106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2519 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 249 aa  480  1e-134  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  95.58 
 
 		 249 aa  408  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  49.59 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  51.67 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  48.68 
 
 		 244 aa  204  7e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 244 aa  203  2e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  46.27 
 
 		 247 aa  201  9e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  51.84 
 
 		 258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  49.17 
 
 		 248 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 218 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  50.43 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  46.81 
 
 		 246 aa  191  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 252 aa  188  5.999999999999999e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  48.05 
 
 		 225 aa  181  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  51.93 
 
 		 237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 313 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  47.44 
 
 		 238 aa  179  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  47.5 
 
 		 247 aa  179  4e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 271 aa  167  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  51.68 
 
 		 236 aa  167  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  48.68 
 
 		 258 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  48.07 
 
 		 238 aa  158  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  44.4 
 
 		 260 aa  158  9e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  47.66 
 
 		 240 aa  156  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  43.81 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  43.59 
 
 		 236 aa  153  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  46.05 
 
 		 264 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  42.34 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  38.08 
 
 		 268 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  36.86 
 
 		 262 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  61.64 
 
 		 422 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 229 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  30.16 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 292 aa  55.5  0.0000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  45.78 
 
 		 234 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  36 
 
 		 158 aa  47.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  45.76 
 
 		 177 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  32.17 
 
 		 134 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0157  MerR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 167 aa  47  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 		 176 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  45.61 
 
 		 171 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  43.33 
 
 		 176 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  45.61 
 
 		 171 aa  46.6  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 151 aa  46.2  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  30.82 
 
 		 144 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  50.77 
 
 		 155 aa  46.2  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  45.61 
 
 		 157 aa  45.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3791  MerR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 149 aa  45.8  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  45.61 
 
 		 156 aa  45.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  45.61 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  45.61 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4464  MerR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 130 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4295  MerR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 130 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4195  MerR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 130 aa  45.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  45.61 
 
 		 157 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  43.64 
 
 		 143 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  28.34 
 
 		 243 aa  44.7  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  41.43 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 327 aa  44.3  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 143 aa  44.3  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 137 aa  43.5  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  44.07 
 
 		 159 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  40.68 
 
 		 152 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  38.89 
 
 		 139 aa  43.5  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  40.68 
 
 		 152 aa  43.5  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3444  transcriptional regulator, MerR family  34.88 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0545873  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3563  transcriptional regulator, MerR family  30.43 
 
 		 143 aa  43.9  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4421  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 139 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0298638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 162 aa  43.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 145 aa  43.1  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 129 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1963  transcriptional regulator, MerR family  38.36 
 
 		 138 aa  43.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.101792  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4438  MerR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 143 aa  42.7  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 171 aa  43.1  0.005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 172 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  42.59 
 
 		 165 aa  42.7  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3929  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 159 aa  42.7  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1436  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 140 aa  42.7  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  37.21 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  42.59 
 
 		 129 aa  42.7  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  44.19 
 
 		 150 aa  43.1  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  30.28 
 
 		 171 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 138 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  41.03 
 
 		 154 aa  42.7  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 123 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 130 aa  42.4  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 159 aa  42.4  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1287  MerR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 155 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.422706  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4233  transcriptional regulator, MerR family  27.64 
 
 		 137 aa  42.4  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>