99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1694 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 218 aa  430  1e-120  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  65.78 
 
 		 225 aa  265  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 245 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  45.27 
 
 		 252 aa  206  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 249 aa  181  7e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  43.53 
 
 		 246 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  45.69 
 
 		 249 aa  179  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  49.37 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  43.17 
 
 		 240 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  43.04 
 
 		 244 aa  178  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 258 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 248 aa  176  3e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 252 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 252 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 252 aa  169  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  41.1 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  39.5 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  44.54 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  42.53 
 
 		 238 aa  161  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  40.43 
 
 		 246 aa  158  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  42.34 
 
 		 238 aa  156  2e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 240 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  41.07 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 271 aa  149  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  38.43 
 
 		 230 aa  145  3e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  37.39 
 
 		 236 aa  144  8.000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  40.45 
 
 		 264 aa  143  2e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  39.45 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  35.09 
 
 		 268 aa  132  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  37.27 
 
 		 260 aa  131  6.999999999999999e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  34.8 
 
 		 258 aa  124  9e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  37.61 
 
 		 262 aa  118  7.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  35.61 
 
 		 229 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  56.12 
 
 		 313 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  62.5 
 
 		 422 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  38.69 
 
 		 263 aa  106  2e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  25.36 
 
 		 287 aa  86.7  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  45.61 
 
 		 158 aa  50.1  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 158 aa  48.9  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  43.86 
 
 		 173 aa  47.8  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 152 aa  47.8  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 152 aa  47.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  43.86 
 
 		 159 aa  47.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  47.37 
 
 		 159 aa  47  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 153 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 151 aa  47.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 137 aa  46.6  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  43.14 
 
 		 164 aa  46.6  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  45.76 
 
 		 152 aa  45.8  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 156 aa  45.8  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 157 aa  45.4  0.0006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 157 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5993  MerR family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 140 aa  45.4  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000699442 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 157 aa  45.1  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3329  zinc-responsive transcriptional regulator  48.89 
 
 		 144 aa  44.7  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.886267 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 163 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 292 aa  44.7  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0271  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 156 aa  44.3  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  47.06 
 
 		 171 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 273 aa  43.5  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 163 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 		 169 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 166 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3941  MerR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.708141  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  42.11 
 
 		 171 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4192  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 141 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0537  MerR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 133 aa  43.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.705155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4372  MerR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 137 aa  43.1  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 143 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3404  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 155 aa  43.1  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  26.92 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3542  transcriptional regulator, MerR family  51.16 
 
 		 143 aa  42.7  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0490383 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0466  MerR family transcriptional regulator  34.12 
 
 		 305 aa  43.1  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.935291  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2710  MerR family transcriptional regulator  45 
 
 		 156 aa  42.7  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 149 aa  42.7  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 129 aa  42.7  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  43.86 
 
 		 177 aa  42.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 159 aa  42.7  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 152 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3237  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 171 aa  42.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.839111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 182 aa  42.4  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 145 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_004310  BR0221  MerR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 149 aa  42  0.007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.998323  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2924  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 131 aa  42  0.007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3676  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 143 aa  42  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.511555  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  41.82 
 
 		 143 aa  42  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0211  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.07 
 
 		 149 aa  42  0.008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0211  transcriptional regulator, MerR family protein  40 
 
 		 148 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1137  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 159 aa  41.6  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 129 aa  41.6  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2325  MerR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 135 aa  41.6  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>