138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_13840 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  100 
 
 
247 aa  470  1e-132  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  52.74 
 
 
238 aa  216  4e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  52.32 
 
 
240 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  47.84 
 
 
245 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  44.9 
 
 
252 aa  177  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  48.18 
 
 
258 aa  177  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  46.72 
 
 
246 aa  176  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  48.94 
 
 
246 aa  175  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  42.74 
 
 
244 aa  170  2e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 
237 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  47.58 
 
 
238 aa  169  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  47.83 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  41.63 
 
 
240 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  48.56 
 
 
225 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  41.63 
 
 
258 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  48.44 
 
 
249 aa  160  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  45.16 
 
 
246 aa  155  7e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  45.85 
 
 
260 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  43.05 
 
 
264 aa  152  5e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 
218 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 
313 aa  145  5e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  40.17 
 
 
244 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  39.08 
 
 
248 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  41.15 
 
 
247 aa  143  3e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
271 aa  143  3e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  41.6 
 
 
236 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
252 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
252 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  38.91 
 
 
252 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 
236 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  37.61 
 
 
230 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  40.94 
 
 
263 aa  120  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  35.6 
 
 
262 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  37 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
229 aa  103  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  64.86 
 
 
422 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  43.59 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
158 aa  52.8  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
129 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 
182 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  40.23 
 
 
150 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
129 aa  50.4  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
133 aa  50.1  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
129 aa  49.3  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
166 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 
169 aa  49.3  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
163 aa  49.3  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  25.29 
 
 
148 aa  48.9  0.00008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
129 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  32 
 
 
273 aa  47.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 
126 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
146 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  43.28 
 
 
234 aa  46.6  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
152 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  49.06 
 
 
129 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 
152 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  38.71 
 
 
292 aa  45.4  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  49.06 
 
 
129 aa  45.8  0.0007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  32.98 
 
 
111 aa  45.4  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0157  MerR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
167 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  51.16 
 
 
340 aa  45.4  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  34.74 
 
 
184 aa  45.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 
146 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  38.64 
 
 
137 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  35.9 
 
 
162 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  35.23 
 
 
145 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 
142 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1950  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
149 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.578606  normal  0.329857 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  37.65 
 
 
153 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 
151 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
156 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0255  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
251 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
351 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  37.5 
 
 
109 aa  43.9  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  32.17 
 
 
154 aa  44.3  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  42.59 
 
 
131 aa  43.9  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
340 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
190 aa  43.5  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
155 aa  43.5  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  39.66 
 
 
117 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  33.93 
 
 
136 aa  43.5  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  37.04 
 
 
139 aa  43.9  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  44.23 
 
 
135 aa  43.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
168 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0636  transcriptional regulator, MerR family  32.93 
 
 
160 aa  43.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
133 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  40.96 
 
 
155 aa  43.1  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1864  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
198 aa  43.1  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00890  predicted transcriptional regulator  40.62 
 
 
129 aa  43.1  0.004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 
154 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 
129 aa  43.5  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  41.33 
 
 
144 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  38.1 
 
 
152 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2386  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
255 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6235  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
153 aa  42.7  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204034  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0033  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
164 aa  42.7  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.154988  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2258  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
164 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.214399  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  32.43 
 
 
129 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>