54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2725 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 238 aa  466  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  52.56 
 
 		 245 aa  209  3e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  47.3 
 
 		 252 aa  191  6e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 258 aa  182  4.0000000000000006e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  43.23 
 
 		 240 aa  180  2e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  46.55 
 
 		 244 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  47.58 
 
 		 247 aa  174  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  41.53 
 
 		 252 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  50.74 
 
 		 225 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  47.86 
 
 		 246 aa  171  9e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  47.19 
 
 		 249 aa  171  9e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 249 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 248 aa  170  1e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 218 aa  170  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  47.83 
 
 		 246 aa  167  9e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  45.3 
 
 		 240 aa  167  9e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  45.85 
 
 		 238 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  40.91 
 
 		 247 aa  165  5e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  46.18 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  47.84 
 
 		 237 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  44.81 
 
 		 264 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  48.75 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  44.09 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  42.22 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  42.4 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  41.33 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  40.43 
 
 		 262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  37.45 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  37.72 
 
 		 268 aa  136  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  41.42 
 
 		 263 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  68.92 
 
 		 422 aa  112  4.0000000000000004e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  58.59 
 
 		 313 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  24.19 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 151 aa  51.2  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 158 aa  49.3  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  51.52 
 
 		 131 aa  47.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3207  putative transcriptional regulator, MerR family  34.07 
 
 		 143 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.789074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 292 aa  43.1  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  21.84 
 
 		 243 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2026  putative transcriptional regulator, MerR family  34.52 
 
 		 123 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.108228 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0844  transcriptional regulator, MerR family  33.78 
 
 		 113 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.592334  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  21.59 
 
 		 250 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 136 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  43.18 
 
 		 135 aa  42.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1095  MerR family transcriptional regulator  53.66 
 
 		 138 aa  42.4  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 		 157 aa  42  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0822  transcriptional regulator, MerR family  27.74 
 
 		 327 aa  41.6  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.528612  normal  0.372171 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2524  transcriptional regulator, MerR family  47.22 
 
 		 298 aa  42  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0506467  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  42.55 
 
 		 157 aa  41.6  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>