97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3318 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3318  phage shock protein C, PspC  100 
 
 		 64 aa  126  8.000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.125133 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3401  phage shock protein C, PspC  63.16 
 
 		 62 aa  80.1  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0719508  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3231  phage shock protein C, PspC  56.9 
 
 		 68 aa  80.1  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0365793  hitchhiker  0.00000725831 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4619  phage shock protein C, PspC  56.06 
 
 		 67 aa  78.6  0.00000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0367  phage shock protein C  53.57 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0060  phage shock protein C, PspC  50 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2312  phage shock protein C, PspC  50.91 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0132  phage shock protein C, PspC  58.62 
 
 		 82 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0723813  normal  0.142504 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0912  phage shock protein C, PspC  49.18 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715108 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3236  PspC domain protein  48.28 
 
 		 129 aa  62  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0047  phage shock protein C, PspC  55.93 
 
 		 59 aa  61.2  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0585  phage shock protein C, PspC  51.85 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00837163  hitchhiker  0.00408687 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1926  phage shock protein C, PspC  45.61 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000470088  unclonable  0.00000000972351 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3719  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.0072784  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3802  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3661  phage shock protein C, PspC  49.09 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2330  phage shock protein C, PspC  48.21 
 
 		 92 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.399837 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3790  phage shock protein C, PspC  48.15 
 
 		 108 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.454801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28830  putative stress-responsive transcriptional regulator  51.79 
 
 		 57 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.217612 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2032  phage shock protein C, PspC  42.37 
 
 		 61 aa  52.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.152024  normal  0.0853583 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3554  phage shock protein C, PspC  39.39 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.385576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4227  putative signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 		 394 aa  51.2  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2413  phage shock protein C, PspC  40.3 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.249375  normal  0.561911 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4996  phage shock protein C, PspC  38.98 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5232  putative signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 		 400 aa  50.1  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0452492  hitchhiker  0.00276259 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0522  phage shock protein C, PspC  38.71 
 
 		 164 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.854498  normal  0.422706 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2822  phage shock protein C, PspC  39.34 
 
 		 97 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3607  ATPase domain-containing protein  45.61 
 
 		 440 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3366  phage shock protein C  33.93 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1275  phage shock protein C, PspC  45.76 
 
 		 169 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0715782  normal  0.19244 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2455  phage shock protein C, PspC  44.9 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0794  phage shock protein C, PspC  38.18 
 
 		 61 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0952  phage shock protein C, PspC  42.86 
 
 		 170 aa  48.5  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.441408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2855  putative stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1045  hypothetical protein  40 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1000  phage shock protein C, PspC  40.35 
 
 		 64 aa  47.8  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.290499 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4670  phage shock protein C, PspC  46.3 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0421  phage shock protein C, PspC  47.37 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2420  phage shock protein C, PspC  37.7 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0861  phage shock protein C, PspC  39.62 
 
 		 86 aa  47  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.973899  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3459  PspC domain protein  38.98 
 
 		 244 aa  47  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0516361 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2743  phage shock protein C, PspC  37.74 
 
 		 847 aa  46.2  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00338438  hitchhiker  0.000000294429 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0822  stress-responsive transcriptional regulator  33.93 
 
 		 95 aa  46.6  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.55702  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0468  PspC domain protein  38.98 
 
 		 515 aa  46.2  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1174  PspC domain-containing protein  33.93 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.447328  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1310  phage shock protein C, PspC  55.32 
 
 		 49 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000931741 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5559  phage shock protein C, PspC  44.07 
 
 		 371 aa  45.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.470444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1775  putative stress-responsive transcriptional regulator, PspC  36.07 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.218822  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1735  PspC domain protein  38.46 
 
 		 445 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1660  phage shock protein C, PspC  38.89 
 
 		 127 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4462  phage shock protein C, PspC  31.25 
 
 		 86 aa  45.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3130  phage shock protein C, PspC  43.64 
 
 		 177 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3002  phage shock protein C, PspC  37.25 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.244405  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0709  putative signal transduction histidine kinase  40.62 
 
 		 484 aa  44.7  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1339  phage shock protein C, PspC  34.48 
 
 		 62 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00304001  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2047  putative stress-responsive transcriptional regulator  38.6 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6527  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 417 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.627165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1319  phage shock protein C, PspC  32.26 
 
 		 165 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1233  phage shock protein C, PspC  35.09 
 
 		 152 aa  43.9  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.233266  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0967  PspC domain-containing protein  44.07 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0365366  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0588  hypothetical protein  35.48 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.108358  hitchhiker  0.00051768 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1770  putative stress-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 		 427 aa  43.5  0.0009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1594  phage shock protein C, PspC  37.04 
 
 		 127 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2711  putative signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 477 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00959084 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17350  signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 		 419 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9060  Putative stress-responsive transcriptional regulator protein-like protein  33.33 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2882  phage shock protein C, PspC  39.29 
 
 		 114 aa  43.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.390226 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2350  phage shock protein C, PspC  37.74 
 
 		 194 aa  42.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3932  phage shock protein C, PspC  35.94 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.923929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2935  phage shock protein C, PspC  30.51 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000394883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4820  phage shock protein C, PspC  32.31 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1648  phage shock protein C, PspC  39.58 
 
 		 416 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.530019  normal  0.368483 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2548  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 128 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.818003  normal  0.0263017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2480  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 128 aa  42  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406786 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2646  phage shock protein C, PspC  45.28 
 
 		 128 aa  42  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.487796 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1724  DNA-binding transcriptional activator PspC  46.77 
 
 		 117 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367196  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04800  putative stress-responsive transcriptional regulator  31.58 
 
 		 418 aa  42  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.975328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05619  PspC domain superfamily  34.62 
 
 		 52 aa  42  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0146785  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2714  phage shock protein C, PspC  37.25 
 
 		 83 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445167 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2286  hypothetical protein  35.59 
 
 		 65 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1642  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.694655  normal  0.946116 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0475  stress-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1982  phage shock protein C, PspC  35.59 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.161663  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1324  phage shock protein C, PspC  36.67 
 
 		 107 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1608  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1809  phage shock protein C  43.4 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2735  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243267  normal  0.130126 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2843  phage shock protein C, PspC  33.9 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000296758  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1504  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1619  phage shock protein C, PspC  43.4 
 
 		 128 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3002  phage shock protein C, PspC  39.66 
 
 		 153 aa  41.2  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.681381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3205  phage shock protein C, PspC  31.25 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.236376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2999  putative signal transduction histidine kinase  37.88 
 
 		 480 aa  40.8  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.942912  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05040  PspC domain-containing protein  37.04 
 
 		 100 aa  40.4  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0450  phage shock protein C, PspC  30.91 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.902434  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1110  phage shock protein C, PspC  36.51 
 
 		 190 aa  40.4  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000317198  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1239  phage shock protein C  41.51 
 
 		 131 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0689653 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>