37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1596 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1596  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 237 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  33.04 
 
 		 249 aa  96.7  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 229 aa  80.9  0.00000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 242 aa  80.1  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  46.15 
 
 		 243 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2613  transcriptional regulator, MerR family  28.18 
 
 		 207 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00726257 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15530  predicted transcriptional regulator  31.75 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4009  transcriptional regulator, MerR family  28.83 
 
 		 246 aa  48.9  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.57553  normal  0.107591 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2904  transcriptional regulator  38.71 
 
 		 207 aa  48.9  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1388  transcriptional regulator, MerR family  38.24 
 
 		 221 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.902771  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18270  predicted transcriptional regulator  30.23 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0754  transcriptional regulator, MerR family  27.27 
 
 		 287 aa  47.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00066154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  34.83 
 
 		 142 aa  46.2  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2692  regulatory protein, MerR  44.64 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0457116  normal  0.169515 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3466  transcriptional regulator, MerR family  37.65 
 
 		 210 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0193337  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1415  transcriptional regulator, MerR family  38.67 
 
 		 143 aa  45.4  0.0007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000599633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 288 aa  45.4  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1469  MerR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 258 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0887109 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05650  predicted transcriptional regulator  39.13 
 
 		 217 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2381  regulatory protein, MerR  30.99 
 
 		 249 aa  44.7  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.426132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0210  putative transcriptional regulator, MerR family  44.83 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.024863  hitchhiker  0.00385009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14960  predicted transcriptional regulator  32.62 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0208149  normal  0.635485 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1748  transcriptional regulator, MerR family  36.59 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.17422  normal  0.0209835 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4996  MerR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 271 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1547  transcriptional regulator, MerR family  42.86 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1494  redox-sensitive transcriptional activator SoxR  38.3 
 
 		 165 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.163233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1542  MerR family transcriptional regulator  25.62 
 
 		 240 aa  43.5  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.598972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3005  MerR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 144 aa  43.5  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44472  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1479  MerR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.342575  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2399  transcriptional regulator, MerR family  46.43 
 
 		 209 aa  43.1  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000000562399  decreased coverage  0.00011903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0115  Hg(II)-responsive transcriptional regulator  40.98 
 
 		 132 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.889131  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1694  MerR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 218 aa  42.7  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0331871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1543  transcriptional regulator, MerR family  26.25 
 
 		 238 aa  42.4  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000825086 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23510  predicted transcriptional regulator  34.62 
 
 		 138 aa  42.4  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.719058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0686  transcriptional regulator, MerR family  28.85 
 
 		 363 aa  42  0.007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.162378  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>