123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2712 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  100 
 
 		 246 aa  488  1e-137  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  61.76 
 
 		 245 aa  267  1e-70  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  51.81 
 
 		 252 aa  231  6e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  48.48 
 
 		 244 aa  214  9e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  50.43 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  49.58 
 
 		 240 aa  204  9e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  49.57 
 
 		 258 aa  204  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  47.52 
 
 		 247 aa  202  3e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 248 aa  199  3e-50  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  50.85 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  48.07 
 
 		 244 aa  193  2e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 252 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 252 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 252 aa  191  6e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  48.75 
 
 		 225 aa  192  6e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  43.33 
 
 		 218 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  50.62 
 
 		 236 aa  185  7e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  50.43 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  50.43 
 
 		 249 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 240 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  46.75 
 
 		 247 aa  182  5.0000000000000004e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  49.12 
 
 		 238 aa  181  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  50.22 
 
 		 271 aa  174  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  45.89 
 
 		 238 aa  169  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  44.21 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  42.56 
 
 		 236 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  40.52 
 
 		 230 aa  158  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  43.35 
 
 		 264 aa  155  8e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  42.06 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  41.81 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  37.84 
 
 		 313 aa  139  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  37.04 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  37.24 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 262 aa  116  3e-25  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 229 aa  112  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  60.81 
 
 		 422 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  27.59 
 
 		 287 aa  90.1  3e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 158 aa  55.8  0.0000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1534  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 182 aa  50.4  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1504  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 166 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2847  transcriptional regulator, MerR family  40.74 
 
 		 169 aa  49.7  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.444422  hitchhiker  0.0000160217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1498  MerR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 163 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1687  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 129 aa  48.1  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2909  MerR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 292 aa  47.8  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2655  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 129 aa  48.5  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 156 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2762  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 129 aa  47.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4386  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 340 aa  47.4  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5067  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 351 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.424066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5793  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 351 aa  47  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.998817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6009  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 129 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.241161  normal  0.0668881 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7157  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 129 aa  47  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.267404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1572  transcriptional regulator, MerR family  55.56 
 
 		 128 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0194  transcriptional regulator, MerR family  29.27 
 
 		 252 aa  45.8  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0801  transcriptional regulator, MerR family  38.98 
 
 		 164 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.851922 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2760  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  29.17 
 
 		 135 aa  45.4  0.0008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2307  Cu(I)-responsive transcriptional regulator  37.31 
 
 		 132 aa  45.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0478  regulatory protein MerR  38.71 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.608919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2496  transcriptional regulator, MerR family  32.89 
 
 		 259 aa  45.4  0.0009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2588  MerR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 129 aa  45.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0158199 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2343  MerR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 146 aa  44.7  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4137  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 138 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1645  regulatory protein, MerR  40 
 
 		 154 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0841182  normal  0.942746 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1407  MerR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 133 aa  44.7  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6360  transcriptional regulator, MerR family  26.09 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.241077  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3662  transcriptional regulator, MerR family  35.56 
 
 		 150 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.293998  normal  0.202254 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3653  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 234 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.885436  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3495  MerR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 133 aa  44.3  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.444785 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2371  MerR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 168 aa  43.9  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00484931  normal  0.175809 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2240  transcriptional regulator  29.23 
 
 		 125 aa  44.3  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2352  MerR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 152 aa  44.3  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2453  transcriptional regulator, MerR family  47.73 
 
 		 155 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000100878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1647  MerR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 97 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.760593 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0433  zinc-responsive transcriptional regulator  50 
 
 		 173 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  24.45 
 
 		 229 aa  43.5  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2278  MerR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 273 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.408305  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4049  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2835  MerR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 97 aa  43.5  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0730655  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3790  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 132 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0361759  normal  0.548118 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4066  MerR family transcriptional regulator  39.29 
 
 		 132 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 151 aa  43.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4039  MerR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 130 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.576602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10880  predicted transcriptional regulator  32.39 
 
 		 145 aa  43.1  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009008  RSP_7395  MerR family transcriptional regulator  42 
 
 		 138 aa  43.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1816  transcriptional regulator, MerR family  37.29 
 
 		 164 aa  43.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2059  transcriptional regulator, MerR family  34.09 
 
 		 145 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.477962 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2918  transcriptional regulator, MerR family  41.38 
 
 		 154 aa  43.1  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.247446  normal  0.104462 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4528  transcriptional regulator, MerR family  45.45 
 
 		 129 aa  43.1  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.355526 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2718  transcriptional regulator, MerR family  42.65 
 
 		 150 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.654055  hitchhiker  0.0000347436 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4834  transcriptional regulator, MerR family  38.1 
 
 		 144 aa  43.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.300455  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5668  transcriptional regulator, MerR family  30.67 
 
 		 146 aa  42.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3892  MerR family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 149 aa  42.7  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00526993  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  39.58 
 
 		 157 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  42.22 
 
 		 157 aa  42.7  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  42.22 
 
 		 176 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  41.3 
 
 		 156 aa  43.1  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  42.22 
 
 		 171 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3486  transcriptional regulator, MerR family  32.05 
 
 		 135 aa  42.7  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  42.22 
 
 		 176 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  42.22 
 
 		 171 aa  42.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>