54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1433 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 229 aa  455  1e-127  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  39.27 
 
 		 268 aa  142  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  37.09 
 
 		 244 aa  121  8e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 218 aa  115  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  35.91 
 
 		 264 aa  115  5e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  33.33 
 
 		 247 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 245 aa  111  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  32.47 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 244 aa  109  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  31.82 
 
 		 252 aa  108  6e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  34.5 
 
 		 246 aa  106  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  30.9 
 
 		 252 aa  106  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  35.68 
 
 		 238 aa  104  9e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  35.55 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  31.9 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  36.16 
 
 		 246 aa  102  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 248 aa  102  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  36.45 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  31.72 
 
 		 240 aa  100  3e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  35.83 
 
 		 258 aa  98.6  7e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  34.63 
 
 		 237 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  36.22 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 		 262 aa  96.3  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  47.57 
 
 		 422 aa  95.5  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  36.84 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  32.74 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  27.11 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  44.05 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  47.89 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 292 aa  49.3  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2621  MerR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 117 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361193  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3184  transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 		 142 aa  45.4  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0376  MerR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 293 aa  44.3  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2485  transcriptional regulator, MerR family  32.04 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1258  transcriptional regulator mlrA  32.04 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00289591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01145  hypothetical protein  32.04 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01137  predicted DNA-binding transcriptional regulator  32.04 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1317  transcriptional regulator mlrA  32.04 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1987  transcriptional regulator mlrA  32.04 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2464  MerR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1301  transcriptional regulator mlrA-like protein  32.04 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21300  putative transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 126 aa  42.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.282314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  27.87 
 
 		 283 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1579  MerR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 151 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0323657  normal  0.536322 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 164 aa  41.6  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 295 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>