81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2774 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  100 
 
 		 240 aa  467  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  65.7 
 
 		 244 aa  308  5.9999999999999995e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  56.73 
 
 		 244 aa  256  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  54.88 
 
 		 247 aa  247  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  54.84 
 
 		 248 aa  245  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  52.76 
 
 		 252 aa  242  3.9999999999999997e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  53.5 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  49.79 
 
 		 245 aa  204  1e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 249 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  47.83 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  49.57 
 
 		 246 aa  198  7e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  49.78 
 
 		 249 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  48.25 
 
 		 225 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  45.13 
 
 		 246 aa  186  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 237 aa  174  8e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  42.73 
 
 		 238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  45.68 
 
 		 236 aa  171  5.999999999999999e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  45.65 
 
 		 240 aa  170  2e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 264 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 238 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  42.8 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  45.22 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  41.63 
 
 		 247 aa  163  3e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  41.42 
 
 		 236 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  39.04 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 271 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  63.21 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  36.13 
 
 		 262 aa  129  6e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  41.34 
 
 		 263 aa  119  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  62.67 
 
 		 422 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 229 aa  100  3e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  27.68 
 
 		 287 aa  97.8  1e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  31.62 
 
 		 269 aa  48.9  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 128 aa  47.8  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  32.48 
 
 		 269 aa  47.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 158 aa  45.8  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  45.65 
 
 		 159 aa  45.4  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  45.45 
 
 		 135 aa  45.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2141  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 181 aa  45.4  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0481912  normal  0.077667 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 153 aa  45.4  0.0009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  52.63 
 
 		 159 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  52.63 
 
 		 158 aa  45.1  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04780  transcriptional regulator, MerR family  35.48 
 
 		 118 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000795596  normal  0.576293 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 292 aa  45.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  33.71 
 
 		 145 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  52.63 
 
 		 173 aa  43.9  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4431  transcriptional regulator, MerR family  44.19 
 
 		 160 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290243  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  38.38 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  33.05 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1304  zinc-responsive transcriptional regulator  40.91 
 
 		 140 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 		 171 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 		 176 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 		 171 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  44.9 
 
 		 123 aa  43.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0140  putative transcriptional regulator, MerR family  31.4 
 
 		 126 aa  43.1  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0752186 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 234 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 		 156 aa  43.1  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0409  TipAS antibiotic-recognition domain protein  31.46 
 
 		 259 aa  42.4  0.006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  40.43 
 
 		 157 aa  42.4  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 273 aa  42.4  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  41.3 
 
 		 177 aa  42.4  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 144 aa  42.4  0.007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0102  MerR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 144 aa  42.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 162 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  40.43 
 
 		 157 aa  42  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0280  putative transcription regulator protein  42.86 
 
 		 165 aa  42  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0843024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  39.66 
 
 		 139 aa  42  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  40.43 
 
 		 157 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 244 aa  42  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3477  MerR family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 120 aa  42  0.01  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.137212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  45.65 
 
 		 132 aa  41.6  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>