75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1126 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 262 aa  520  1e-147  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  41.87 
 
 		 245 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  39.24 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  38.49 
 
 		 238 aa  135  9.999999999999999e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 248 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  40.39 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 240 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  36.13 
 
 		 240 aa  129  6e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  39.61 
 
 		 238 aa  126  3e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  39.05 
 
 		 249 aa  125  9e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 252 aa  123  4e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  35.74 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  38.49 
 
 		 247 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  40.1 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  35.6 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 218 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  38.24 
 
 		 246 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  36.61 
 
 		 237 aa  115  1.0000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  34.26 
 
 		 260 aa  113  4.0000000000000004e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  35.95 
 
 		 264 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  34.29 
 
 		 258 aa  105  6e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 313 aa  105  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  33.33 
 
 		 236 aa  105  8e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  35.15 
 
 		 258 aa  104  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  37.31 
 
 		 230 aa  102  8e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  61.64 
 
 		 236 aa  99  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  46.73 
 
 		 422 aa  96.7  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 229 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  60.56 
 
 		 263 aa  87.8  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  30.57 
 
 		 287 aa  85.1  0.000000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 273 aa  54.7  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 		 157 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 		 157 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  40.54 
 
 		 157 aa  48.9  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  39.19 
 
 		 163 aa  48.5  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  37.84 
 
 		 156 aa  46.6  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 151 aa  46.6  0.0005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38550  transcriptional regulator, MerR family  43.33 
 
 		 150 aa  45.4  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0289644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  40 
 
 		 150 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  33.77 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 340 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 351 aa  45.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1053  MerR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 173 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.582501 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 171 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0102  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  33.33 
 
 		 176 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  44.3  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 158 aa  43.5  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  38.81 
 
 		 129 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  43.55 
 
 		 136 aa  43.1  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  48.48 
 
 		 131 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  39.44 
 
 		 173 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0181  MerR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 144 aa  43.1  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0280  putative transcription regulator protein  41.46 
 
 		 165 aa  42.7  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0843024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4947  regulatory protein, MerR  39.47 
 
 		 129 aa  43.1  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.459947  decreased coverage  0.00286067 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 340 aa  42.7  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 292 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  38.81 
 
 		 129 aa  42.7  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  37.31 
 
 		 152 aa  42.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4252  MerR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 134 aa  42.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285942  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0464  transcriptional regulator, MerR family  39.76 
 
 		 134 aa  42.4  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0133  MerR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 151 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3793  transcriptional regulator, MerR family  49.06 
 
 		 139 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>