83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5355 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 313 aa  582  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  47.4 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  45.08 
 
 		 244 aa  201  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 249 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  41.89 
 
 		 249 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  39.93 
 
 		 245 aa  152  8e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  39.19 
 
 		 247 aa  145  8.000000000000001e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  41.72 
 
 		 271 aa  145  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  37.88 
 
 		 246 aa  139  6e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  63.21 
 
 		 240 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  68.54 
 
 		 244 aa  123  4e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  68.54 
 
 		 248 aa  123  5e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 246 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  74.68 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  74.68 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  74.68 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  67.42 
 
 		 247 aa  119  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  56 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  63.04 
 
 		 236 aa  117  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  65.82 
 
 		 225 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  34.58 
 
 		 258 aa  113  5e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  56.12 
 
 		 218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  63.04 
 
 		 246 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  61.8 
 
 		 237 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  57.95 
 
 		 240 aa  106  6e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  59.77 
 
 		 238 aa  105  7e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  34.25 
 
 		 262 aa  105  8e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  65.38 
 
 		 238 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  36.4 
 
 		 422 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  56.67 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  61.54 
 
 		 260 aa  98.6  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  45.83 
 
 		 264 aa  96.7  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  58.33 
 
 		 230 aa  93.6  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  42.96 
 
 		 268 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  45.57 
 
 		 287 aa  87.4  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  44.05 
 
 		 229 aa  77.8  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 151 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 158 aa  54.3  0.000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 292 aa  50.1  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2543  MerR family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 128 aa  48.1  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.212021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 152 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 156 aa  47.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0531  transcriptional regulator, MerR family  43.04 
 
 		 155 aa  47.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  48 
 
 		 138 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  38.81 
 
 		 132 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2284  transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 		 215 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2489  putative transcriptional regulator, MerR family  38.71 
 
 		 162 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00633728 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2195  transcriptional regulator, MerR family  36.63 
 
 		 214 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 269 aa  46.2  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1662  MerR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 215 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.727696  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0157  MerR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 167 aa  45.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  46 
 
 		 138 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  37.7 
 
 		 269 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0667  transcriptional regulator, MerR family  35.44 
 
 		 249 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.201436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  39.34 
 
 		 171 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 149 aa  44.3  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02983  putative transcription regulator protein  41.43 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179274  normal  0.643629 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 150 aa  44.3  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4611  transcriptional regulator, MerR family  28.22 
 
 		 151 aa  44.3  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0408  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  43.75 
 
 		 153 aa  43.9  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.381542  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1026  MerR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 140 aa  44.3  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.120689  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1701  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 152 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.201474  normal  0.917872 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2009  transcriptional regulator, MerR family  42.37 
 
 		 152 aa  43.9  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2889  transcriptional regulator  32.84 
 
 		 137 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.359034  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1535  MerR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 137 aa  43.5  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.139036  normal  0.469721 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2087  MerR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 128 aa  43.5  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.545443  normal  0.539836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3670  MerR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 377 aa  43.5  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.87615  normal  0.0168483 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  36.11 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1260  transcriptional regulator  44.44 
 
 		 131 aa  43.1  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.332121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 129 aa  43.1  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  52.5 
 
 		 149 aa  43.1  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2686  MerR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 172 aa  42.7  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  38.81 
 
 		 129 aa  43.1  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  52.63 
 
 		 159 aa  42.7  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 143 aa  42.7  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 147 aa  42.7  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  39.47 
 
 		 254 aa  42.7  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1646  MerR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 133 aa  42.7  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4090  putative MerR/CueR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 137 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.849727  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1099  transcriptional regulator, MerR family  39.06 
 
 		 151 aa  42.4  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  41.18 
 
 		 128 aa  42.4  0.01  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>