60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_11858 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  484  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  82.33 
 
 		 244 aa  397  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 252 aa  362  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 252 aa  362  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  77.25 
 
 		 252 aa  362  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  75.7 
 
 		 248 aa  354  6.999999999999999e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  54.88 
 
 		 240 aa  247  1e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  52.42 
 
 		 244 aa  244  8e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  48.03 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 245 aa  210  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  47.84 
 
 		 246 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 249 aa  184  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  47.26 
 
 		 249 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  47.5 
 
 		 237 aa  176  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  42.62 
 
 		 246 aa  168  9e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  44.17 
 
 		 225 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  39.5 
 
 		 218 aa  165  6.9999999999999995e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  40.08 
 
 		 238 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 258 aa  156  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  42.02 
 
 		 246 aa  156  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  44.8 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  37.87 
 
 		 230 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  40.25 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  41.15 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  40.6 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 240 aa  140  9.999999999999999e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  38.82 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  36.36 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 271 aa  125  5e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  38.49 
 
 		 262 aa  122  6e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  67.42 
 
 		 313 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  37.34 
 
 		 268 aa  118  7e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  39.56 
 
 		 263 aa  109  4.0000000000000004e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  58.11 
 
 		 422 aa  95.9  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  26.37 
 
 		 287 aa  87  3e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  39.08 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 151 aa  50.8  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 158 aa  48.5  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 156 aa  46.2  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2129  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 150 aa  45.8  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 151 aa  45.8  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 162 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  48.94 
 
 		 171 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  48.94 
 
 		 176 aa  45.4  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  48.94 
 
 		 171 aa  45.4  0.0009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  37.8 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  48.94 
 
 		 176 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  48.94 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  48.94 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  48.94 
 
 		 157 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  48.94 
 
 		 156 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  48.94 
 
 		 163 aa  44.3  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 158 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  39.74 
 
 		 128 aa  42.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 159 aa  42  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>