47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3129 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 422 aa  793    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  47.69 
 
 		 240 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  68.92 
 
 		 238 aa  113  6e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  38.58 
 
 		 313 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  66.22 
 
 		 245 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  64.47 
 
 		 238 aa  110  5e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  64.86 
 
 		 237 aa  110  5e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  62.5 
 
 		 218 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  60 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 240 aa  108  1e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  63.51 
 
 		 246 aa  108  3e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  61.84 
 
 		 252 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  61.64 
 
 		 249 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  56.79 
 
 		 236 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  59.46 
 
 		 249 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  60.81 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 244 aa  102  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  56.76 
 
 		 225 aa  102  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  57.89 
 
 		 230 aa  102  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  64.86 
 
 		 247 aa  102  2e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  57.89 
 
 		 271 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 248 aa  100  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  53.16 
 
 		 258 aa  100  5e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 252 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 252 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  59.46 
 
 		 252 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  56.76 
 
 		 236 aa  97.8  3e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  46.3 
 
 		 262 aa  97.4  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 229 aa  97.4  4e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  58.11 
 
 		 247 aa  97.1  6e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  56 
 
 		 268 aa  96.7  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  56.16 
 
 		 260 aa  93.2  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  43.14 
 
 		 263 aa  90.5  5e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  52.7 
 
 		 246 aa  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  27.84 
 
 		 287 aa  89.7  9e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  42.61 
 
 		 258 aa  88.6  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  54.05 
 
 		 264 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 152 aa  47  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 		 154 aa  45.8  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 292 aa  46.6  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 151 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2814  transcriptional regulator, MerR family  41.77 
 
 		 138 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 158 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 156 aa  45.1  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0477  MerR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 173 aa  44.3  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2691  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  40.51 
 
 		 154 aa  43.5  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.455022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2155  transcriptional regulator, MerR family  26.83 
 
 		 167 aa  43.5  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000155365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>