92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3490 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 268 aa  526  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  37.7 
 
 		 252 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  39.27 
 
 		 229 aa  142  7e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  39.22 
 
 		 244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  37.29 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 245 aa  137  3.0000000000000003e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  37.61 
 
 		 246 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  37.83 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  42 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 249 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  38.37 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  40.08 
 
 		 260 aa  125  7e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  35.74 
 
 		 262 aa  123  4e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 246 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  35.37 
 
 		 230 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  37.34 
 
 		 247 aa  118  9e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  35.93 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  39.39 
 
 		 237 aa  115  6e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  37 
 
 		 247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  36.73 
 
 		 264 aa  113  4.0000000000000004e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  38.86 
 
 		 246 aa  112  8.000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  35.5 
 
 		 238 aa  112  8.000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  38.17 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  34.84 
 
 		 236 aa  109  6e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  32.6 
 
 		 287 aa  107  3e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  36.09 
 
 		 271 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  56 
 
 		 422 aa  94.7  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  33.51 
 
 		 263 aa  92  9e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  42.96 
 
 		 313 aa  90.9  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 292 aa  62  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 273 aa  48.5  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2331  transcriptional regulator, MerR family  32.26 
 
 		 141 aa  47.4  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00979491  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0895  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 125 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0901  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 125 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0327374 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0912  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 125 aa  47  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  44.23 
 
 		 123 aa  45.4  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  47.17 
 
 		 129 aa  44.3  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3149  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 253 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3680  zinc-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3607  zinc-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0303153  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  52.78 
 
 		 173 aa  43.5  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4517  zinc-responsive transcriptional regulator  41.82 
 
 		 143 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00152846  hitchhiker  0.0000330659 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3724  zinc-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.299789  hitchhiker  0.00578388 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0080  transcriptional regulator, MerR family  38.89 
 
 		 137 aa  43.5  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.671013 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  25 
 
 		 229 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 176 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02170  predicted transcriptional regulator  48.84 
 
 		 133 aa  43.1  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  43.5  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 171 aa  43.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2740  MerR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3013  MerR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 295 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 171 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  43.5  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  44.19 
 
 		 154 aa  43.5  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0421  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3587  zinc-responsive transcriptional regulator  45.28 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.205456  normal  0.141164 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 176 aa  43.1  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0077  MerR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 391 aa  42.7  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3486  zinc-responsive transcriptional regulator  45.28 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0751902  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3775  zinc-responsive transcriptional regulator  45.28 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.02383  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03094  hypothetical protein  45.28 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03143  zinc-responsive transcriptional regulator  45.28 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  45.28 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0879681  hitchhiker  0.0000172555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0325  MerR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 147 aa  43.1  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.634832 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3678  zinc-responsive transcriptional regulator  45.28 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  34.41 
 
 		 164 aa  43.1  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3715  zinc-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.325937 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3608  zinc-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.260442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3778  zinc-responsive transcriptional regulator  38.71 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.508161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4614  zinc-responsive transcriptional regulator  45.28 
 
 		 141 aa  43.1  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000341039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 156 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 130 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  47.37 
 
 		 155 aa  42.7  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 155 aa  42.7  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1373  MerR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 159 aa  42.4  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.366441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0384  transcriptional regulator, MerR family  34.33 
 
 		 258 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0450143  decreased coverage  0.00634425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5140  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 147 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  33 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  42.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  45.24 
 
 		 153 aa  42.4  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5013  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 147 aa  42.4  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  44.44 
 
 		 157 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 151 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>