88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1225 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 245 aa  479  1e-134  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  62.07 
 
 		 246 aa  256  3e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  55.51 
 
 		 252 aa  250  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  48.74 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  54.69 
 
 		 225 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  58.16 
 
 		 249 aa  216  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  51.27 
 
 		 246 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  56.9 
 
 		 249 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  49.58 
 
 		 248 aa  212  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  49.37 
 
 		 247 aa  210  1e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 258 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  53.42 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  49.79 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  49.37 
 
 		 244 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 252 aa  202  4e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 		 238 aa  202  6e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  52.32 
 
 		 236 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  46.35 
 
 		 244 aa  195  7e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  43.43 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  47.84 
 
 		 247 aa  182  4.0000000000000006e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 271 aa  179  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  45.15 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  43.09 
 
 		 264 aa  169  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  43.78 
 
 		 236 aa  169  4e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  46.29 
 
 		 240 aa  168  8e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  45.02 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  42.8 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  43.67 
 
 		 260 aa  156  4e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  40.52 
 
 		 230 aa  151  7e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  41.87 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  40.96 
 
 		 263 aa  115  6e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 229 aa  111  9e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  66.22 
 
 		 422 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  30.18 
 
 		 287 aa  94.4  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  45.76 
 
 		 158 aa  52  0.000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 171 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 176 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 176 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 243 aa  49.7  0.00004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 171 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 157 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 157 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 163 aa  48.9  0.00006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0446  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 157 aa  49.3  0.00006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  41.67 
 
 		 156 aa  48.9  0.00007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 151 aa  48.5  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 156 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2536  regulatory protein MerR  31.25 
 
 		 111 aa  47.8  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 340 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 292 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 351 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  40 
 
 		 173 aa  45.4  0.0007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  25.44 
 
 		 243 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  47.73 
 
 		 135 aa  45.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 269 aa  44.7  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 340 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4678  MerR family transcriptional regulator  44.74 
 
 		 276 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.825044  normal  0.111013 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 117 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  48.84 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2323  putative transcriptional regulator MerR  47.73 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3411  zinc-responsive transcriptional regulator  38.33 
 
 		 158 aa  43.9  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2664  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.674524 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 255 aa  43.5  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 156 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2620  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2649  MerR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 159 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3408  zinc-responsive transcriptional regulator  36.67 
 
 		 171 aa  43.9  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  54.05 
 
 		 152 aa  43.1  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1395  MerR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 146 aa  42.7  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.686505  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 138 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0486  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 135 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04765  putative transcriptional regulator protein  32.47 
 
 		 109 aa  42.7  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.397475  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0028  transcriptional regulator, MerR family  51.28 
 
 		 143 aa  42.7  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.234521  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 162 aa  42.4  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  40 
 
 		 124 aa  42.4  0.007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1764  transcriptional regulator GlnR  39.68 
 
 		 123 aa  42.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.105299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0310  zinc-responsive transcriptional regulator  40.43 
 
 		 141 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.44406  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0608  zinc-responsive transcriptional regulator  40.43 
 
 		 144 aa  42  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000357731  normal  0.723537 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3888  zinc-responsive transcriptional regulator  40.43 
 
 		 141 aa  42  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00039361  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  39.39 
 
 		 129 aa  42  0.009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 146 aa  42  0.009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1008  transcriptional regulator, MerR family  35.59 
 
 		 110 aa  42  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>