107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3095 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 237 aa  463  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  53.42 
 
 		 245 aa  214  8e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  50 
 
 		 246 aa  201  6e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  46.27 
 
 		 252 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  47.44 
 
 		 244 aa  190  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  44.83 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  47.5 
 
 		 247 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  46.86 
 
 		 252 aa  187  1e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  49.37 
 
 		 246 aa  187  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 258 aa  186  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  49.57 
 
 		 246 aa  184  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  50.85 
 
 		 247 aa  184  9e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  51.93 
 
 		 249 aa  182  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  51.53 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 248 aa  178  7e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 225 aa  174  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  46.84 
 
 		 238 aa  174  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 240 aa  168  6e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  47.81 
 
 		 258 aa  167  2e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  45.26 
 
 		 238 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  40.76 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 264 aa  162  3e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  47.3 
 
 		 236 aa  162  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  50.65 
 
 		 271 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  44.1 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  39.74 
 
 		 230 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  39.49 
 
 		 268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  40.5 
 
 		 263 aa  120  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  61.8 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  64.86 
 
 		 422 aa  109  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  28.68 
 
 		 287 aa  95.5  6e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 158 aa  52.4  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 229 aa  52  0.000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 269 aa  49.3  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 146 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  42.42 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  41.46 
 
 		 155 aa  47.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 341 aa  46.2  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 146 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 292 aa  45.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 162 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4237  MerR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 136 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.428618  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 139 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  40.35 
 
 		 157 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  35.29 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1234  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 134 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000829315  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00240  predicted transcriptional regulator  47.46 
 
 		 114 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 168 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  40.82 
 
 		 124 aa  43.5  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  40.35 
 
 		 157 aa  43.5  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  40.35 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  40.35 
 
 		 171 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  40.35 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  56.41 
 
 		 154 aa  43.5  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2129  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 150 aa  43.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 164 aa  43.5  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  40.35 
 
 		 171 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  41.94 
 
 		 234 aa  43.5  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  51.16 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  40.35 
 
 		 163 aa  43.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  40.35 
 
 		 157 aa  43.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  40.35 
 
 		 156 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  56.41 
 
 		 138 aa  43.1  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2140  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0134441 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 154 aa  42.7  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2509  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 160 aa  42.7  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  36.59 
 
 		 145 aa  42.7  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  38.6 
 
 		 177 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  24.39 
 
 		 243 aa  42.7  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 136 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 171 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  38.38 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  32.79 
 
 		 165 aa  42.4  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  38.6 
 
 		 159 aa  42.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  43.18 
 
 		 173 aa  42.4  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3623  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 142 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3961  MerR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 142 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.146237  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2267  MerR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 132 aa  42.4  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.312011  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3542  transcriptional regulator, MerR family  51.16 
 
 		 143 aa  42.4  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 149 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 138 aa  42.4  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0800  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 142 aa  42  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.876996 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 153 aa  42  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 159 aa  42  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  27.66 
 
 		 144 aa  42  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  44.9 
 
 		 133 aa  42  0.008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3732  transcriptional repressor GlnR  44.9 
 
 		 129 aa  42  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3550  transcriptional repressor GlnR  44.9 
 
 		 129 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3450  MerR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 129 aa  42  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3463  MerR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 129 aa  42  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3834  transcriptional repressor GlnR  44.9 
 
 		 129 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>