82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_15530 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 230 aa  454  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  38.75 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 252 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 252 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 252 aa  154  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  38.52 
 
 		 240 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  37.76 
 
 		 247 aa  152  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  40.52 
 
 		 245 aa  152  5e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  41.45 
 
 		 238 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 225 aa  141  9.999999999999999e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  35.59 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  39.66 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  44.25 
 
 		 249 aa  139  4.999999999999999e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 258 aa  136  2e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  39 
 
 		 246 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  37.23 
 
 		 247 aa  130  1.0000000000000001e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  37.45 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  39.64 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  38.03 
 
 		 246 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  39.74 
 
 		 237 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  35.37 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  37.56 
 
 		 264 aa  118  7e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  41.33 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 240 aa  112  5e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 271 aa  108  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 238 aa  106  3e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  40.24 
 
 		 263 aa  103  2e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  37.31 
 
 		 262 aa  101  8e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  57.89 
 
 		 422 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  36.41 
 
 		 229 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  58.33 
 
 		 313 aa  93.6  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  55.56 
 
 		 287 aa  87  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  31.75 
 
 		 237 aa  49.3  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  40.66 
 
 		 155 aa  48.5  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 151 aa  47  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 158 aa  46.6  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.46 
 
 		 153 aa  45.8  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  41.67 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4363  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0411786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4656  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.871775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1922  MerR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 155 aa  44.7  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4277  MerR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.637089  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  44.64 
 
 		 151 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 146 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 162 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4811  MerR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 144 aa  42.7  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.229804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  43.4 
 
 		 124 aa  42.7  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9086  putative transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 162 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 171 aa  42.4  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0777  transcriptional regulator, MerR family  48.72 
 
 		 124 aa  42.7  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 163 aa  42.7  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4100  MerR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 127 aa  42.4  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.686135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  51.28 
 
 		 146 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 184 aa  42.4  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  52.63 
 
 		 146 aa  42.4  0.007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2331  transcriptional regulator, MerR family  31.34 
 
 		 141 aa  42  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00979491  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  46 
 
 		 157 aa  42.4  0.007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  46 
 
 		 157 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2603  transcriptional regulator, MerR family  45.76 
 
 		 274 aa  42  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241665  normal  0.676341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  42.55 
 
 		 152 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  48.65 
 
 		 130 aa  42  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  46 
 
 		 157 aa  42  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  42.55 
 
 		 152 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 173 aa  42  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 292 aa  42  0.008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  46 
 
 		 156 aa  42  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4442  putative transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 253 aa  41.6  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00264375  hitchhiker  0.000476994 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2208  MerR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 190 aa  42  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.194329  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02041  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  42.86 
 
 		 116 aa  41.6  0.009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  35 
 
 		 343 aa  41.6  0.009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 177 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1365  MerR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 124 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 149 aa  41.6  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0495  MerR family transcriptional regulator  54.29 
 
 		 124 aa  41.6  0.01  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.127683  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  45.07 
 
 		 147 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>