132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_2433 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
236 aa  455  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  53.16 
 
 
245 aa  225  4e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  56.12 
 
 
225 aa  218  3.9999999999999997e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  49.01 
 
 
252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  52.34 
 
 
246 aa  210  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  50.21 
 
 
218 aa  207  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  45.12 
 
 
240 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  48.09 
 
 
244 aa  192  5e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  51.95 
 
 
249 aa  185  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  50 
 
 
249 aa  183  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 
248 aa  180  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  45.64 
 
 
246 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 
244 aa  178  4.999999999999999e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  47.08 
 
 
252 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  47.08 
 
 
252 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  47.08 
 
 
252 aa  178  7e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  45.56 
 
 
247 aa  177  2e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  46.28 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  46.72 
 
 
238 aa  174  9.999999999999999e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  47.16 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  48.31 
 
 
237 aa  172  2.9999999999999996e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 
313 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 
258 aa  170  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  46.22 
 
 
247 aa  168  9e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  43.23 
 
 
246 aa  161  9e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  45.26 
 
 
260 aa  159  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  44.44 
 
 
258 aa  159  5e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  49.78 
 
 
271 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  40.97 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  41.33 
 
 
230 aa  142  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  40.52 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 
262 aa  124  1e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  41.05 
 
 
263 aa  117  9.999999999999999e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  37.28 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  58.11 
 
 
422 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  25.89 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  49.15 
 
 
158 aa  53.9  0.000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
151 aa  52.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  58.14 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  38.27 
 
 
157 aa  47  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 
173 aa  47.4  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  46.58 
 
 
128 aa  46.6  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 
157 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  41.54 
 
 
255 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
138 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  46.88 
 
 
143 aa  46.6  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 
153 aa  46.2  0.0004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  38.27 
 
 
156 aa  46.6  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 
157 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  38.27 
 
 
163 aa  45.8  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 
145 aa  45.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  40.85 
 
 
171 aa  45.4  0.0007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 
118 aa  45.4  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  40.85 
 
 
176 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  48.33 
 
 
159 aa  45.4  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  40.85 
 
 
171 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 
135 aa  44.7  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
159 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  38.46 
 
 
158 aa  44.7  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
127 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
149 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  40.85 
 
 
176 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  47.27 
 
 
151 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.46 
 
 
148 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
138 aa  44.3  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  49.09 
 
 
171 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 
162 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 
164 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
149 aa  43.5  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
255 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  43.84 
 
 
149 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  43.64 
 
 
159 aa  43.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  59.46 
 
 
152 aa  43.5  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
156 aa  43.5  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.84 
 
 
149 aa  43.5  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  54.29 
 
 
128 aa  43.1  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  51.52 
 
 
97 aa  43.5  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  42.47 
 
 
147 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2975  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.501139  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0151  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  53.85 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.636208  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.62 
 
 
134 aa  43.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
130 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 
155 aa  43.1  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3334  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1564  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3947  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  53.85 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 
164 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4020  transcriptional regulator CadR  53.85 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3037  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
143 aa  42.7  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 
126 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 
159 aa  43.1  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 
129 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>