59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4996 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 271 aa  513  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  72.49 
 
 		 258 aa  353  1e-96  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1225  MerR family transcriptional regulator  52.32 
 
 		 245 aa  207  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.786651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2712  regulatory protein, MerR  50.22 
 
 		 246 aa  193  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120713  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4003  putative transcriptional regulator, MerR family  52.63 
 
 		 225 aa  190  2e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.875778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22580  predicted transcriptional regulator  48.55 
 
 		 252 aa  189  5e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.476391  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  52.59 
 
 		 249 aa  178  8e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2519  MerR family transcriptional regulator  52.86 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.94441  hitchhiker  0.00949223 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  46.47 
 
 		 246 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3095  putative transcriptional regulator, MerR family  50.65 
 
 		 237 aa  172  5.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.66482  normal  0.0110703 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2338  transcriptional regulator, MerR family  45.85 
 
 		 244 aa  172  6.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 218 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2774  regulatory protein MerR  41.74 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.251108  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13840  predicted transcriptional regulator  47.19 
 
 		 247 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2725  transcriptional regulator, MerR family  47.92 
 
 		 238 aa  165  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2843  MerR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2887  MerR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.654736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2874  MerR family transcriptional regulator  41.2 
 
 		 252 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3401  MerR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 248 aa  160  2e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144453  normal  0.535635 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2433  transcriptional regulator, MerR family  48.7 
 
 		 236 aa  155  7e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000601373  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3134  MerR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0691359 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1885  transcriptional regulator, MerR family  43.75 
 
 		 246 aa  151  8e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.036584 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11858  hypothetical protein  41.13 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.554166 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  44.4 
 
 		 238 aa  145  5e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  40.91 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5355  transcriptional regulator, MerR family  39.31 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1739  transcriptional regulator, MerR family  40.99 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2101  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.878958 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  38.86 
 
 		 230 aa  128  9.000000000000001e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3490  transcriptional regulator, MerR family  36.47 
 
 		 268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0478654 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  36.75 
 
 		 236 aa  120  3e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1126  transcriptional regulator, MerR family  33.64 
 
 		 262 aa  103  4e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3129  transcriptional regulator, MerR family  57.89 
 
 		 422 aa  99.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1301  transcriptional regulator, MerR family  35 
 
 		 263 aa  98.2  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.814813 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1433  MerR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0281208  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  52.44 
 
 		 287 aa  92.8  5e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 229 aa  53.1  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0144  MerR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 158 aa  48.9  0.00009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 243 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4357  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 269 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00580847 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0954  MerR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 146 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0450773  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2818  transcriptional regulator, MerR family  31.46 
 
 		 171 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000370461  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1752  glutamine synthetase transcriptional regulator  52.78 
 
 		 124 aa  43.9  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000396501  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4027  transcriptional regulator, MerR family  41.07 
 
 		 269 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  29.78 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3746  MerR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 151 aa  43.5  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4431  transcriptional regulator, MerR family  31.51 
 
 		 160 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.290243  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  34.12 
 
 		 165 aa  42.7  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3972  MerR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 149 aa  42.7  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 144 aa  42.7  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1825  hypothetical protein  31.13 
 
 		 448 aa  42.7  0.007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2116  transcriptional regulator, MerR family  44.19 
 
 		 133 aa  42.7  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2129  MerR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 150 aa  42.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.802398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2276  MerR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 184 aa  42.4  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101998  hitchhiker  0.00000024461 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16670  putative transcriptional regulator CadR  44.83 
 
 		 156 aa  42.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1835  hypothetical protein  31.13 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0704752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1189  MerR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 156 aa  42.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2165  MerR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 156 aa  42.4  0.009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0369388  normal  0.524788 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>