101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1301 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 263 aa  531  1e-150  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  47.21 
 
 		 258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  46.64 
 
 		 246 aa  183  3e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  43.78 
 
 		 264 aa  168  8e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  41 
 
 		 260 aa  158  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  38.55 
 
 		 252 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  38.56 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  40.53 
 
 		 244 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  40.5 
 
 		 237 aa  137  3.0000000000000003e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  36.86 
 
 		 246 aa  136  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  42.25 
 
 		 249 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  37.34 
 
 		 240 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 252 aa  133  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  37.27 
 
 		 247 aa  132  5e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  41.71 
 
 		 249 aa  130  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  39.42 
 
 		 246 aa  129  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  38.5 
 
 		 238 aa  125  5e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  37.29 
 
 		 247 aa  125  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  39.18 
 
 		 244 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  42.39 
 
 		 225 aa  123  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 218 aa  120  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  56 
 
 		 313 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  32.9 
 
 		 258 aa  116  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  35.53 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  37.62 
 
 		 236 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  37.44 
 
 		 230 aa  114  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  65.82 
 
 		 236 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  34.38 
 
 		 268 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  50.59 
 
 		 271 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  37.81 
 
 		 262 aa  94.7  1e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 229 aa  92  8e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  51.39 
 
 		 422 aa  89.4  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  44.74 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0494  zinc-responsive transcriptional regulator  42.67 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  38.82 
 
 		 176 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  38.82 
 
 		 171 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  38.82 
 
 		 176 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  38.82 
 
 		 171 aa  50.4  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  60.47 
 
 		 173 aa  50.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  48.5  0.00009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 151 aa  48.5  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  49.21 
 
 		 128 aa  48.5  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 152 aa  48.5  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  38.82 
 
 		 157 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 138 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  37.65 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 276 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7693  transcriptional regulator MerR family  33.07 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.56372  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  41.1 
 
 		 234 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  45.31 
 
 		 153 aa  47  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  37.65 
 
 		 159 aa  47  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  37.65 
 
 		 163 aa  46.6  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 158 aa  47  0.0004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2464  transcriptional regulator, MerR family  34.44 
 
 		 137 aa  46.6  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 158 aa  46.2  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0396  zinc-responsive transcriptional regulator  38.75 
 
 		 177 aa  45.8  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1771  transcriptional regulator, MerR family  49.15 
 
 		 151 aa  45.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13408  normal  0.537849 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2841  zinc-responsive transcriptional regulator  35.53 
 
 		 139 aa  45.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0481985  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  40.54 
 
 		 249 aa  45.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 149 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 138 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13367  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00208  zinc-responsive transcriptional regulator  36.84 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0297  zinc-responsive transcriptional regulator  57.89 
 
 		 159 aa  43.9  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  45.61 
 
 		 154 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  30.77 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2836  transcriptional regulator, MerR family  44.44 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.906455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  40.62 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  34.95 
 
 		 146 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1934  MerR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 142 aa  43.5  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.210113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  44.68 
 
 		 129 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  44.68 
 
 		 129 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 150 aa  43.5  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  55.26 
 
 		 155 aa  43.5  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  45.76 
 
 		 152 aa  43.9  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  37.88 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  35.53 
 
 		 135 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2470  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 138 aa  43.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  42.62 
 
 		 165 aa  43.1  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 269 aa  43.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0975  MerR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 130 aa  42.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0330797 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 156 aa  43.1  0.005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  43.86 
 
 		 138 aa  42.7  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 292 aa  42.7  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0295  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 149 aa  42.7  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5717  transcriptional regulator, MerR family  51.16 
 
 		 163 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  46.51 
 
 		 152 aa  42.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  40.35 
 
 		 269 aa  42.4  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.86 
 
 		 154 aa  42.4  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  46.51 
 
 		 152 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1474  MerR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 135 aa  42  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.70041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 147 aa  42.4  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10940  transcriptional regulator, MerR family  44.07 
 
 		 153 aa  42.4  0.009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.07291  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>