288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2524 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2524  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 
298 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0506467  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1137  transcriptional regulator  29.91 
 
 
395 aa  58.9  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000736319  hitchhiker  0.00587761 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2165  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
343 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7238  putative transcriptional regulator, MerR family  33.7 
 
 
122 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2298  MerR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
343 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5312  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 
117 aa  57.4  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04340  predicted transcriptional regulator  29.47 
 
 
245 aa  56.2  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0117  transcriptional regulator, MerR family  30.84 
 
 
138 aa  56.2  0.0000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2107  regulatory protein, MerR:Albicidin resistance  34.25 
 
 
342 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.814054  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5050  putative transcriptional regulator, MerR family  32.39 
 
 
131 aa  55.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.999579  normal  0.135086 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4509  transcriptional regulator, MerR family  31.37 
 
 
129 aa  55.1  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125189 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1517  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
342 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2211  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
166 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.132223  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1366  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
166 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0373128  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2377  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
166 aa  53.5  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1127  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
166 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0247655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0041  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
166 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.21109  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1856  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
166 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.424581  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2249  MerR family transcriptional regulator  28.85 
 
 
166 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6337  MerR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
342 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1742  MerR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
342 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1357  MerR family transcriptional regulator  32.39 
 
 
342 aa  52.8  0.000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.744828  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1755  MerR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
342 aa  52.8  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.581641  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0420  transcriptional regulator, MerR family  30.69 
 
 
255 aa  52.8  0.000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 
129 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00354  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  30.85 
 
 
136 aa  52.8  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.784451  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5038  MerR family transcriptional regulator  27.48 
 
 
342 aa  52.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.99192 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2262  MerR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
150 aa  52  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.142473  normal  0.0766241 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2216  MerR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
166 aa  51.6  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.741024  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23560  transcriptional regulator, MerR family  29.2 
 
 
138 aa  52  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.346447  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  30.56 
 
 
129 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0331  putative transcriptional activator tipA  30.36 
 
 
249 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.275925  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4949  putative transcriptional regulator, MerR family  30.3 
 
 
147 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0118636  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4023  MerR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
127 aa  51.6  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1663  MerR family transcriptional regulator  30.95 
 
 
343 aa  50.8  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.350781  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1930  MerR family transcriptional regulator  31.07 
 
 
123 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.127523  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0427  MerR family transcriptional regulator  33.04 
 
 
129 aa  50.8  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2794  MerR family transcriptional regulator  34.33 
 
 
181 aa  50.8  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6549  transcriptional regulator, MerR family  28.83 
 
 
128 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.135068  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1798  regulatory protein, MerR  31.93 
 
 
118 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0455207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0264  MerR family transcriptional regulator  26.19 
 
 
173 aa  50.4  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829201  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3996  MerR family transcriptional regulator  34.29 
 
 
143 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  32.73 
 
 
155 aa  50.1  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  27.72 
 
 
259 aa  50.1  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25610  predicted transcriptional regulator  28.57 
 
 
129 aa  49.7  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3026  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  36.49 
 
 
139 aa  49.7  0.00006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1663  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 
343 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
351 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
340 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5066  MerR family transcriptional regulator  25.29 
 
 
340 aa  49.7  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1777  MerR family transcriptional regulator  31.37 
 
 
145 aa  49.7  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
351 aa  49.7  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5275  MerR family transcriptional regulator  23.01 
 
 
253 aa  49.7  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3164  MerR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
139 aa  49.3  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7842  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 
149 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1266  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  33.64 
 
 
139 aa  49.3  0.00007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0668949 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  30.53 
 
 
129 aa  49.7  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1222  transcriptional regulator, MerR family  33.33 
 
 
254 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.867665  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1062  regulatory protein, MerR  27.62 
 
 
112 aa  48.9  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06140  predicted transcriptional regulator  29.09 
 
 
129 aa  48.9  0.00009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3841  MerR family transcriptional regulator  30.1 
 
 
123 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0548  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.12 
 
 
138 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1255  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.31 
 
 
130 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2024  mercuric resistance operon regulatory protein MerR  31.31 
 
 
130 aa  48.9  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5020  MerR family transcriptional regulator  23.01 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4848  MerR family transcriptional regulator  23.01 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4862  MerR family transcriptional regulator  23.01 
 
 
254 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5400  MerR family transcriptional regulator  22.61 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5255  transcriptional regulator, MerR family  22.61 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5331  transcriptional regulator, MerR family  22.61 
 
 
253 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
149 aa  48.9  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5668  transcriptional regulator, MerR family  22.81 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2357  MerR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
136 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.120567 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4537  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  32.32 
 
 
132 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1758  MerR family transcriptional regulator  23.44 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000235386 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0563  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.12 
 
 
138 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.620757  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0963  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.87 
 
 
136 aa  48.1  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.55262  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6606  MerR family transcriptional regulator  28.83 
 
 
142 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0607  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.12 
 
 
138 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  30.91 
 
 
149 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24080  transcriptional regulator, MerR family  34.72 
 
 
140 aa  47.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2202  MerR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
158 aa  47.8  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0546  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.12 
 
 
138 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4962  MerR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29010  MerR family transcriptional regulator  32.86 
 
 
162 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000144199 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1187  transcriptional regulator, MerR family  32.14 
 
 
129 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.796306 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0553  DNA-binding transcriptional regulator CueR  26.12 
 
 
138 aa  48.1  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.985745  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2198  MerR family transcriptional regulator  26.36 
 
 
135 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1655  MerR family transcriptional regulator  29.79 
 
 
237 aa  47.4  0.0003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.112658  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0029  transcriptional regulator, MerR family  31.48 
 
 
134 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1151  MerR family transcriptional regulator  33.68 
 
 
133 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.100669  hitchhiker  0.000000311334 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3072  MerR family transcriptional regulator  31.82 
 
 
341 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4426  putative transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 
135 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911048 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00394  putative Zn(II)-responsive transcriptional regulator, regulates Zn export (MerR family) protein  27 
 
 
144 aa  47.8  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5640  transcriptional regulator, MerR family  30.88 
 
 
334 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1362  transcriptional regulator  34.85 
 
 
136 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.270977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1617  putative transcriptional regulator, MerR family  31.82 
 
 
252 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22770  predicted transcriptional regulator  30.86 
 
 
284 aa  47.4  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1919  MerR family transcriptional regulator  24.75 
 
 
268 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0931546  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1808  transcriptional regulator, MerR family  34.18 
 
 
131 aa  47.8  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.306071  normal  0.126025 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>