoside hydrolase family protein  23.01 
 
 		 739 aa  59.3  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0040  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.94 
 
 		 887 aa  58.2  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0753  glycoside hydrolase family 9  22.94 
 
 		 778 aa  57.4  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00604894  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2812  glycoside hydrolase family protein  23.28 
 
 		 611 aa  57  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.283645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0578  glycoside hydrolase family protein  22.61 
 
 		 736 aa  56.6  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0745  glycoside hydrolase family protein  23.25 
 
 		 730 aa  55.5  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0016  glycoside hydrolase family 9  24.18 
 
 		 990 aa  55.1  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.114686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  24.4 
 
 		 846 aa  51.6  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  24.8 
 
 		 894 aa  51.2  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2235  endoglucanase  22.2 
 
 		 570 aa  50.8  0.00008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5258  glycoside hydrolase family 9  25.6 
 
 		 653 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.35373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  25.38 
 
 		 847 aa  49.7  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0731  glycoside hydrolase family 9  22.22 
 
 		 725 aa  49.7  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3367  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  22.98 
 
 		 985 aa  47  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  23.65 
 
 		 1137 aa  45.4  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0231  glycoside hydrolase family 9  21.86 
 
 		 715 aa  44.3  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0413621  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>