79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4003 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 225 aa  429  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  65.78 
 
 		 218 aa  281  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 245 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  48.56 
 
 		 252 aa  207  9e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  50.9 
 
 		 258 aa  201  8e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  48.03 
 
 		 240 aa  198  6e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  54.43 
 
 		 236 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  48.28 
 
 		 246 aa  192  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 252 aa  191  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  49.13 
 
 		 246 aa  190  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  46.35 
 
 		 244 aa  189  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  48.02 
 
 		 244 aa  185  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  44.17 
 
 		 247 aa  180  1e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  48.05 
 
 		 249 aa  179  2.9999999999999997e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  49.35 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  52.21 
 
 		 271 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  48.86 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  47.75 
 
 		 238 aa  171  6.999999999999999e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  47.98 
 
 		 247 aa  171  1e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  49.37 
 
 		 237 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 240 aa  169  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  45.21 
 
 		 246 aa  154  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  40.93 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  40.26 
 
 		 236 aa  148  7e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  42.99 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  44.29 
 
 		 264 aa  140  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  42.6 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  39.32 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  40.39 
 
 		 262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  65.82 
 
 		 313 aa  114  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 263 aa  112  3e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  54.22 
 
 		 422 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  44.58 
 
 		 287 aa  84.3  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 158 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 146 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  38.54 
 
 		 128 aa  46.2  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 151 aa  46.2  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  33.98 
 
 		 153 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 143 aa  43.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  32.04 
 
 		 162 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  29.46 
 
 		 271 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 229 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 276 aa  42.7  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 147 aa  42.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 164 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  47.46 
 
 		 152 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 159 aa  42.7  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  34.78 
 
 		 123 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.48 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  47.46 
 
 		 152 aa  42.7  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 269 aa  42.4  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  41.82 
 
 		 143 aa  42.4  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 		 157 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 152 aa  42.4  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 135 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 		 157 aa  42  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  51.22 
 
 		 158 aa  42.4  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 135 aa  42  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5193  MerR family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 147 aa  42  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 		 176 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 273 aa  42  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 		 176 aa  42  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 		 157 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 		 171 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 		 171 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  47.92 
 
 		 163 aa  41.6  0.01  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 295 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 295 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1449  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  30.59 
 
 		 156 aa  41.6  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 126 aa  41.6  0.01  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2149  transcriptional regulator, MerR family  32.69 
 
 		 132 aa  41.6  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.705718  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>