120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1739 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  56.03 
 
 		 258 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  58.51 
 
 		 246 aa  245  4e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  50.41 
 
 		 260 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  42.13 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 245 aa  169  4e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  44.83 
 
 		 240 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  41.74 
 
 		 244 aa  159  4e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  43.61 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  43.78 
 
 		 263 aa  154  1e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  43.05 
 
 		 247 aa  152  5.9999999999999996e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 237 aa  149  7e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  43.48 
 
 		 246 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  44.81 
 
 		 238 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  43.89 
 
 		 238 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  43.5 
 
 		 240 aa  145  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  46.49 
 
 		 249 aa  144  2e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 218 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 249 aa  142  5e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 252 aa  142  6e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  38.82 
 
 		 247 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 258 aa  138  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 248 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  40.97 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 225 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  37.56 
 
 		 230 aa  118  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 229 aa  115  6e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  40.99 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  35.95 
 
 		 262 aa  107  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  36.68 
 
 		 236 aa  98.6  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 313 aa  96.7  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  54.05 
 
 		 422 aa  87.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 126 aa  54.7  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  42.17 
 
 		 145 aa  53.5  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 292 aa  52  0.000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 138 aa  52  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 243 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  42.5 
 
 		 137 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 152 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 138 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 146 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  34.12 
 
 		 118 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 158 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 156 aa  47  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  60 
 
 		 173 aa  47  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  39.78 
 
 		 234 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  47.46 
 
 		 123 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 168 aa  46.6  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  46.55 
 
 		 154 aa  45.8  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  29.12 
 
 		 229 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 255 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  28 
 
 		 122 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  46.67 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  46.67 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  34.51 
 
 		 129 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 391 aa  45.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 198 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 164 aa  45.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  46.67 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  57.14 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  39.71 
 
 		 164 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 117 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  39.68 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  37.84 
 
 		 138 aa  44.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1480  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  31.62 
 
 		 148 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00810919  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  54.29 
 
 		 153 aa  44.3  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  54.29 
 
 		 158 aa  44.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1156  regulatory protein, MerR  36.36 
 
 		 116 aa  43.9  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 133 aa  44.3  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 133 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 143 aa  44.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 		 249 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  51.52 
 
 		 131 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  57.14 
 
 		 128 aa  44.7  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 351 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 143 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.83 
 
 		 154 aa  43.9  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 340 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5382  transcriptional regulator, MerR family  36.96 
 
 		 301 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 135 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>