77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2338 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 244 aa  482  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  65.7 
 
 		 240 aa  308  5.9999999999999995e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  56.33 
 
 		 244 aa  261  1e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  55.02 
 
 		 248 aa  252  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  56.67 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  52.42 
 
 		 247 aa  244  8e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  53.82 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  53.82 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  53.82 
 
 		 252 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  51.97 
 
 		 246 aa  212  4.9999999999999996e-54  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  48.48 
 
 		 246 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  45.08 
 
 		 313 aa  201  9.999999999999999e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 245 aa  195  7e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  48.68 
 
 		 249 aa  192  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  48.68 
 
 		 249 aa  191  6e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  49.53 
 
 		 225 aa  175  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  47.44 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  43.48 
 
 		 246 aa  173  2.9999999999999996e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  42.74 
 
 		 247 aa  170  2e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  45.18 
 
 		 258 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  48.09 
 
 		 236 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  43.72 
 
 		 238 aa  165  5e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  44.35 
 
 		 240 aa  162  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  39.74 
 
 		 230 aa  162  6e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  41.74 
 
 		 264 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  43.35 
 
 		 258 aa  148  7e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  45.85 
 
 		 271 aa  145  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  38.82 
 
 		 236 aa  144  1e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  38.17 
 
 		 260 aa  139  3e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 262 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 229 aa  121  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  60 
 
 		 422 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  25.9 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  31.29 
 
 		 283 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  37.18 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 351 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 351 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  39.53 
 
 		 150 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 145 aa  45.4  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 146 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  34.55 
 
 		 137 aa  44.7  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  45.83 
 
 		 159 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  34.65 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  31.36 
 
 		 138 aa  44.3  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 158 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  35.82 
 
 		 118 aa  43.5  0.003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5993  MerR family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 140 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000699442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 128 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0280  putative transcription regulator protein  40 
 
 		 165 aa  43.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0843024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  43.18 
 
 		 153 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 146 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  29.48 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  32.32 
 
 		 139 aa  42.7  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  38.98 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4234  regulatory protein, MerR  36.71 
 
 		 96 aa  42.4  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.231152  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  43.75 
 
 		 159 aa  42.4  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2220  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 164 aa  42.4  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 164 aa  42  0.008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 164 aa  42  0.008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 190 aa  42.4  0.008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1374  MerR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 164 aa  42  0.008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.43042  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  40.82 
 
 		 123 aa  42  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 164 aa  42  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  33.85 
 
 		 269 aa  42  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  27.09 
 
 		 259 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  34.85 
 
 		 255 aa  41.6  0.01  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>