More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4611 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4611  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 151 aa  301  2.0000000000000002e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 154 aa  57.4  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1391  putative transcriptional regulator, MerR family  39.02 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.345366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.29 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0162  MerR family transcriptional regulator  47.95 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 166 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5613  transcriptional regulator, MerR family  44.59 
 
 		 283 aa  53.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.395167  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  36.44 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 166 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0980  MerR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 243 aa  52.8  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1328  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  49.02 
 
 		 142 aa  52.4  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.185828  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2962  transcriptional regulator  51.92 
 
 		 126 aa  51.6  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  49.06 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3585  MerR family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 152 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00229473 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1854  MerR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 166 aa  50.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.674161  normal  0.0887351 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1394  MerR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 188 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1785  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.370686  normal  0.0498641 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6249  MerR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.256623  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1830  MerR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 166 aa  50.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00524998  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4057  transcriptional regulator, MerR family  33.62 
 
 		 111 aa  50.4  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1741  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 166 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0950545  normal  0.107699 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1823  transcriptional regulator, MerR family  36.7 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.8156  normal  0.10618 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0762  MerR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.111351 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2134  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.17623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8431  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2255  MerR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.198615  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0802  transcriptional regulator, MerR family  46.77 
 
 		 142 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 268 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2809  putative transcriptional regulator, MerR family  42.19 
 
 		 186 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1667  regulatory protein, MerR  44.83 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5131  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 166 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533425  normal  0.589756 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5545  MerR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 139 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.71393 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1967  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 141 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.775323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1548  MerR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 289 aa  49.3  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.556606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1768  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0178  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0926305  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1083  transcriptional regulator, MerR family  37.93 
 
 		 254 aa  48.9  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0124198  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4898  MerR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.627224  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2538  MerR family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 157 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2051  transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2421  Cd(II)/Pb(II)-responsive transcriptional regulator  44.83 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.732276  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2364  MerR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 188 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0143687  normal  0.157085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3161  MerR family transcriptional regulator  34 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.309754 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0047  MerR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 264 aa  48.9  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2538  transcriptional regulator, MerR family  47.06 
 
 		 147 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.329159  normal  0.129188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1443  MerR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278253  normal  0.0519631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1320  transcriptional regulator, MerR family  48.98 
 
 		 255 aa  48.5  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2241  MerR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.388969  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1974  transcriptional regulator, MerR family  43.94 
 
 		 283 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00000269645  unclonable  0.0000000367636 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1351  transcriptional regulator MerR family CueR domain protein  43.59 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2078  transcriptional regulator, MerR family  35.21 
 
 		 242 aa  48.1  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.696711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  43.4 
 
 		 259 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10060  Cu(I)-responsive transcriptional regulator, MerR family  43.55 
 
 		 138 aa  47.4  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198613  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0596  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.23 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1913  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  44.23 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0400556  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0339  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 253 aa  47.4  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5860  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2217  MerR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0749  transcriptional regulator, heavy metal-dependent  45.16 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0179  MerR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 136 aa  47  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1060  MerR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 134 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.089973  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0585  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.853287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4307  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 141 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00729055  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1150  transcriptional regulator, MerR family  48.33 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496019 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0499  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  35.71 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1630  MerR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4536  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 146 aa  47  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.228678  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2331  MerR family transcriptional regulator  51.02 
 
 		 153 aa  47  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0624  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0129  MerR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.684226 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9141  putative transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 138 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 136 aa  46.2  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2041  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  34.69 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00900822  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5500  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  43.55 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0747  MerR family transcriptional regulator  45.33 
 
 		 141 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 351 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4226  MerR family transcriptional regulator  35.79 
 
 		 150 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.795335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2462  TipAS antibiotic-recognition domain-containing protein  28.05 
 
 		 246 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63170  putative transcriptional regulator  43.55 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 351 aa  45.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0630  MerR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000318098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0745  aldo/keto reductase  47.27 
 
 		 449 aa  45.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2414  MerR family transcriptional regulator  28.05 
 
 		 246 aa  46.2  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  50 
 
 		 117 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0868  transcriptional regulator, MerR family  48.15 
 
 		 254 aa  45.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.915054 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  45.28 
 
 		 140 aa  46.2  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0535  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.438553  normal  0.258616 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4350  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 168 aa  45.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1678  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  43.4 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18550  predicted transcriptional regulator  38.1 
 
 		 244 aa  45.1  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>