88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 245 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  44.4 
 
 		 246 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  42.8 
 
 		 240 aa  161  1e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  41.53 
 
 		 252 aa  158  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  44.3 
 
 		 249 aa  157  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  41.6 
 
 		 246 aa  154  9e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  43.93 
 
 		 249 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  41.56 
 
 		 237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  39.83 
 
 		 244 aa  151  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 244 aa  151  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  37.83 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  44.39 
 
 		 225 aa  145  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  40.08 
 
 		 230 aa  143  3e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  41.91 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  38.02 
 
 		 248 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  37.55 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  37.61 
 
 		 247 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  38.63 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  38.3 
 
 		 238 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  36.09 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  41.2 
 
 		 236 aa  122  7e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  37.73 
 
 		 268 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  34.58 
 
 		 260 aa  117  9.999999999999999e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  35.81 
 
 		 258 aa  112  3e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  29.41 
 
 		 287 aa  109  4.0000000000000004e-23  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  38.69 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  33.92 
 
 		 262 aa  105  6e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 263 aa  104  1e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  53.85 
 
 		 313 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 271 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  56.76 
 
 		 422 aa  95.1  8e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  32.86 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  51.16 
 
 		 129 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 162 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 158 aa  45.4  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  33.78 
 
 		 157 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  35.14 
 
 		 157 aa  45.4  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  30.86 
 
 		 283 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  35.62 
 
 		 163 aa  45.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4315  MerR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 130 aa  45.4  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3393  transcriptional regulator, MerR family  39.19 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 229 aa  44.3  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  36.36 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  33.78 
 
 		 156 aa  43.9  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  33.78 
 
 		 157 aa  44.3  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02955  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  41.38 
 
 		 128 aa  43.9  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0202543  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  21.97 
 
 		 243 aa  43.9  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  32.88 
 
 		 171 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  32.88 
 
 		 171 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  32.88 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 171 aa  43.5  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  39.06 
 
 		 159 aa  43.5  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  55.26 
 
 		 138 aa  43.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  35.06 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2151  transcriptional regulator, MerR family  41.89 
 
 		 253 aa  43.1  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.447172 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.15 
 
 		 134 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02024  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  43.4 
 
 		 138 aa  43.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.675487  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.15 
 
 		 134 aa  42.7  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 159 aa  42.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  37.5 
 
 		 173 aa  42.7  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  46.15 
 
 		 144 aa  42.7  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  43.1 
 
 		 153 aa  42.7  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  38.36 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.11 
 
 		 154 aa  42.4  0.006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  36.62 
 
 		 144 aa  42.4  0.007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  36.62 
 
 		 141 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  36.62 
 
 		 141 aa  42.4  0.007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 130 aa  42.4  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 152 aa  42  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  41.56 
 
 		 134 aa  42  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 340 aa  42  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  44.9 
 
 		 150 aa  42  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 152 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  35.94 
 
 		 177 aa  42  0.009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 156 aa  42  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 125 aa  42  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 273 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  42.86 
 
 		 123 aa  42  0.009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  44.83 
 
 		 153 aa  41.6  0.01  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>